Oncofetal SNRPE通过调控FGFR4的可变剪接促进肝细胞癌的肿瘤发生

关于Oncofetal snrpe在肝细胞癌肿瘤发生发展中起关键作用的研究

研究背景及目的

肝细胞癌(HCC)是全球第六大流行癌症,导致癌症相关死亡的第三大原因。然而,由于对肿瘤关键分子事件认识的不足,针对HCC的有效治疗靶点仍然十分有限。本研究聚焦于剪接体相关基因在HCC中的显著改变,探索了胚胎肝发育与HCC过程中剪接体相关的胎儿蛋白作为肿瘤治疗靶点的潜力。

研究来源

本研究由Wu Qipeng、Liao Ruyan、Miao Chunmeng、Hasnat Muhammad、Li Le、Sun Lixin、Wang Xinru、Yuan Ziqiao、Jiang Zhenzhou、Zhang Luyong和Yu Qinwei联合完成。研究所属机构包括中国药科大学、广州海关技术中心、拉合尔兽医与动物科学大学、郑州大学、广东药科大学等。研究成果发表于2024年的《英国癌症杂志》(British Journal of Cancer),文章DOI为10.1038/s41416-024-02689-5。

研究方法

研究首先利用生物信息学方法分析胚胎肝脏和HCC的差异表达剪接体基因。通过分析小核糖核蛋白多肽E(snrpe)在胚胎肝、成人肝和HCC组织中的表达,并运用体外和体内实验多种方法评估snrpe在HCC中的作用。研究发现snrpe通过调控胎儿生长因子受体4(fgfr4)的表达进行剪接变异促进肿瘤发生。通过高通量的RNA测序识别由snrpe调控的剪接变异。

主要研究结果

研究发现,snrpe是与HCC不良预后显著相关的关键胚胎剪接因子。研究中鉴定出SOX2因子激活snrpe的重新表达。有效的snrpe基因沉默能够完全阻止HCC肿瘤发生和进展。从机理上分析,snrpe基因沉默通过触发非义译介导的RNA降解,降低了fgfr4 mRNA的表达。在fgfr4基因沉默的情况下,观察到对snrpe诱导的HCC细胞恶性进展的部分抑制。

研究结论及意义

研究结果突出了snrpe作为HCC治疗靶标的潜力,且揭示了胚胎剪接因子与剪接事件和癌症发生之间复杂的联系。这为开发靶向HCC治疗的新策略提供了科学根据。

研究亮点

本研究发现的snrpe作为一个新的胎儿剪接因子在HCC中的关键作用具有重要的发现意义。研究不仅强调了解决的问题重要性,即胚胎剪接因子与癌症发生的联系,而且研究方法的创新性,特别是研究对象snrpe的特殊性。