基于三种TLS相关基因的口腔鳞状细胞癌预后模型的识别与验证

研究报告:基于TLS相关基因构建的口腔鳞状细胞癌预后模型的验证与分析 背景与研究动机 口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)是头颈部鳞状细胞癌(Head and Neck Squamous Cell Carcinoma,HNSCC)中最常见的亚型,具备高度的淋巴结转移倾向,尤其易于向颈部淋巴结扩散。根据2022年全球癌症观测报告(GCO),OSCC的新发病例数约为38万,其中因该疾病死亡的人数接近18.8万。GCO预计该病的发病率与死亡率到2040年仍将持续增长。目前,OSCC患者的预后主要通过评估肿瘤尺寸、淋巴结状况及远处转移情况来判断,即TNM分期系统。然而,即使处于相同TNM分期的患者,其预后差异显著,这反映出TNM分期在捕捉OSCC的免疫...

颈部转移性淋巴结的自动分割方法:基于纵向MRI的自蒸馏掩码图像transformer

颈部转移性淋巴结的自动分割方法:基于纵向MRI的自蒸馏掩码图像transformer

自蒸馏的掩码图像transformer在纵向MRI中的潜力——自动分割颈部淋巴结转移 报告介绍 在肿瘤放疗中,自动分割技术承诺提升速度并降低手工分割带来的读者间差异。在放射肿瘤学临床实践中,精确快速的肿瘤分割对于患者的个性化治疗至关重要。Ramesh Paudyal等来自Memorial Sloan Kettering Cancer Center的研究人员开展了这一项研究,旨在实现并评估“屏蔽图像变压器”(masked image modeling using vision transformers,即SMIT)算法在口咽部鳞状细胞癌患者的纵向T2加权MRI图像中的颈部淋巴结转移的自动分割精度。 这篇论文发表在《BJR|Artificial Intelligence》2024年第1期。这项研...

基于知识蒸馏的轻量级卷积神经网络用于无创胶质瘤分级

非侵入性胶质瘤分级研究综述:基于知识蒸馏的轻量级卷积神经网络 背景介绍 胶质瘤是中枢神经系统的主要肿瘤,早期检测非常重要。世界卫生组织(WHO)将胶质瘤分为Ⅰ至Ⅳ级,Ⅰ和Ⅱ级为低级胶质瘤(LGG),Ⅲ和Ⅳ级为高级胶质瘤(HGG)。准确分类胶质瘤对于生存率评估至关重要。 磁共振成像(MRI)是医学领域诊断和治疗胶质瘤的常用方法。目前,许多学者应用机器学习和深度学习方法进行胶质瘤分类。例如,Zacharaki等人成功应用支持向量机(SVM)算法在MRI图像中分类胶质瘤。而Fatemeh等人采用卷积神经网络(CNN)对MRI图像中的胶质瘤进行分类。遗憾的是,这些研究多集中在提高分类精度,但高参数的CNN架构难以在实际医疗环境中应用。此外,由于胶质瘤数据集较小,他们只能使用具有较少参数的CNN,因而...

基于注意力引导的卷积神经网络框架用于3D MRI扫描的胶质瘤分割和分级

注意引导的CNN框架用于3D MRI扫描的胶质瘤分割和评级研究 胶质瘤是人类最致命的脑肿瘤形式,及时诊断这些肿瘤是有效肿瘤治疗的重要一步。磁共振成像(MRI)通常提供对脑部病变的无创检查。然而,手动检查MRI扫描中的肿瘤需要大量时间,并且容易出错。因此,自动诊断肿瘤在胶质瘤的临床管理和外科干预中起着至关重要的作用。在这项研究中,我们提出了一个基于卷积神经网络(CNN)的框架,用于从3D MRI扫描中无创分级肿瘤。 背景介绍 胶质瘤是常见且致命的脑肿瘤,根据其侵袭性和恶性程度可以分为四级。低级别肿瘤(I-III级)通常较不具侵袭性且对治疗反应较好。然而,高级别肿瘤(IV级)具有高度侵袭性,例如胶质母细胞瘤,其治疗效果较差,仅有5%的患者能存活5年。 为了使用医疗影像开展胶质瘤的研究,研究者通常...

基于卷积神经网络的耐药癫痫早期预测

研究背景及研究目的 癫痫是一种自发性且严重的神经系统疾病,表现为反复发作,全球有大约5000万人受其影响[1]。尽管近年来抗癫痫药物(ASM)的发展有所进步,药物难治性癫痫(Drug-Resistant Epilepsy,DRE)仍影响着20%到30%的癫痫患者[1-3]。DRE患者不仅面临巨大的经济、社会和心理负担,但需长时间的药物试验才能确诊。早期识别高风险患者,可以为施行如癫痫手术、神经调控或生酮饮食等治疗方式提供更早的干预。 以往的研究已指出DRE的风险因素包括:早期发病、高频率发作、脑电图(EEG)异常、神经缺陷、认知障碍、创伤史和颅内结构病变等[5-9]。然而,对于新诊断的癫痫患者,这些因素的重要性尚不明确,因此需要综合工具来早期识别高风险患者。 脑电图在癫痫领域扮演着不可或缺的...

DeepSleepNet: 基于原始单通道EEG的自动睡眠分期模型

深度睡眠网络:基于单通道EEG的自动睡眠阶段评分模型 背景介绍 睡眠对于人体健康具有重要影响,监测人们的睡眠质量在医学研究和实践中至关重要。通常,睡眠专家通过分析多种生理信号(如脑电图 (EEG)、眼动电图 (EOG)、肌电图 (EMG) 和心电图 (ECG))进行睡眠阶段评分。这些信号被称为多导睡眠图 (Polysomnogram, PSG),经分类后用于确定个体的睡眠状态。然而,这种手动方法耗时且费力,需要专家持续数夜对多个传感器进行记录并分析。 基于多信号(如EEG、EOG和EMG)或单信号EEG的自动睡眠阶段评分方法已得到广泛研究。然而,大多数现有方法依赖于手工特征提取,这通常根据数据集的特性进行设计,无法推广到具有异质性的更大人群中。此外,较少方法考虑了用于识别睡眠阶段转换规则的时...

具有注意力机制的时间依赖学习卷积神经网络在运动想象脑电解码中的应用

MI-EEG解码中基于注意力机制的时间依赖学习卷积神经网络(CNN) 研究背景与问题描述 脑机接口(Brain-Computer Interface, BCI)系统提供了一种通过实时翻译大脑信号与计算机进行通信的新途径。近年来,BCI技术逐渐在为瘫痪患者提供辅助和预防性护理方面发挥了重要作用。现有的许多BCI系统依赖于非侵入性且相对便捷的脑电图(EEG)信号记录来追踪大脑活动。然而,即使在同一MI任务期间,不同时期产生不同MI相关模式的时间依赖性特性也往往被忽略,从而大大限制了MI-EEG解码性能。 论文来源与作者信息 论文《A Temporal Dependency Learning CNN with Attention Mechanism for MI-EEG Decoding》于202...

多特征注意力卷积神经网络用于运动想象解码

脑机接口(Brain-Computer Interface, BCI)是将神经系统与外部环境连接的一种通讯手段。运动想象(Motor Imagery, MI)是BCI研究的基石,它指在运动执行前的内在演练(Internal Rehearsal)。非侵入性技术如脑电图(Electroencephalography, EEG)因其成本效益高与便利性,可以高时间分辨率记录神经活动。当受试者想象移动身体特定部位时,大脑特定区域会发生能量变化(ERD/ERS),这些变化可以通过EEG记录并用于辨别运动意图。MI基础的BCI系统已经取得显著进展,能够控制外骨骼和光标,特别是与虚拟现实技术结合,用于中风康复的潜力更为显著。 目前,MI解码方法的高性能是这种系统成功的关键。然而,相比于依赖外部刺激的其它BC...

基于注意力的双尺度融合卷积神经网络用于运动想象脑机接口

基于注意力的双尺度融合卷积神经网络用于运动想象脑机接口

脑机接口(Brain-Computer Interface, BCI)作为一种新增强通信与控制技术近年来逐渐崭露头角。基于电生理特征(如脑电图,EEG)的BCI中,运动想象(Motor Imagery, MI)是一个重要分支,通过解码用户的运动意图用于临床康复、智能轮椅控制、及光标控制等领域。然而,由于EEG信号的复杂性,如低信噪比(Signal-to-Noise Ratio, SNR)、非平稳性、低空间分辨率和高时间分辨率等特点,准确解码运动意图仍具有挑战性。现有的MI基BCI解码主要使用传统机器学习和深度学习方法。传统机器学习通常分为特征提取和特征分类两个独立步骤,方法包括快速傅里叶变换(Fast Fourier Transform, FFT)、通用空间模式(Common Spatial...

基于CNN的新型图像分割流水线用于个体化猫脊髓刺激建模

基于卷积神经网络(CNN)的图像分割流程用于个体化猫脊髓刺激建模 背景与研究动机 脊髓刺激(Spinal Cord Stimulation, SCS)是一种被广泛应用于慢性疼痛管理的治疗方法。近年来,它也被用于调节神经活动,旨在恢复失去的自主或感知运动功能。个性化的建模和治疗计划是确保SCS安全有效的重要方面。然而,生成所需细节和准确性水平的脊柱模型需要耗时且劳动密集的手工图像分割,由人类专家进行。因此,迫切需要自动化分割算法,以便在数据有限的情况下也能生成高质量的解剖模型。 论文来源 本文由Alessandro Fasse、Taylor Newton、Lucy Liang、Uzoma Agbor、Cecelia Rowland、Niels Kuster、Robert Gaunt、Elvir...