Grepore-seq:長範囲PCRとナノポアシーケンシングによる遺伝子編集後の変化を検出するための堅牢なワークフロー

Grepore-seq:長範囲PCRとナノポアシーケンシングを用いた遺伝子編集後の変化を検出する堅牢なワークフロー 研究背景 CRISPR/Cas9システムは、RNAガイド型DNAエンドヌクレアーゼシステムとして、ゲノム編集で広く応用されています。臨床治療での潜在的な可能性が高まるにつれ、遺伝子編集結果の包括的な評価がますます重要になっています。しかし、大規模で経済的かつパイプライン化された方法で遺伝子編集の結果を検出する方法、特に大きな断片の挿入や欠失を検出する方法が不足しています。研究によると、CRISPR/Cas9編集後に非標的効果が発生する可能性があり、大規模な欠失や複雑なゲノム再編成などが臨床応用に課題をもたらしています。 研究目的と革新性 上記の問題を解決するため、本研究では「g...

SaCas9の優れた正確性とSpCas9に比べた異なる編集結果

高忠実度と異なる遺伝子編集結果のSaCas9とSpCas9の比較 研究背景 Cas9タンパク質に基づくCRISPRシステムは、ゲノム編集の強力なツールとなり、基礎研究や臨床遺伝子治療で広く応用されています。現在、最も一般的に使用されているCas9変異体は、化膿連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)由来のSpCas9と黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)由来のSaCas9です。これら2つのCas9タンパク質は多くの研究で広く検証されていますが、具体的な遺伝子編集効果の比較については、まだ系統的な研究が不足しています。そのため、本論文はSpCas9とSaCas9の遺伝子編集における効率と精度を系統的に比較し、異なる切断長での編集性能を探究することを目的と...

シーケンスベースの機能的メタゲノミクスが環境微生物群における銅耐性遺伝子copaの新しい自然多様性を明らかにする

配列に基づく機能メタゲノミクスが環境マイクロバイオームにおける機能的COPA遺伝子の新しい自然多様性を明らかにした 環境マイクロバイオームにおける機能遺伝子/タンパク質の自然多様性は、進化および生物工学研究の重要な構成要素です。銅(Cu)耐性遺伝子COPAの世界的な微生物における多様性をより深く理解するために、本研究では配列ベースの機能メタゲノミクスアプローチを採用しました。この研究は、メタゲノムアセンブリ技術、ローカルBLAST、進化的トレース分析(ETA)、化学合成、および従来の機能ゲノミクスを組み合わせただけでなく、環境DNA(eDNA)からCOPA遺伝子の多様性を効率的に掘り起こすことに成功しました。 研究背景 微生物の進化過程で多様な機能遺伝子/タンパク質が生み出され、これらの遺伝...

食事摂取とグルタミン-セリン代謝が病的血管硬化を制御

研究背景 心血管疾病 (Cardiovascular diseases, CVDs) は、世界的に主要な死亡原因の一つであり、血管のリモデリングと硬直は心血管疾患の重要なマーカーであり、疾患の進行と予後に深刻な影響を与えます。近年の研究では、血管線維芽細胞が血管の硬直とリモデリングにおいて果たす役割がますます注目されています。特に、致命的な肺血管疾患である肺動脈高血圧症 (Pulmonary Hypertension, PH) に対抗する際、血管線維芽細胞の代謝経路を理解することが新たな治療法の開発に不可欠です。 论文来源 この論文は “Dietary Intake and Glutamine-Serine Metabolism Control Pathologic Vascular Sti...

ニューロンAMPKはタウオパチー脳におけるミクログリアの脂肪滴蓄積を調節する

脳内ミクログリアにおける脂質滴の蓄積は神経細胞AMPKによって調節される 背景と研究課題 アルツハイマー病(Alzheimer’s Disease、略称AD)は、老人性認知症の一般的なタイプで、神経細胞の繊維絡み合いとβ-アミロイド斑が特徴です。しかし、これらの古典的な病理に加えて、脂質代謝の変化がADおよびその他の加齢に関連する神経変性疾患の発生に深く関与していることがますます認識されています。脂質滴(Lipid Droplets、略称LDs)は、細胞内に脂質を貯蔵する重要なオルガネラであり、細胞代謝の調節や酸化ストレスに対する応答において重要な役割を果たします。AD患者の脳内、特にタウタンパク質病変に関連する神経細胞内で、脂質滴の異常な蓄積が何度も観察されています。しかし、この現象の具体...

クコ多糖はICV-STZ誘発アルツハイマー病マウスモデルのシナプス構造可塑性を改善し、IRS1/PI3K/AKTシグナル伝達経路を調節することで認知機能を向上させる

リキウムバルバラムポリサッカライドのICV-STZ誘発アルツハイマー病マウスモデルの認知機能改善に関する研究 研究背景 アルツハイマー病(Alzheimer’s disease, AD)は最も一般的な中枢神経系の神経変性疾患であり、進行性の認知障害、記憶障害、性格変化、感情障害を特徴とする。病理学的には、ADは神経細胞とシナプスの退化、凝集したβアミロイドタンパク質(Aβ)ペプチドによる細胞外プラーク、過剰にリン酸化されたTauタンパク質による細胞内神経原線維変化を特徴とする。既知のAD病理因子に加えて、脳のグルコース/エネルギー代謝とインスリン抵抗性も認知症のリスクを著しく増加させることを示す証拠が増えている。 脳インスリン抵抗性は、インスリン受容体シグナル伝達の不良、脳内インスリンレベル...

クレミゾールがα-シヌクレイン形成繊維粒によって誘発されたパーキンソン病病理に及ぼす影響: 薬理学的研究

クレミゾールがα-シヌクレイン形成繊維粒によって誘発されたパーキンソン病病理に及ぼす影響: 薬理学的研究

クレミゾールがα-シヌクレイン線維形成誘導によるパーキンソン病病理に及ぼす影響 背景紹介 パーキンソン病(Parkinson’s Disease、PD)は典型的な神経変性疾患で、主にミトコンドリア機能障害と酸化ストレスに関連しています。しかし、これらの病理学的事象に対する現在の治療法は、実験室から臨床応用への転換に成功していません。この転換の失敗の重要な理由の1つは、疾患の病理学と進行を真に再現できない従来のモデルを使用していることです。そこで、この問題を解決するために、本研究ではより生理学的に関連性の高いモデルを採用し、α-シヌクレイン前形成線維(Pre-Formed Fibrils、PFF)をSH-SY5Y細胞とSprague Dawleyラットに曝露することで、PD様病理における過渡受...

グリチルリチン酸は、HMGB1のリン酸化および炎症反応の抑制を通じて、ストリキニーネによって引き起こされる神経毒性を軽減します

甘草酸によるマチンの神経毒性軽減メカニズムの研究報告 背景紹介 マチン(Semen Strychni)はホミカ(Strychnos Nux-vomica)の乾燥した成熟種子から得られ、抗腫瘍、抗炎症、免疫抑制、神経興奮などの多様な薬理活性を持つことが発見されています(Zheng et al., 2012; Agrawal et al., 2011a, b; Rao and Prasad, 2013)。しかし、長期または過剰な使用は多臓器障害、特に神経毒性を引き起こし、臨床応用を制限しています(Chen et al., 2014; Philippe et al., 2004)。研究によると、マチンの主要な活性成分であるストリキニーネとブルシンは、主要な毒性成分でもあります(Wu et al.,...

獲得性脳損傷後の腕の動作異常の主観的評価を自動化するための機械学習

獲得性脳損傷後の腕の動作異常の主観的評価を自動化するための機械学習

画像抽出と分類システムによるABI患者の歩行異常運動の自動化された臨床評価 学術的背景 獲得性脳損傷(Acquired Brain Injury、ABI)後、歩行障害は一般的な身体障害です。ABIには通常、脳卒中と外傷性脳損傷が含まれ、これらの疾患の世界的な発生率は約150万例です。ABI患者の歩行障害は下肢だけでなく、体幹と上肢にも影響を及ぼし、日常生活への参加を制限し、生活の質を大幅に低下させます。機能障害に加えて、これらの明らかな運動異常は美的な問題を引き起こす可能性があり、患者のボディイメージ、自尊心、心理的健康、社会的統合に悪影響を及ぼす可能性があります。 研究動機 従来のABI患者の運動異常評価は、経験豊富な理学療法士による視覚的観察を通じた主観的評価に依存していました。しかし、...

外来ストロークリハビリテーションにおけるロボットヒップ外骨格の安全性と有効性

安全性与有效性:ロボット股関節外骨格が外来診療における脳卒中リハビリに与える影響 研究背景 脳卒中はアメリカ成人の主要な障害原因であり、脳卒中生存者の80%が歩行速度の低下、耐久力の低下、歩行の非対称性などの歩行障害を経験し、コミュニティ内での歩行能力が制限される。このような行動障害は、脳卒中後に生じる多種類の神経筋の変化の組み合わせ(皮質脊髄経路の伝導と制御の減少、筋萎縮と虚弱、バランスと姿勢制御の障害、異常な筋協調作用など)に起因する。脳卒中後リハビリの目標は、最大限の機能回復を促進し、就労や社会参加、コミュニティ参加を実現することである。歩行能力の回復は日常生活に戻るための重要な部分である。 近年、軽量でモジュール化されたロボット股関節外骨格が外来診療やコミュニティ環境においてシームレ...