インシリコ飽和変異原性によるクローン造血ドライバーミューテーションの同定

引言 健康な造血過程では、一群の造血幹細胞(Hematopoietic Stem Cells、略してHSC)が血液関連のすべての系統に貢献します。しかし、年齢が上がるにつれて、この過程はしばしばクローン性造血(Clonal Hematopoiesis、略してCH)を引き起こし、特定のHSCクローンの拡張により多くの血細胞や血小板が占められます。このクローン拡張現象は、生命過程でHSCが獲得する体細胞変異によって駆動され、高齢者において高度に一般的です。CHに関連する遺伝子変異はHSCに成長の優位性を与え、造血過程で正の選択を受けます(1-13)。近年、多くの研究がCHが血液悪性腫瘍の発症、心血管疾患、全死因死亡率、実体腫瘍、および感染症のリスク増加と関連していることを示しています(2, 7,...

英国バイオバンクにおける自殺未遂の行動および生理的リスク要因の特定

研究背景: 自殺は世界的な公衆衛生の課題であるが、行動的要因と生理的要因と自殺未遂(suicide attempts,SA)との関係には依然として多くの不確実性が存在する。これまでの研究は、うつ病のような精神疾患、絶望感のような人格や心理的特徴、低い社会的支援や生活のストレスといった社会的および家庭の要因など、限られた仮説に集中していた。このような狭い視点は、他のリスク要因を見逃す可能性がある。これらの研究空白を埋めるため、本研究チームは大規模な系統的分析およびメンデルランダム化分析を実施し、イギリス生物銀行データセットでSAに関連する可能性のある行動および生理的リスク要因を特定した。 研究来源: この論文は以下の研究者による著作である:Bei Zhang、Jia You、Edmund T....

単一サンプルの腫瘍サブクローン再構築のクラウドソースベンチマーク

群体リソースに基づく単一サンプル腫瘍サブクローン再構築アルゴリズム 背景紹介 癌の進化過程と腫瘍の遺伝的異質性は、現代腫瘍学研究の重要な分野です。腫瘍は正常細胞から進化し、体細胞変異を獲得することで徐々に発展します。これらの変異は細胞クロマチン構造や内因性及び外因性の誘変圧力の影響を受け、確率的に発生します。特定の変異が細胞に選択的優位性を提供すると、その子孫細胞は局所環境で拡大することができます。長年の蓄積を経て、最終的に多くの癌の特性を持つ細胞集団、すなわちクローンが形成されます。異なる腫瘍細胞亜群(サブクローン)は、ドリフトまたは選択圧力を通じて細胞集団内に出現します。この進化的特徴は臨床上重要であり、遺伝的異質性は予後不良、変異の多さ、耐薬性に関連しています。そのため、腫瘍の進化過程...

brainlife.io: 神経科学研究をサポートする分散型オープンソースクラウドプラットフォーム

学術論文:brainlife.io:神経科学研究を支える分散化とオープンソースのクラウドプラットフォーム 背景と動機 神経科学研究は急速に発展しており、データの標準化、管理、処理ツールの向上により、研究がより厳密で透明になっています。しかし、これにより複雑なデータパイプラインが生じ、”FAIR”原則(Findable, Accessible, Interoperable, Reusable、日本語で「見つけやすさ、アクセス可能性、相互運用性、再利用可能性」)の実現に向けた潜在的な障壁が増加しています。従来、神経画像学に関する一部の研究は単一の実験室内で行うことが可能でしたが、現在では数百時間のデータ測定が必要で、複数の参加者、実験室、データモデルを跨ぐ必要があります。 データの背景 本論文で...

予測エラー処理と予想情報のシャープ化

予測エラー処理と予想情報のシャープ化

科学報告 背景紹介 感知と神経処理における感覚情報は、事前の期待に大きく影響される。感知は単なる受動的な受信ではなく、過去の経験と現在の状況に基づいた事前情報と現有の感覚情報を統合する積極的な推論プロセスである。この情報の統合方式は異なるメカニズムで表現されることがある。一つは異常入力に焦点を当てた予測誤差信号処理(Prediction Error、略称PE)、もう一つは予測情報の強化を通じて実現する鋭化表示である。本稿では、顔認識におけるこれら二つのメカニズムの表現について研究した。 研究の出典 この研究はドイツ・ハンブルク大学医療センター(University Medical Center Hamburg-Eppendorf)システム神経科学科のAnnika GarlichsとHelen...

マイクロステートと再発定量分析を使用するGRU-CNNモデルによる聴覚注意検出

総説と報告:微状態とリカースクエンティアル分析に基づくGRU-CNNモデルの聴覚注意検出への応用 背景と研究動機 注意力は一種の認知能力として感知過程において重要な役割を果たしており、人間が複雑な環境の中で特定の対象に集中し、他の干渉を無視するのを助ける。本論文は聴覚注意検出(Auditory Attention Detection, AAD)に関する研究であり、複数チャンネルの脳波(EEG)信号を通じて、聴者が目標話者に集中する過程で異なる動態特性を抽出し、競争的な話者が存在する場合でも効果的に聴覚注意を検出することを目指している。 論文の出典と著者情報 本論文はMohammadreza Eskandarinasab、Zahra Raeisi、Reza Ahmadi Lashaki、および...

ディープラーニングモデルによるセマンティック飽和のメカニズムの解明

ディープラーニングモデルによるセマンティック飽和のメカニズムの解明

ディープラーニングモデルが意味飽和メカニズムを解明 意味飽和(semantic satiation)は、ある単語やフレーズが何度も繰り返されることでその意味が失われる現象であり、よく知られた心理学的現象です。しかし、このメカニズムを引き起こす微視的な神経計算の原理は依然として未知です。本稿では、連続結合ニューラルネットワーク(continuous coupled neural network, CCNN)を使用してディープラーニングモデルを構築し、意味飽和のメカニズムを研究し、ニューロンの成分でこのプロセスを正確に記述します。研究結果は、中観的な視点から見ると、意味飽和は自下から上へのプロセスである可能性があり、既存のマクロな心理学研究が意味飽和を自上から下へのプロセスと見なしているのとは異...

ヒト頂縁回における単一ニューロンによる内部言語の表現

《Internal Speech Representation by Single Neurons in Human Supramarginal Gyrus》科学報告 背景紹介 近年、ブレイン・マシン・インターフェース(BMIs, Brain-Machine Interfaces)技術は音声デコード分野で顕著な進展を遂げています。BMIsは脳信号を音声またはオーディオ出力に変換し、病気や損傷のために話す能力を失った人々が再びコミュニケーションできるようにします。しかし、有声音声、試みの音声、模擬音声デコードにおいて重要な進展があったにもかかわらず、内在言語(internal speech)のデコード研究は相対的に希少であり、機能性も低いです。本論文は内在言語デコードの過程における課題を解決す...

パーキンソン病における全脳の1/f指数の地形図

パーキンソン病における全脳の1/f指数の地形図

パーキンソン病における全脳1/f指数のトポロジカルマップ 著者: Pascal Helson、Daniel Lundqvist、Per Svenningsson、Mikkel C. Vinding、Arvind Kumar 研究の背景 パーキンソン病(Parkinson’s Disease, PD)は進行性で衰弱を伴う脳の疾患であり、主に運動障害を特徴としますが、知覚と認知処理にも影響を及ぼします。症状の広範さと多くの神経伝達物質(例:ドーパミン)の脳内広範な投射のため、多くの脳領域がPDに影響されます。病気に関連する全脳神経ニューロン機能の変化を特徴付けるため、本研究ではPD患者と健康対照者の静止状態の磁気脳図(Magnetoencephalogram, MEG)を分析しました。 従来のス...

k-emophone: 実験中の感情、ストレス、および注意ラベルを含むモバイルおよびウェアラブルデータセット

科学データレポート | K-emophone: 場所特定の感情、ストレス、注意力ラベルを含むモバイルおよびウェアラブルデータセット 背景紹介 低コストのモバイルおよびウェアラブルセンサーの普及に伴い、多くの研究がこれらのデバイスを利用して人間の精神的健康、生産性、行動パターンを追跡および分析しています。しかし、これまでのところ、実験室環境で収集されたデータセットは発展してきた一方で、実世界のシナリオで収集された感情、ストレス、注意力などのラベルを含むデータセットが不足しており、感情計算(Affective Computing)および人間とコンピュータのインタラクション(Human-computer Interaction)分野の研究進展を制限しています。 研究の出所 本研究は、Soowon ...