基于序列的功能性宏基因组学揭示环境微生物组中COPA基因的天然多样性
基于序列的功能宏基因组学揭示了环境微生物组中功能性COPA基因的新自然多样性 环境微生物组中的功能基因/蛋白质的自然多样性是进化和生物工程研究的重要组成部分。为了深入了解全球微生物中铜(Cu)抗性基因COPA的多样性,本研究采用了一种基于序列的功能宏基因组学方法。这项研究不仅将宏基因组组装技术、局部BLAST、进化迹分析(ETA)、化学合成和传统功能基因组学结合起来,还成功地高效挖掘了环境DNA(eDNA)中的COPA基因多样性。 研究背景 微生物进化过程中产生了多样的功能基因/蛋白质,这些基因/蛋白质在领域如微生物系统发育学和蛋白质工程中有着广泛的应用。例如,DNA指导的RNA聚合酶亚基Beta(RPB)和氮化酶铁蛋白(NIFH)等基因广泛用于识别和描述不可培养的‘黑暗物质’。现有已知功能...