Test de référence des outils de notation des ensembles de gènes pour les données scATAC-seq Auteurs : Xi Wang, Qiwei Lian, Haoyu Dong, Shuo Xu, Yaru Su, Xiaohui Wu Affiliations : Pasteurien College (École de médecine de Suzhou, Université de Suzhou), Département d’automatisation de l’Université de Xiamen, École de mathématiques et d’informatique de...
Évolution moléculaire des séquences protéiques et de l’utilisation des codons du virus de la variole du singe Contexte de recherche L’épidémie de virus de la variole du singe (Monkeypox virus, MPXV) en 2022 a suscité une grande attention mondiale en matière de santé publique. Cependant, les mécanismes d’évolution du virus de la variole du singe ne ...
Les données multi-omiques révèlent l’influence du butyrate de sodium sur l’expression génique et la modification des protéines chez les Streptomyces Contexte académique Les Streptomyces attirent une grande attention en raison de leurs riches groupes de gènes et de leur potentiel à produire une grande quantité de produits naturels. Les inhibiteurs d...
Le cancer est un problème de santé publique majeur au niveau mondial, dont le processus pathologique complexe et les manifestations diverses ont toujours été un sujet d’étude important. De nombreuses recherches ont montré que le déséquilibre acido-basique joue un rôle crucial dans l’apparition et le développement du cancer, mais les mécanismes sous...
Grepore-seq : un flux de travail robuste pour détecter les changements post-édition génique par PCR à longue portée et séquençage nanopore Contexte de la recherche Le système CRISPR/Cas9, en tant que système d’endonucléase ADN guidé par ARN, a été largement utilisé dans l’édition génomique. Avec l’augmentation continue de son potentiel dans les tra...
Comparaison entre SaCas9 et SpCas9 pour une haute fidélité et différents résultats d’édition génique Contexte de la recherche Les systèmes CRISPR basés sur la protéine Cas9 sont devenus des outils puissants pour l’édition génomique, largement utilisés dans la recherche fondamentale et la thérapie génique clinique. Actuellement, les variantes de Cas...
Sensibilité élevée du séquençage métagénomique à haut débit dans les biopsies de tissus coliques : élimination de l’impact de l’ADN de l’hôte Contexte L’évaluation de la structure taxonomique bactérienne par des techniques de séquençage de nouvelle génération sans culture est devenue une méthode courante pour étudier la relation entre le déséquilib...
Caractéristiques globales et analyse transcriptomique de l’érythropoïèse terminale dans le foie fœtal humain Contexte et problématique L’érythropoïèse est le processus de production des globules rouges. Initialement, l’érythropoïèse “primitive” se produit dans le sac vitellin, puis est progressivement remplacée par l’érythropoïèse “terminale” dans ...
Une nouvelle étude sur la lactylation des protéines et la régulation métabolique révèle de nouveaux aspects de la biologie de Toxoplasma gondii Contexte : Toxoplasma gondii est un parasite protozoaire présent dans le monde entier, infectant plus de 30% de la population humaine. T. gondii provoque la toxoplasmose, une zoonose largement répandue. Ce ...
La métagénomique fonctionnelle basée sur les séquences révèle une nouvelle diversité naturelle des gènes COPA fonctionnels dans les microbiomes environnementaux La diversité naturelle des gènes/protéines fonctionnels dans les microbiomes environnementaux est une composante importante de la recherche en évolution et en bio-ingénierie. Afin d’approfo...