Analyse combinée de la transcriptomique unicellulaire et spatiale révèle l’hétérogénéité cellulaire de la voie Hedgehog dans le cancer gastrique Contexte académique Le cancer gastrique (Gastric Cancer, GC) est l’une des tumeurs malignes les plus courantes dans le monde, avec des taux d’incidence et de mortalité élevés. Malgré les progrès réalisés d...
Contexte académique La régénération hépatique est un processus biologique complexe impliquant la coordination de divers types cellulaires et voies de signalisation. Après une résection partielle du foie, le tissu hépatique restant restaure sa fonction et sa masse grâce à une série de proliférations cellulaires et de réponses immunitaires finement r...
Analyse automatisée de l’ultrastructure : étude basée sur la microscopie électronique hyperspectrale à grande échelle Contexte académique La microscopie électronique (Electron Microscopy, EM) est une technique clé pour étudier l’ultrastructure biologique, permettant de révéler les structures fines des cellules à une résolution moléculaire. Ces dern...
Contexte académique et problématique Les mitochondries, organites essentiels des cellules eucaryotes, jouent un rôle crucial dans le métabolisme énergétique, la signalisation cellulaire, ainsi que dans la régulation de la survie et de la mort cellulaire. Les dysfonctionnements mitochondriaux sont associés à de nombreuses maladies humaines, notammen...
La coloration KMnO₄/Pb sans uranium permet l’imagerie des architectures tissulaires en microscopie électronique à balayage sous vide faible Contexte académique La microscopie électronique (Electron Microscopy, EM) est l’un des outils les plus puissants pour étudier les ultrastructures cellulaires et tissulaires. Cependant, les méthodes traditionnel...
La topologie des fibres de nucléosomes guide la liaison des facteurs de transcription aux enhancers Contexte académique L’identité cellulaire repose sur l’action concertée de multiples facteurs de transcription (Transcription Factors, TFs) qui se lient ensemble aux enhancers des gènes spécifiques à un type cellulaire. Bien que les TFs reconnaissent...
Horloges transcriptomiques spatiales révèlent les effets de proximité cellulaire dans le vieillissement cérébral Contexte académique Avec l’âge, le déclin des fonctions cognitives et le risque de maladies neurodégénératives augmentent de manière significative. Le vieillissement cérébral est un processus complexe accompagné de nombreux changements c...
Contexte académique et problématique Dans la recherche sur le cancer, l’amplification génique (gene amplification) est une forme courante de mutation, jouant un rôle clé dans l’activation des oncogènes. Cependant, bien que l’importance de l’amplification génique dans le cancer soit largement reconnue, la modélisation précise de ces amplifications d...
Modèle in vitro du développement du tronc des vertébrés Contexte académique Le développement du tronc des vertébrés est un processus hautement coordonné impliquant la génération et l’organisation de multiples types cellulaires. Ce processus est orchestré par des populations de cellules progénitrices situées dans la région postérieure de l’embryon, ...
La technologie d’édition génétique CRISPR-Cas9 a fait des progrès significatifs dans le traitement du cancer, en particulier dans le développement des cellules T à récepteur d’antigène chimérique (CAR-T). Cependant, les anomalies chromosomiques potentielles induites par l’édition CRISPR, telles que les grandes délétions, les translocations chromoso...