Réseau de convolution graphique guidé par la similarité à l'auto-attention pour la recherche sur la classification des gliomes de bas grade de plusieurs types

Auto-attention-guided Graph Convolutional Network

Réseau de Convolution Graphique Guidé par la Similarité Auto-attention pour la Classification des Gliomes de Bas Grade Multitypes

I. Contexte de la Recherche

Les gliomes de bas grade sont une forme courante de tumeur cérébrale maligne, causée par la transformation cancérogène des cellules gliales dans le cerveau et la moelle épinière. Ils se caractérisent par une incidence, une récidive et une mortalité élevées, ainsi qu’un faible taux de guérison. Une classification correcte des gliomes de bas grade multitypes est cruciale pour le pronostic des patients. Dans le diagnostic, les médecins utilisent généralement l’imagerie par résonance magnétique (IRM) et la tomodensitométrie (CT) pour analyser l’état de mutation de l’isocitrate déshydrogénase (IDH) des cellules gliales.

L’état de mutation de l’IDH est une indication importante pour distinguer les gliomes de type sauvage et mutés. Traditionnellement, cela nécessite une biopsie ou une résection chirurgicale pour effectuer une immunohistochimie ou un séquençage génétique afin de déterminer l’état de mutation de l’IDH. Étant donné les risques associés à la biopsie, le développement de méthodes de diagnostic assisté par ordinateur non invasives pour prédire l’état de mutation de l’IDH est significatif, permettant d’éviter aux patients des risques chirurgicaux inutiles.

II. Source de l’Article

Cet article a été publié dans le IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, numéro de juillet 2023. Les auteurs de l’article sont affiliés à l’École des sciences de l’information et de la gestion de l’Université agricole de Henan.

III. Contenu de la Recherche

1) Processus de Recherche

Cette étude propose un réseau de convolution graphique guidé par la similarité d’auto-attention (SASG-GCN) pour la classification des trois types de lésions tumorales (TF), gliomes mutés (MG) et gliomes de type sauvage (WTG) à partir des images IRM. Le processus de travail de SASG-GCN comprend :

(1) Utilisation d’un réseau de croyance profonde convolutif (CDBN) pour extraire les vecteurs de caractéristiques des tranches IRM séquentielles, utilisés comme nœuds pour construire le réseau graphique.

(2) Proposer une méthode de similarité d’auto-attention (SAS) pour calculer le coefficient de similarité entre les vecteurs de caractéristiques, utilisé comme poids des arêtes pour construire le réseau graphique.

(3) Construire un réseau graphique comprenant 64 nœuds et 835 arêtes basés sur les vecteurs de caractéristiques extraits et les coefficients de similarité.

(4) Entrée du réseau graphique construit dans un réseau de convolution graphique à deux couches (GCN) pour la prédiction de la classification.

2) Principaux Résultats

Cette étude a été évaluée expérimentalement sur le jeu de données TCGA-LGG (comprenant 402 images IRM), les résultats montrent :

  • SASG-GCN a atteint une précision maximale de 93,62% dans la tâche de classification à trois catégories, surpassant diverses autres méthodes de pointe.
  • Contrairement aux réseaux de neurones convolutifs basés sur des tranches 2D ou des images 3D, SASG-GCN capture mieux les relations non linéaires et les informations de haute dimension dans les images IRM.
  • La stratégie de guidage par similarité d’auto-attention a significativement amélioré la performance de classification.
  • La visualisation expérimentale a révélé des caractéristiques distinctes dans le réseau graphique construit pour différents types de gliomes.

3) Signification de la Recherche

Les points novateurs et la signification de cette étude incluent :

  • Proposition d’une nouvelle méthode de classification des gliomes multitypes basée sur les réseaux de convolution graphique.
  • Utilisation de CDBN pour réduire la dimensionnalité des données d’image IRM de haute dimension, SAS pour capturer les relations de similarité entre les tranches, afin de guider ensemble la construction d’une représentation graphique discriminative.
  • Expérimentalement prouvé que SASG-GCN excelle dans la tâche de classification des gliomes, fournissant une nouvelle approche pour le traitement des images IRM.
  • L’analyse visuelle a révélé des différences significatives dans la structure du réseau graphique pour différents types de gliomes, ce qui est instructif pour le diagnostic clinique.

4) Points Forts de la Recherche

  • Proposition d’un cadre innovant pour la classification des gliomes basé sur les réseaux de convolution graphique.
  • La stratégie de guidage par similarité d’auto-attention extrait efficacement les caractéristiques des données de haute dimension et les associations entre les tranches.
  • Les expériences montrent que la méthode proposée a atteint les meilleures performances actuelles dans la tâche de classification des gliomes multitypes.
  • La construction de réseaux graphiques et l’analyse visuelle fournissent de nouvelles méthodes d’interprétation pour le diagnostic clinique.

IV. Conclusion

Cette étude propose un modèle innovant SASG-GCN, en construisant une représentation graphique discriminative contenant des informations sémantiques et de similarité de tranche, réalisant une classification non invasive précise des gliomes de bas grade. Les résultats de la recherche élargissent non seulement théoriquement l’application des réseaux de convolution graphique dans le traitement des images médicales, mais fournissent également un nouvel outil d’assistance informatique pour le diagnostic clinique des gliomes, avec une importante valeur scientifique et des perspectives d’application.