遗传性视网膜疾病基因检测率的种族差异研究

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遗传性视网膜疾病基因检测率的种族差异研究

学术背景

遗传性视网膜疾病（Inherited Retinal Diseases, IRDs）是一组由基因突变引起的视网膜退行性疾病，可能导致视力丧失甚至失明。随着基因发现和下一代DNA测序技术的进步，越来越多的患者能够通过基因检测获得明确的遗传诊断。这些诊断不仅有助于确认疾病、预测预后，还为遗传咨询、生殖决策以及参与临床试验提供了重要依据。然而，目前尚不清楚现有的基因检测平台在不同种族群体中的检测率是否一致。特别是在癌症遗传学领域，已有研究表明，非洲裔人群在BRCA1/BRCA2乳腺癌基因检测中更容易获得不确定的结果。然而，关于IRDs的研究中，很少有研究披露参与者的种族构成，更少有研究比较不同种族背景患者的基因检测率。

因此，本研究旨在探讨黑人和非西班牙裔白人患者在IRDs基因检测中的检测率差异，并分析种族、年龄、性别、表型以及基因检测面板大小对检测率的影响。这一研究对于理解基因检测在不同种族群体中的有效性具有重要意义，尤其是在未来治疗手段不断发展的背景下，确保所有患者都能公平地获得基因诊断和治疗机会。

论文来源

本论文由Rebhi O. Abuzaitoun、Kari H. Branham、Gabrielle D. Lacy等多位作者共同撰写，作者来自密歇根大学（University of Michigan）、Blueprint Genetics等多个研究机构。论文于2024年11月7日在线发表在JAMA Ophthalmology期刊上，DOI为10.1001/jamaophthalmol.2024.4696。

研究设计与方法

研究设计

本研究是一项回顾性病例系列研究，数据来源于密歇根大学（UM）和Blueprint Genetics（BG）两个机构。UM的数据收集时间为2013年10月30日至2022年10月26日。研究纳入了572名患者，其中295名为男性（51.6%），平均年龄为45岁。患者中54名为黑人（9.4%），518名为白人（90.6%）。研究的主要目的是比较黑人和白人患者在IRDs基因检测中的检测率差异。

数据收集与处理

在UM的数据收集中，纳入标准包括：1）临床诊断为IRDs；2）进行了宽面板基因检测；3）患者及其父母均自我认定为同一种族（黑人或非西班牙裔白人）。数据通过电子病历系统获取，包括患者的年龄、性别、种族、表型、基因检测结果、检测基因数量等信息。基因检测结果分为阳性（检测到致病或可能致病变异）、阴性（未检测到变异）或不确定（检测到意义未明的变异）。

在BG数据库中，研究纳入了320名黑人患者和2931名白人患者，比较了两组患者的基因检测率。统计分析方法包括逻辑回归分析和卡方检验。

主要结果

密歇根大学数据分析

在UM的572名患者中，389名（68%）获得了阳性的基因检测结果。黑人患者的基因检测阳性率显著低于白人患者（38.9% vs 71%，p < 0.001）。此外，年龄每增加10岁，阳性检测率下降16%（OR = 0.84，95% CI：0.76-0.92，p < 0.001）。表型分析显示，锥体/锥杆营养不良患者的阳性检测率显著低于杆锥营养不良患者（OR = 0.45，95% CI：0.27-0.73，p = 0.001）。

Blueprint Genetics数据分析

在BG的3251名患者中，320名为黑人（9.7%）。黑人患者的阳性检测率为44.4%，显著低于白人患者的57.7%（χ2 = 18.65，p < 0.001）。

讨论与结论

种族差异的影响

本研究发现，黑人患者在IRDs基因检测中的阳性率显著低于白人患者。这一结果与先前的研究一致，表明现有的基因检测工具在黑人群体中的检测率较低。这可能与黑人群体中某些基因变异的频率较低或未被充分研究有关。此外，年龄较大的患者和锥体/锥杆营养不良患者的阳性检测率也较低。

研究的局限性

本研究存在一些局限性。首先，不同实验室使用的基因检测面板大小和检测方法存在差异，可能影响检测结果的一致性。其次，黑人患者的样本量相对较小，可能限制了统计分析的效力。此外，研究未纳入其他种族群体，未来需要进一步扩大样本量以验证这些发现。

研究的意义

本研究强调了在IRDs基因检测中存在的种族差异，特别是在黑人患者中检测率较低的问题。随着未来治疗手段的发展，确保所有患者都能公平地获得基因诊断和治疗机会至关重要。研究结果提示，未来的基因检测平台需要更加关注少数族裔群体的基因变异，以提高检测的准确性和公平性。

研究亮点

  1. 种族差异的首次系统性研究：本研究首次系统性地比较了黑人和白人患者在IRDs基因检测中的检测率差异，填补了这一领域的研究空白。
  2. 年龄与表型的影响：研究发现，年龄较大的患者和锥体/锥杆营养不良患者的基因检测阳性率较低，这为未来的临床诊断提供了重要参考。
  3. 基因检测平台的改进需求：研究结果提示，现有的基因检测平台在少数族裔群体中的检测率较低，未来需要改进检测技术以提高公平性。

结论

本研究表明，黑人患者在IRDs基因检测中的阳性率显著低于白人患者，且年龄较大的患者和锥体/锥杆营养不良患者的检测率也较低。这一发现强调了在基因检测中存在的种族差异问题，未来需要进一步改进检测技术，确保所有患者都能公平地获得基因诊断和治疗机会。