对前列腺癌患者进行转录组分析：基于前列腺特异膜抗原正电子发射断层扫描/计算机断层扫描的非局限性疾病研究

学术背景

前列腺癌是一种常见的男性恶性肿瘤，其诊断和治疗对患者的预后至关重要。转录组分析是一种用于了解基因表达水平的技术，近年来被广泛应用于癌症研究中。Decipher基因分类器是一种预后生物标志物，用于估计前列腺癌患者根治性手术（RP）或放射治疗后的转移风险。当前研究的兴起源自于对Decipher测试在前列腺特异膜抗原正电子发射断层扫描/计算机断层扫描（PSMA PET/CT）时代的预后能力的兴趣。鉴于PSMA PET/CT在检测非局限性疾病方面的高特异性和灵敏性，研究者们希望通过这一先进的分子成像技术，评估Decipher评分与非局限性疾病检测之间的关系。

研究来源

这项研究由John Nikitas, MD; Kritika Subramanian, MD; Nimrod Barashi Gozal, MD等人合作完成，参与的机构包括华盛顿大学医学院、纽约长老会/韦尔康奈尔医院、加州大学洛杉矶分校和西北大学医学院等。研究成果发表于2024年7月16日的JCO Precision Oncology，一篇名为”Transcriptomic Profiling of Primary Prostate Cancers and Nonlocalized Disease on Prostate-Specific Membrane Antigen Positron Emission Tomography/Computed Tomography: A Multicenter Retrospective Study.” DOI链接：https://doi.org/10.1200/po.24.00161。

研究流程

1. 患者群体

研究包含586名患者，其中329人为治疗前，257人为RP后复发患者。这些患者来自四个机构并进行了Decipher基因分类测试和PSMA PET/CT扫描。PSMA PET/CT扫描用于治疗前的初级分期或RP后的复发评估。

2. 临床数据收集

研究从每个患者处收集了临床数据，包括扫描时的年龄、国际泌尿病理学会（ISUP）分级、TNM分期、前列腺特异抗原（PSA）水平以及PSMA PET/CT的报告结果。分析所用的转录组签名数据来自前瞻性维护的基因表达注册表。

3. 数据处理和分析

所有数据去标识以保护患者隐私。研究使用多变量逻辑回归和多变量Cox回归模型分析了治疗前和RP后患者Decipher评分与PSMA PET/CT结果之间的关联。同时，对转录组签名进行了比较以探究各疾病状态之间的差异。

研究结果

1. Decipher评分与PSMA PET/CT结果关联

治疗前，随着Decipher评分每增加0.1，非局限性疾病的发生几率增加显著（OR: 1.18, 95% CI: 1.03-1.36, p=0.02）。RP后，较高的Decipher评分同样与较高的非局限性疾病发生率（HR: 1.15, 95% CI: 1.05-1.27, p=0.003）相关。

2. 转录组签名差异

治疗前，非局限性疾病患者的TP53突变率更高，PAM50 luminal A亚型率较低（21% vs 36%），而RP后，相关的代谢、DNA修复和雄激素受体信号传导的签名较高。针对骨和内脏转移的患者，高DNA修复和神经内分泌签名与更高的非局限性疾病风险相关。

3. 基因表达签名的探索

通过多变量回归分析发现，较高的Decipher评分与较高的外周淋巴结和内脏转移风险相关。此外，在治疗前和RP后的患者中，不同转录组签名（如代谢效应、Hallmarks of Cancer 、AR生物学等）揭示了不同疾病状态的分子生物学差异。

研究结论

研究表明，较高的Decipher评分与PSMA PET/CT检测到的非局限性疾病相关，这适用于治疗前和RP后的患者情景。治疗前，非局限性疾病与更高的TP53突变率和较低的PAM50 luminal A亚型相关；RP后，代谢、DNA修复和雄激素受体信号通路签名与更高的非局限性疾病率相关。这些数据表明，高Decipher评分可能预示着更具侵袭性的转移风险，但需要进一步的前瞻性研究验证治疗方案调整对于患者预后的影响。

研究意义

此项研究揭示了Decipher评分作为预后生物标志物在前列腺癌诊断和治疗中的重要作用，尤其是结合PSMA PET/CT进一步提高了对非局限性疾病的识别能力。未来研究可聚焦于通过Decipher评分和PSMA PET/CT结果的综合评估，指导临床治疗策略的优化，包括治疗强度的增加或减少，以改善患者的长期预后。