Annotation génomique des guides CRISPR valide les cibles dans les lignées cellulaires variantes et améliore la découverte dans les criblages

annotation des guides CRISPR ciblant le génome à l’aide de l’algorithme EXORCISE Contexte académique La technologie CRISPR-Cas9 a révolutionné les criblages génétiques, notamment en analysant l’essentialité des gènes et les interactions chimio-génétiques. En programmant des ARN guides (gRNAs) pour cibler des séquences spécifiques du génome, ce syst...

Surveillance génomique des organismes multirésistants basée sur le séquençage à lecture longue

Contexte académique Les organismes multirésistants (Multidrug-Resistant Organisms, MDROs) représentent une menace majeure pour la santé publique mondiale. Ces micro-organismes, résistants à plusieurs classes d’antibiotiques, compliquent le traitement des infections et augmentent les charges médicales. Pour surveiller et contrôler efficacement leur ...

L'influence du CD30 sur la dynamique des cellules B du centre germinatif et l'expansion des cellules B commutées en IgG1

Impact de CD30 sur la dynamique des cellules B des centres germinatifs et l’expansion des cellules B commutées IgG1 Introduction CD30 (également connu sous le nom de TNFRSF8) est un membre de la superfamille des récepteurs du facteur de nécrose tumorale (TNF-R). Il a initialement été identifié comme un marqueur des lymphomes de Hodgkin. Cependant, ...

La kynurénine-AHR réduit l'infiltration des cellules T et induit une réponse immunitaire retardée des cellules T en supprimant l'axe STAT1-CXCL9/CXCL10 dans la tuberculose

Rapport académique La tuberculose (Tuberculosis, TB) est une maladie mondiale causée par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), affectant chaque année des millions de personnes. Bien que des avancées significatives aient été réalisées dans le diagnostic et le traitement de la tuberculose, les mécanismes d’évasion immunitaire de Mtb restent une des raiso...

Rôles critiques et différentiels d'eIF4A1 et d'eIF4A2 dans le développement et la fonction des cellules B

Rôles Critiques et Différentiels de eIF4A1 et eIF4A2 dans le Développement et la Fonction des Cellules B Contexte Scientifique Dans les cellules des mammifères, l’initiation de la traduction est une étape clé de la synthèse protéique, et le facteur d’initiation eucaryote 4A (eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A) joue un rôle crucial dans ce proce...

Mécanismes de la variation liée à l'âge dans la régénération des cellules immunitaires chez les individus

Avec le vieillissement des organismes, la fonctionnalité du système immunitaire diminue progressivement, se traduisant par une augmentation des cellules immunitaires innées (telles que les granulocytes) et une diminution des cellules immunitaires adaptatives (comme les cellules B). Ce déséquilibre du système immunitaire est étroitement lié à l’appa...

Cartographie des réseaux génétiques in silico du gène suppresseur de tumeur KMT2D pour découvrir de nouvelles associations fonctionnelles et vulnérabilités des cellules cancéreuses

Contexte académique et problématique Les mutations de perte de fonction (Loss-of-Function, LOF) des gènes suppresseurs de tumeurs (Tumour Suppressor Genes, TSGs) sont extrêmement fréquentes dans les cancers. Cependant, ces mutations entraînent une perte ou une déficience de la fonction des protéines codées, ce qui rend difficile leur ciblage thérap...

La protéine contenant le domaine régulateur de l'ubiquitine X (UBX) 6 est essentielle pour l'induction de l'autophagie et le contrôle de l'inflammation dans les macrophages

Rôle clé de l’UBXN6 dans l’induction de l’autophagie et le contrôle de l’inflammation chez les macrophages Introduction Le système immunitaire inné constitue la première ligne de défense de l’organisme contre l’invasion de pathogènes et les réponses inflammatoires. Les monocytes et macrophages, principaux composants du système immunitaire inné, jou...

La polyadénylation alternative de l'ARNm régule l'hyperactivation des macrophages via la voie de l'autophagie

NUDT21 régule l’hyperactivation des macrophages via la voie d’autophagie Contexte académique La réponse inflammatoire constitue un élément essentiel de la défense immunitaire de l’organisme, en facilitant l’élimination des agents pathogènes et la réparation des tissus. Cependant, une dysrégulation de cette réponse peut entraîner des maladies inflam...

Analyse intégrée à cellule unique révélant des états de cellules cancéreuses régulés par l'épigénétique et une signature centrale guidée par l'hétérogénéité dans le cancer du sein résistant au tamoxifène

Analyse unicellulaire intégrée révélant des états de cellules cancéreuses régulés par l’épigénétique et une signature centrale guidée par l’hétérogénéité dans le cancer du sein résistant au tamoxifène Contexte académique Le cancer du sein est l’un des cancers les plus fréquents chez les femmes, et le traitement endocrinien (comme le tamoxifène) est...