自己増幅型RNAワクチンによるD68型エンテロウイルス感染および疾患の予防に関する臨床モデルにおける研究 1. 背景 近年、新興感染症への迅速な対応とワクチン開発が注目されています。特に新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の出現により、RNAワクチン技術の研究が急速に進展しました。しかし、現在のRNAワクチンの大半はエンベロープウイルスを標的としており、非エンベロープウイルスに対する経路はまだ明確ではありません。D68型エンテロウイルス（EV-D68）は非エンベロープウイルスで、近年深刻な呼吸器感染症や神経症状、特に急性弛緩性脊髄炎（AFM）の増加傾向を引き起こしており、重要な研究対象となっています。そのため、本研究は自己増幅型RNA（RepRNA）ワクチンを用いてEV-D68感染と疾...
全ゲノムシーケンシングにより明らかになったチュウカチョウザメの自家八倍体とその進化の道筋 背景紹介 チュウカチョウザメ（Acipenser sinensis）は、チョウザメ亜綱の一員として、古代の魚類グループに属しています。その独特のゲノム構造と経済的価値により、チュウカチョウザメの保護と研究は重要な意義を持っています。チョウザメ類は「生きた化石」と呼ばれ、複雑な全ゲノム重複（Whole-Genome Duplication、WGD）イベントを持っており、その倍数性の進化を理解することは魚類の進化研究に重要な洞察を提供します。これまでの研究では、チョウザメ類に二倍体、四倍体、八倍体などの多倍体現象が存在することが示されています。WGDは魚類の進化において非常に一般的ですが、チュウカチョウザメ...
サル痘ウイルスのタンパク質配列とコドン使用の分子進化 研究背景 2022年のサル痘ウイルス（Monkeypox virus, MPXV）の流行は、世界的な公衆衛生に大きな注目を集めました。しかし、サル痘ウイルスの進化メカニズムはまだ完全には解明されていません。サル痘ウイルスは、線状二本鎖DNAウイルスで、ポックスウイルス科（Poxviridae）、コルドポックスウイルス亜科（Chordopoxvirinae）、オルソポックスウイルス属（Orthopoxvirus）に属します。そのゲノムは約197 kbで、約200の遺伝子をコードしています。サル痘ウイルスは、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類など多くの動物に感染することができます。天然痘ウイルス（Variola virus, VARV）や牛痘ウイル...
マルチオミクスデータによる酪酸ナトリウムのストレプトマイセス遺伝子発現とタンパク質修飾への影響 学術的背景 ストレプトマイセスは豊富な遺伝子クラスターと多数の天然物を生産する可能性があることから、広く注目されています。ヒストン脱アセチル化酵素（HDAC）阻害剤は真菌のヒストン修飾において重要な役割を果たしていますが、原核生物における役割はほとんど知られていません。特にストレプトマイセスにおいて、これらの阻害剤が二次代謝産物の生合成に影響を与えるかどうかは研究に値する問題です。現代の生物情報学の発展により、ストレプトマイセスから多数の抗生物質生合成遺伝子クラスター（BGCs）が発見されましたが、実験室での培養条件下では、これらの遺伝子クラスターの大部分はサイレント状態にあり、多様な生物活性産物...
大腸組織生検における高感度メタゲノムシーケンシング：宿主DNAの除去の影響 背景 次世代シーケンシング技術を用いて培養条件なしでバクテリアの分類構造を評価することは、細菌の不均衡とさまざまな疾患との関係を研究するための一般的な方法となっています。これまでの研究では、16S rRNA遺伝子アンプリコンまたはメタゲノムシーケンシングを用いて、ヒトの口腔、腸粘膜、糞便サンプルの微生物叢スペクトルを分析してきました。しかし、16S rRNA遺伝子シーケンシングは分類識別の解像度に限界があるのに対し、メタゲノムシーケンシングは種や亜種レベルのバクテリアを識別することができます。さらに、メタゲノムシーケンシングは複数の領域にわたるデータを提供し、複数のドメインにまたがる相互作用を推測することができます。...
タンパク質のラクチル化と代謝調節の研究がトキソプラズマ・ゴンディの生物学の新領域を明らかにする 背景紹介： トキソプラズマ・ゴンディ（Toxoplasma gondii）は、世界中に分布する原生動物の寄生虫で、人口の30%以上に感染しています。トキソプラズマは、広く蔓延している人獣共通感染症であるトキソプラズマ症（toxoplasmosis）を引き起こします。この寄生虫は複雑な生活環を持ち、有性および無性段階を含み、主に終宿主である猫科動物と中間宿主（温血動物）の組織に存在します。トキソプラズマは、免疫力の低下した個体や発育中の胎児に重度または致命的な症状を引き起こす可能性があります。アジスロマイシン、ピリメタミン、スピラマイシンなどの既存の治療薬はトキソプラズマの一部の活動を抑制しますが、...
配列に基づく機能メタゲノミクスが環境マイクロバイオームにおける機能的COPA遺伝子の新しい自然多様性を明らかにした 環境マイクロバイオームにおける機能遺伝子/タンパク質の自然多様性は、進化および生物工学研究の重要な構成要素です。銅(Cu)耐性遺伝子COPAの世界的な微生物における多様性をより深く理解するために、本研究では配列ベースの機能メタゲノミクスアプローチを採用しました。この研究は、メタゲノムアセンブリ技術、ローカルBLAST、進化的トレース分析(ETA)、化学合成、および従来の機能ゲノミクスを組み合わせただけでなく、環境DNA(eDNA)からCOPA遺伝子の多様性を効率的に掘り起こすことに成功しました。 研究背景 微生物の進化過程で多様な機能遺伝子/タンパク質が生み出され、これらの遺伝...
微生物代謝産物によるHIF-2A-セラミド経路の抑制を介した時間制限摂食のMASHに対する有益な効果 はじめに 背景紹介： 代謝機能障害関連脂肪肝疾患/代謝機能障害関連脂肪性肝炎（Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease/Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis、MASLD/MASH）は、世界の4分の1の人口に影響を及ぼす大きな健康問題です。MASLDは肝脂肪変性からより攻撃的なMASHに進行し、これは壊死性炎症と線維化を特徴とし、肝硬変や肝細胞癌に発展する可能性があります。現在の臨床治療は主にMASLDの進行を阻止し、既存のMASHを逆転させることに焦点を当ててい...
腸内微生物変化がリジン代謝に及ぼす影響による骨力学適応 研究背景 骨粗鬆症は世界規模で深刻な公衆衛生問題として2億を超える人々に影響を与え、健康と生命に重大な脅威をもたらしています。研究によれば、骨の健康維持と骨粗鬆症の予防には機械的負荷が不可欠ですが、臨床証拠は異なる個体の運動負荷に対する骨の応答（骨力学適応）に顕著な差異が存在することを示しています。過去数十年にわたり、腸内微生物が宿主の健康に重要な役割を果たしていることが徐々に発見されてきました。腸内微生物と骨の恒常性の間には関連があることが示されています。したがって、腸内微生物が骨力学適応をどのように調節するかを理解し、可能な介入法を見つけることが急務の科学的問題となっています。 研究出典 この研究論文は《Gut microbial ...
昼夜リズム障害が腸内細菌を介してがん転移と骨髄抑制性細胞の蓄積を促進する 学術的背景と研究動機 がんの転移は、多くのがん患者の主要な死因となっており、その中でも結腸直腸がん（colorectal cancer、CRC）は、世界的に発症率および死亡率が高いため注目されています。骨髄由来抑制細胞（myeloid-derived suppressor cells、MDSCs）は造血幹細胞から由来する未熟な骨髄細胞で、免疫抑制活性を持ち、主にT細胞、B細胞、または自然殺傷（NK）細胞による免疫応答を抑制することで、腫瘍の免疫逃避や浸潤を促進します。しかし、腫瘍微小環境（tumor microenvironment、TME）におけるMDSCsの調節メカニズムはまだ明らかになっていません。 昼夜リズムは...