Étude sur l’association entre la rapidité de l’analyse génomique intégrée dans le traitement de précision de l’oncologie et les choix thérapeutiques et résultats pour les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules avancé

Introduction

Le cancer du poumon non à petites cellules avancé (advanced non–small-cell lung cancer, ANSCLC), étant une tumeur maligne à haute létalité, ses options thérapeutiques influent directement sur la survie globale des patients. Ainsi, le rôle des biomarqueurs moléculaires dans le choix du traitement devient de plus en plus important, et la génomique est devenue une composante essentielle des options thérapeutiques de première ligne (1L) et de deuxième ligne (2L). Pour les patients porteurs de gènes de conduite cancéreuse (comme la délétion/mutation courante dans l’exon 19/exon 21 de l’EGFR, BRAF V600E, saut de l’exon 14 de MET, ainsi que des gènes de fusion ALK, ROS1, RET et NTRK), le traitement ciblé contre ces gènes de conduite a été approuvé pour le traitement de 1L. En outre, des découvertes comme la mutation KRAS G12C, l’insertion de l’exon 20 de l’EGFR et les mutations de HER2 ont également induit des approbations pour le traitement de 2L. Cependant, une détection biomarqueur rapide et complète est cruciale pour déterminer les opportunités de traitement ciblé.

Actuellement, de nombreux patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules avancé ne reçoivent toujours pas les résultats de l’analyse génomique intégrée (comprehensive genomic profiling, CGP) en temps opportun. Alors que des patients sans détection génomique autre que l’immunohistochimie PD-L1 peuvent orienter leurs choix de traitement 1L via CGP, peu de patients obtiennent des résultats de CGP en temps voulu. Cet article examine, dans ce contexte, l’impact des résultats rapides de CGP sur les choix thérapeutiques et les résultats pour les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules avancé.

Sources de l’étude

Cette recherche a été rédigée par Jeff Yorio, MD, Katherine T. Lofgren, PhD, Jessica K. Lee, MS, Khaled Tolba, MD, Geoffrey R. Oxnard, MD, Alexa B. Schrock, PhD, Richard S.P. Huang, MD, et Lorraine Brisbin, MS, et publiée dans le Journal of Clinical Oncology Precision Oncology. Le DOI de l’article est https://doi.org/10.1200/po.23.00292.

Méthodes de l’étude

Conception et processus de l’étude

Cette étude a utilisé des données du monde réel des bases de données cliniques génomiques (CGDB) de Flatiron Health (FH) et Foundation Medicine (FMI), en analysant les données des patients provenant d’environ 280 cliniques de cancérologie américaines (environ 800 points de traitement). L’ensemble de l’étude comprend 2694 patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules avancé ayant reçu un traitement 1L entre mai 2017 et septembre 2022, ces patients ayant reçu des tests de CGP de tissus par FMI et ayant été traités dans le réseau FH.

Cette étude a analysé rétrospectivement les dossiers de santé électroniques (EHR) des patients, en les liant aux données génomiques des tests CGP de FMI via un appariement dépersonnalisé et déterministe. Les échantillons prélevés pour l’étude proviennent de tissus appropriés, l’ADN est capturé par un séquençage à haut niveau de précision (>550x) couvrant 315 ou 324 gènes liés au cancer et certains introns de 28 ou 36 gènes.

Collecte de données et procédures expérimentales

L’étude comprend deux étapes principales : d’abord l’analyse génomique via les tests de CGP de FMI, et ensuite la classification et la statistique des choix thérapeutiques 1L. Dans le test de CGP, l’ADN est extrait de sections de 40 microns de tissus inclus en paraffine fixés au formol (FFPE) puis analysé pour des substitutions de base, des insertions/suppressions courtes, des variations de nombre de copies et des réarrangements, calculant la charge mutationnelle du tumor (TMB). Ensuite, l’expression de PD-L1 est évaluée par immunohistochimie (IHC).

Les traitements 1L ont été divisés en traitements de précision ou empiriques. Les traitements de précision incluent la thérapie ciblée contre les mutations géniques et les inhibiteurs de checkpoint immunitaires (ICPI) précis, incluant des mutations géniques comme l’EGFR, le BRAF, le KRAS, etc. Les traitements empiriques ne tiennent pas compte des résultats moléculaires ou génomiques, se concentrant essentiellement sur la chimiothérapie ou la chimiothérapie combinée avec ICPI.

Analyse statistique

L’analyse de survie utilise la méthode de Kaplan-Meier ainsi que des modèles de risques proportionnels de Cox. L’étude définit la survie globale réelle (RWOS) et le temps réel jusqu’à l’arrêt du traitement (RWTTD).

Résultats de l’étude

Principales découvertes

L’étude montre que par rapport aux patients qui n’ont pas reçu les résultats des tests CGP en temps opportun au début du traitement 1L, les patients ayant reçu ces résultats rapidement montrent une augmentation significative dans l’utilisation de la thérapie ciblée et de la thérapie ICPI de précision (augmentation de 14 points de pourcentage). De même, les patients ALK/EGFR/RET/ROS1 positifs ont une réduction de 31 points de pourcentage dans l’utilisation inefficace de la thérapie ICPI. En outre, les patients ayant obtenu les résultats des tests CGP en temps voulu ont également montré des avantages en termes de temps réel jusqu’à l’arrêt du traitement (médiane de 10 mois contre 3,9 mois) et de coûts de traitement (réduction de $13,659.37 par patient ALK/EGFR/RET/ROS1 positif).

Cependant, pour la survie globale réelle (médiane de 32 mois vs 29 mois), les différences entre les deux groupes de patients ne montrent pas de signification statistique.

Explication détaillée des données clés

Les résultats de l’étude sont présentés à travers divers graphiques et tableaux de données, clarifiant l’association entre les choix thérapeutiques et la rapidité des tests CGP. Par exemple, parmi les patients ayant reçu les résultats du CGP avant le traitement 1L (n = 1666), 35% ont reçu un traitement de précision ; alors que parmi les patients ayant reçu les résultats du CGP après le traitement (n = 1028), seulement 6,7% ont reçu un traitement de précision, 90% recevant un traitement empirique.

Parmi les patients qui ont commencé un traitement 1L sans résultats précis, 11% ont révélé des mutations géniques potentiellement ciblables, y compris KRAS G12C (11%) et mutations EGFR (5,4%).

Conclusion

La réalisation opportune d’une analyse génomique intégrée (CGP) a un impact significatif sur l’amélioration de la qualité de traitement et l’efficacité des coûts pour les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules avancé. Cette étude souligne l’importance d’obtenir des informations génomiques complètes lors du choix du traitement 1L, montrant que la CGP rapide est associée à un temps d’arrêt de traitement plus long et à une réduction des coûts liés à des thérapies ICPI inefficaces. Bien que les différences en termes de survie globale réelle ne soient pas significatives, la valeur clinique de la CGP dans le guidage des choix de traitement 1L ne doit pas être négligée.

Importance de l’étude

Cette étude démontre le rôle indispensable de l’analyse génomique dans le traitement du cancer du poumon non à petites cellules avancé, soulignant l’importance de la CGP rapide pour les décisions thérapeutiques et le pronostic des patients, soutenant l’intégration de l’analyse génomique complète dans les traitements standards pour obtenir une oncologie de précision plus efficace. Les conclusions de cette étude sont d’une grande valeur de référence pour les stratégies futures de traitement du cancer et l’élaboration de politiques.