オープンソースツール MRQA を使用して解決する MRI プロトコルの不遵守の普遍的な問題

MRQA:MRIプロトコル非適合の広範な問題を解決するためのツール 背景紹介 近年、大規模神経画像データセットは、脳と行動の関係を研究する上で極めて重要な役割を果たしています。例えば、アルツハイマー病神経画像計画(ADNI)、ヒトコネクトームプロジェクト(HCP)、および青年脳認知発達(ABCD)研究などがあります。これらのデータセットは、通常複数のサイトや異なるスキャナーモデルで収集されます。しかし、サイト間や機器間でのデータ収集には、イメージングパラメータの一貫性の欠如という重大な問題があります。このパラメータの不一致はデータ品質に深刻な影響を及ぼし、信号対雑音比(SNR)および統計的効力を低下させ、研究結果を無効にする可能性さえあります。 従来、MRIスキャンプロトコルの一貫性を確保す...

アルツハイマー病の画像分類のためのベイジアンテンソルモデリング

ベイズテンソルモデルに基づくアルツハイマー病の画像分類 はじめに 神経画像学研究は現代の神経科学の重要な部分であり、我々の脳構造と機能への理解を大いに豊かにしました。これらの非侵襲的なビジュアライゼーション技術を通じて、研究者は特定の神経および精神疾患のリスクをより正確に予測し、早期段階での介入と治療を行うことができるため、患者の健康と生活の質を改善することができます。特にアルツハイマー病(Alzheimer’s Disease、以下AD)の研究において、神経画像学は貴重な病理メカニズムの洞察を提供し、病状の進行を追跡し、早期症状を識別し、他の認知症の原因を区別することができます。 しかし、神経画像データの処理には、データの空間依存性、高次元性およびノイズなど複数の重大な課題があり、適切な神...

PEDアルゴリズムを用いた自閉症スペクトラム障害の診断バイオマーカーの特定

PEDアルゴリズムを用いた自閉症スペクトラム障害の診断バイオマーカーの特定

PEDアルゴリズムを用いた自閉スペクトラム症の診断バイオマーカーの識別 神経情報科学の領域では、自閉スペクトラム症(ASD)の研究は主に脳領域間の双方向接続関係に焦点を当てており、脳領域の高次相互作用異常にはあまり触れられていません。脳領域の複雑な関係を探るため、著者らは部分エントロピー分解(Partial Entropy Decomposition, PED)アルゴリズムを採用し、三つの脳領域(トリオード)の高次相互依存性を計算することで高次相互作用を捉えました。本論文では、PEDと代替検証法に基づく方法を提案し、単一の脳領域が三重脳領域に及ぼす影響を検証し、重要な三重脳領域を見つけました。さらに、超グラフモジュール最適化アルゴリズムを用いて高次脳構造を明らかにし、ASDでは右脳と左脳の接...

T1画像における脳組織分割のための強化空間ファジィC-均値アルゴリズム

脳組織分割のための強化型スペーシャルファジィC平均アルゴリズム研究報告 学術背景 磁気共鳴画像(MRI)は神経学において重要な役割を果たしており、特に脳組織の正確な分割において顕著です。正確な組織分割は脳損傷や神経変性疾患の診断にとって不可欠です。MRIデータの分割は、同様の強度、テクスチャ、および均一性を持つ異なる領域に画像を分割することを伴います。これは医学画像解析における重要なタスクです。特に、脳白質(White Matter, WM)、灰質(Gray Matter, GM)、および脳脊髄液(Cerebrospinal Fluid, CSF)などの脳組織の区別において、正確な組織分割と病変の分離は、医療専門家が脳損傷および神経変性疾患を診断する能力を大幅に向上させることができます。 し...

DataLadを用いた研究データ管理の教育:数年にわたる複数分野の取り組み

科学研究データ管理教育の多年にわたる多分野の取り組み 研究背景 現代神経科学の発展に伴い、研究データ管理(Research Data Management, RDM)は科学者にとって不可欠なスキルとなっています。しかし、研究データ管理の重要性にもかかわらず、これらの技術スキルは分野特化の大学院教育においてしばしば無視されがちです。そのため、ますます多くのコミュニティは、組織されたトレーニングの機会や自己学習材料を提供し、初期の研究者がこの知識とスキルを習得するのを支援しています。 マサチューセッツ工科大学(MIT)の「the missing semester of your cs education」は、この教育不足の一例です。さらに、現代のコンピュータとアプリケーションの高可用性は、ユーザ...

MRIO: 磁気共鳴画像取得および分析オントロジー

MRIO: 磁気共鳴画像取得および分析オントロジー

MRIO: 磁気共鳴イメージング取得および分析オントロジー 磁気共鳴イメージング(MRI)は、非侵襲的に組織の内部構造を三次元的に可視化するための生物医学的イメージング技術です。MRIは人間の脳の構造と機能の研究に広く用いられ、神経系疾患の診断においても強力なツールです。しかし、MRIデータを効果的に管理および分析する方法は常に課題となっています。この課題に対処するために、Alexander Bartnik らは「MRIO」と呼ばれる磁気共鳴イメージング取得および分析オントロジーを開発しました。 研究背景 MRI技術は、人体内部の画像を非侵襲的に取得できるため、臨床および研究において広く使用されています。臨床では、MRIは神経疾患の診断に用いられ、病変の位置と程度を評価して治療の指針を提供し...

オンラインと対面の交差点における実践的神経情報学教育:Neurohackademyからの教訓

Neurohackademy:オンラインとオフラインを組み合わせた神経情報学の教育 背景紹介 近年、人類神経科学はビッグデータの時代に突入しています。人類コネクトーム計画(Human Connectome Project)、青少年脳認知発達(ABCD)研究などのプロジェクトのおかげで、科学者たちは以前には想像もできなかった規模と範囲のデータセットを取得することが可能となりました。これらのデータセットは基礎および臨床研究において重要な科学的潜在力を持っています。しかし、これらのデータセットは研究者に対して新たな挑戦ももたらしています。データの生成、処理、アクセス、分析、理解などがその一例です。特に大きな課題として、「ビッグデータスキルギャップ」と呼ばれるものがあります。これらのデータセットを活...

Pound–Drever–Hallフィードフォワード:フィードバックを超えたレーザー位相雑音の抑制

特集報道:Pound–Drever–Hall前方フィード技術:フィードバックを超えるレーザー位相ノイズ抑制 著者: Yu-Xin Chao, Zhen-Xing Hua, Xin-Hui Liang, Zong-Pei Yue, Li You, Meng Khoon Tey 機関: 低次元量子物理国家重点実験室、物理学部、清華大学、北京、中国 ジャーナル: Optica 公開日: 2024年7月9日 DOIリンク: ここをクリック 一、研究背景 過去数十年間、超安定光学参考キャビティにロックされた狭線幅レーザーの出現は、重力波検出、光学時計、超低ノイズ光子マイクロ波生成、高忠実度の原子量子ビット制御、超冷分子のコヒーレント合成、暗黒物質及び基本定数の変化の探査など、革新的な技術の先駆けとなり...

780 nmでの超狭線幅ハイブリッド集積セルフインジェクションロックレーザー

超狭帯域混合集成自己注入ロック式780nmレーザーに関する研究報告 研究背景 現代科学技術において、狭帯域レーザーは多様な用途で非常に重要な役割を果たしています。これには、古典的および量子センシング、イオン捕捉系、位置測定/ナビゲーション/タイミングシステム、オプティカルクロック、マイクロ波周波数合成器などが含まれます。特に可視光および近赤外光スペクトル範囲における低ノイズレーザーは、量子計算、センシング、原子時計に使用されるレーザービームの束縛および冷却技術のために重要です。本研究では、780nmの動作波長で混合集成された狭帯域レーザーを示し、105Hzの自己異なり帯域幅を実現しました。この研究は、Hzレベルの狭帯域レーザー技術の実現可能性を示すだけでなく、将来の探求のための基礎も築いてい...

直接レーザー書き込みによって製造された低損失ファイバー結合体積インターコネクト

背景紹介 光子統合回路(PICs)は、高速データ伝送を実現するために重要な意味を持っています。しかし、従来の光子統合回路は単一平面または少数の重ね合わせられた平面だけを使用していたため、光信号のルーティングは制限されていました。さらに、実際の応用では、結合損失をできるだけ低減する必要があります。現在の光子統合回路は、主に平面製造技術によって構築され、シリコン絶縁体(SOI)、シリコン窒化物(SiN)、リチウムナイオベート絶縁体(LNOI)などの材料が含まれています。しかし、これらの方法は、光路結合損失が高かったり、3D自由経路の光路が複雑で実現が難しかったりする問題にしばしば直面します。 これらの制限を克服するために、研究チームは、新しい製造方法として、光線曝露によって制御される屈折率(SC...