利用可记录条形码的克隆谱系追踪揭示前列腺癌转移的迁移历史

title: “利用可记录条形码的克隆谱系追踪揭示前列腺癌转移的迁移历史” author: Ryan N. Serio, Armin Scheben, *Billy Lu, *Domenic V. Gargiulo, Lucrezia Patruno, Caroline L. Buckholtz, Ryan J. Chaffee, Megan C. Jibilian, Steven G. Persaud, Stephen J. Staklinski, Rebecca Hassett, Lise M. Brault, Daniele Ramazzotti, Christopher E. Barbieri, Adam C. Siepel, #, Dawid G. Nowak journal: C...

多区域非小细胞肺癌患者衍生异种移植模型中基因组水平瘤内肿瘤异质性的表现

多区域非小细胞肺癌患者衍生异种移植模型中基因组水平瘤内肿瘤异质性的表现 学术背景与研究动机 患者衍生异种移植(Patient-Derived Xenograft,PDX)模型在癌症研究中被广泛应用。PDX模型通过将人类肿瘤移植到免疫缺陷小鼠体内进行繁殖。因此,PDX模型被认为比传统的细胞系更能模拟肿瘤的生物学特性,它们保留了体内细胞-细胞间和/或细胞-基质间的相互作用、三维结构及其较新的衍生特性。很多研究显示,PDX模型的药物反应与患者个体或患者群体的药物反应一致,这使得PDX模型被用于个体化医学和临床前药物试验中,成为癌症生物学的重要模型。 然而,PDX模型的基因组保真度(Fidelity)对于其在临床前肿瘤学应用中的重要性不言而喻。其中一个关键问题是这些模型在基因层面上能否准确反映原发肿...

区域性细胞外基质瓦解和神经侵犯在胰腺癌中的肿瘤生物学基础

区域性细胞外基质瓦解和神经侵犯在胰腺癌中的肿瘤生物学基础 背景介绍 胰腺导管腺癌(Pancreatic Ductal Adenocarcinoma,PDAC)是最具侵袭性的癌症类型之一,其通常与高度纤维化的基质相关,基质可能占肿瘤质量的90%左右。尽管形态学异质性在常规病理报告中并未涉及,但其具有预后意义,指示潜在的肿瘤生物学。PDAC肿瘤内异质性在分子水平上通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示了基因表达程序的多样性,且高表达异质性与较差的总体生存期相关。这提示肿瘤细胞的异质性可能使其快速适应治疗,或选择出具有侵略性和治疗抵抗性的肿瘤细胞。 然而,scRNA-seq并没有阐明基因表达程序与形态学模式之间的关系,限制了我们对与形态学异质性相关的分子电路的理解。为弥合这一知识鸿沟,本研...