NID2 SNPs与中国人群胶质瘤风险和预后的关联

NID2 SNPs与中国人群胶质瘤风险和预后的关联

NID2基因单核苷酸多态性与中国汉族人群胶质瘤风险及预后的关联 学术背景 胶质瘤是最常见的原发性颅内肿瘤,具有高死亡率和预后不佳的特点。尽管已取得了一定的诊断和治疗策略进展,但常规治疗对胶质瘤患者预后的改善仍有限。目前,胶质瘤的具体发病机制尚不明确,但与环境和遗传因素密不可分。离子辐射被认为是已确认的环境风险因素,而遗传多态性、端粒维护、遗传综合征和家族聚集性等遗传因素也与胶质瘤的易感性和预后有关。尽管已有基因组广泛关联研究(GWAS)在某些基因中发现了与胶质瘤风险相关的位点,例如TP53、EGFR、CDKN2A/B和TERT,但这些研究主要集中在欧美人群中。因此,有必要在中国汉族人群中确定与胶质瘤发展相关的基因变异的作用。 NID2(nidogen-2)作为细胞粘附蛋白,能够结合胶原蛋白I...

迷迭香酸在髓母细胞瘤细胞中调节细胞活力、增殖和干性:HDACs 和 EGFR 参与机制

儿童髓母细胞瘤(Medulloblastoma, MB)是最常见的恶性儿科脑肿瘤,由于其独特的分子和临床特性,这类肿瘤的治疗一直是临床研究的重点。现有的治疗方法主要包括最大限度的手术切除、放疗和化疗,但这些治疗常常会导致患者长期生活质量低下,包括认知、运动和神经精神方面的缺陷。因此,寻找能够有效对抗肿瘤同时维护患者生活质量的新型治疗药物迫在眉睫。 在这一背景下,作者团队围绕来自植物的化合物迷迭香酸(Rosmarinic Acid, RA)展开了一系列研究。迷迭香酸已被研究表明对多种疾病包括癌症具有一定的作用。而在本研究中,作者首次探讨了迷迭香酸对髓母细胞瘤的作用机制。 研究团队及论文发表 本文由Alice Laschuk Herlinger、Gustavo Lovatto Michaelse...

通过高通量分子诊断方法鉴定晚发性异染性脑白质营养不良的新型ARSA基因突变

通过高通量分子诊断方法鉴定晚发性异染性脑白质营养不良的新型ARSA基因突变

遗传性白质营养不良的神经分子医学研究——一项关于发现新型arsa基因突变的研究报告 研究背景 遗传性白质营养不良(Leukodystrophies)是一类主要影响中枢神经系统白质的遗传性疾病。其范围广泛,病因主要是各种基因突变导致的酶缺陷。最常见的一种白质营养不良是亚型色性白质营养不良(Metachromatic Leukodystrophy,MLD),其是一种罕见的赖索体蓄积病,由ARSA基因的致病突变(pathogenic mutations)引起。MLD临床表现严重,包括运动障碍、精神问题,有时还包括癫痫。根据发病年龄,MLD可进一步分为三种临床类型:婴儿期晚发型、青少年期和成人期。其中,婴儿期晚发型是最常见和最严重的形式。 因其罕见性和不同的基因突变类型,MLD的诊断具有挑战性。传统...

circPTP4A2通过miR-20b-5p/YTHDF1/TIMP2轴促进脑缺血性中风中的小胶质细胞极化

科学论文《circptp4a2通过mir‑20b‑5p/ythdf1/timp2轴在脑缺血性中风中促进小胶质细胞极化》的学术报道 背景介绍 脑缺血性中风(ischemic stroke, IS)是由于脑血流阻塞导致的脑组织坏死,是全球导致残疾和死亡的第二大原因。当前的临床治疗策略主要包括静脉溶栓和机械取栓,但这些方法的疗效有限。因此,开发新的有效治疗策略具有重要意义。小胶质细胞作为脑内常驻巨噬细胞,在急性和慢性神经炎症反应中起重要作用。在脑缺血性中风的病理阶段,小胶质细胞能迅速激活并分化为M1或M2表型,这两种表型分别在组织损伤和修复中发挥不同的功能。 特别地,M1小胶质细胞通过分泌促炎因子促进脑损伤,而M2小胶质细胞则分泌抗炎因子,具有神经保护作用。因此,促进小胶质细胞向M2表型极化被认为...

炎症小体激活介导缺血条件下星形胶质细胞的凋亡和焦亡

炎症小体激活在缺血条件下调节星形胶质细胞的凋亡和焦亡 引言 缺血性中风是导致大脑损伤的主要机制之一,其特征是局部大脑区域因为血流中断而缺氧和缺乏能量。近年来,研究发现炎症反应在缺血性中风中发挥了关键作用。炎症小体(inflammasome)是细胞内多聚蛋白复合物,主要通过激活促炎性半胱氨酸蛋白酶(caspase)并促进促炎性细胞因子如IL-1β和IL-18的成熟和分泌,来驱动炎症反应。目前,大量研究已经确定了炎症小体在缺血性中风引起的神经细胞死亡以及小胶质细胞激活和细胞死亡中的作用,但在星形胶质细胞中的调控机制仍然知之甚少。 研究背景与动机 在中枢神经系统(CNS)中,星形胶质细胞是最丰富的胶质细胞类型,主要分为纤维性星形胶质细胞和原浆性星形胶质细胞。纤维性星形胶质细胞主要位于脑和脊髓的白质...

AIFM1变异导致线粒体功能障碍及核黄素缺乏不耐受

AIFM1基因错义变异导致线粒体功能障碍与核黄素缺乏不耐受 研究背景 线粒体是具双膜结构的细胞器,存在于有核真核细胞中,主要通过氧化磷酸化产生三磷酸腺苷(ATP)来提供细胞能量。线粒体拥有自己的基因组,编码着参与线粒体呼吸链复合物的13种蛋白质,其他线粒体蛋白则由核基因组编码并被导入到线粒体。其中,凋亡诱导因子(Apoptosis-Inducing Factor, AIFM1)是一种由X连锁AIFM1基因编码的线粒体黄素蛋白,参与无胱天蛋白酶的细胞死亡,并调控呼吸链复合物的生物合成。 研究表明,AIFM1基因的突变与多种临床表型相关,但核黄素(即维生素B2)治疗的效果仍存在争议。本研究旨在探索AIFM1基因c.1019T > C变异导致线粒体功能障碍的机制,并评估核黄素补充对该变异的影响。 ...

欧洲参考网络中罕见神经疾病的NGS质量保证

质量保证在未来高级测序诊断中的应用 背景介绍 过去十年中,下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)在诊断稀有神经病(Rare Neurological Diseases,RND)领域取得了革命性进展。然而,技术、解释和报告标准的缺乏给确保全球一致和高质量的诊断带来了挑战。为了应对这一问题,欧洲稀有神经疾病参考网络(European Reference Network for Rare Neurological Diseases,ERN-RND)与欧洲分子遗传学质量网络(European Molecular Genetics Quality Network,EMQN)合作,建立了一个基于NGS的外部质量评估方案用于RNDs的诊断。 在21世纪,NGS方法逐渐成...

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性 背景介绍 在遗传性乳腺癌(Breast Cancer, BC)的预测中,多基因风险评分(Polygenic Risk Scores, PRSs)正在日益广泛地应用,作为个体风险预测的一个重要工具。PRS的计算依赖于精确再现变异等位基因频率(Allele Frequencies, AFs),从而准确地预测PRSS的值。然而,目前使用下一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)进行多基因风险评分基因型分析时,存在不少技术上的限制。本研究的背景在于这些技术挑战,对改进和优化乳腺癌风险评估模型具有重要意义。 研究来源及作者背景 本研究由来自德国遗传性乳腺癌和卵巢癌联盟(German Consortium for...

利用计算方法增强PAX6基因错义变异的解释

通过计算方法提高对PAX6基因错义变异的解释 背景介绍 PAX6基因是一种高度保守的转录因子,在眼睛发育中起着重要作用。PAX6的杂合失功能变异可导致一系列眼科疾病,包括无虹膜症。然而,许多PAX6基因的错义变异目前被分类为不确定意义的变异(VUS),这对分子诊断提出了重大挑战。虽然计算工具可以用来评估基因变异的影响,但其预测的准确性有所不同。在这项研究中,作者们评估和优化了计算预测工具在PAX6错义变异方面的性能。 来源介绍 这篇文章由Nadya S. Andhika、Susmito Biswas、Claire Hardcastle等人完成,来自曼彻斯特大学生物科学学院进化、感染与基因组学研究所,曼彻斯特大学附属NHS基金会信托,欧洲分子生物学实验室(EMBL-EBI)等多个机构。这篇论文...

6224个未解决的罕见疾病外显子测序中的结构变异检测和临床解释

结构变异检测及在6224个未解决的罕见病外显子中的临床解释 研究背景 罕见病的诊断与研究一直是遗传学和临床医学的重要挑战。结构变异(SVs),包括大片段缺失、重复、倒位、易位以及更复杂的事件,均可能破坏基因功能,导致罕见疾病。然而,目前的外显子测序(ES)在处理小体内变异如单核苷酸变异(SNVs)和短于50个碱基对的插入-缺失(indels)方面的分析流程,对于SVs则尚不成熟。本研究旨在提高诊断率,尤其是通过检测和解释ES数据中的SV来解决尚未诊断出的罕见病病例。 研究来源 本研究由German Demidov, Steven Laurie等人联合完成,涉及来自不同研究机构的专家学者共同努力。文章发表于2024年在《European Journal of Human Genetics》上,...