Smad1/5 est acétylé dans les aortes dorsales de l'embryon de souris, entraînant l'expression précoce des gènes artériels

Contexte académique Au cours du développement embryonnaire, la différenciation artério-veineuse (différenciation AV) est une étape cruciale pour assurer la formation et la maturation des vaisseaux sanguins. Si l’identification des artères ou des veines présente des défauts, cela peut entraîner une fusion inappropriée des vaisseaux, formant ce que l...

Acide Diméthylguanidino Valérique Circulant, Facteurs Alimentaires et Risque de Maladie Coronarienne

Contexte La maladie coronarienne (Coronary Heart Disease, CHD) est l’une des principales causes de décès dans le monde, et son mécanisme pathogénique est complexe, impliquant de multiples facteurs métaboliques et alimentaires. Ces dernières années, le développement de la métabolomique a offert de nouvelles perspectives pour l’étude de la maladie co...

La protéine de liaison à l'ARN avec épissage multiple (RBPMS) favorise l'épissage du phénotype contractile dans les cellules musculaires lisses vasculaires dérivées de cellules souches embryonnaires humaines

Le rôle crucial de la protéine de liaison à l’ARN RBPMS dans les cellules musculaires lisses vasculaires Contexte académique Les cellules musculaires lisses vasculaires (Vascular Smooth Muscle Cells, VSMCs) constituent les principaux éléments structurels des grandes artères. Dans les vaisseaux sanguins sains, les VSMCs possèdent un phénotype contra...

EPICPred : Prédire les phénotypes pilotés par les TCR liant les épitopes en utilisant l'apprentissage multi-instances basé sur l'attention

Les récepteurs des cellules T (TCR) jouent un rôle crucial dans le système immunitaire adaptatif, en reconnaissant les agents pathogènes par leur liaison à des épitopes spécifiques. Comprendre les interactions entre les TCR et les épitopes est essentiel pour dévoiler les mécanismes biologiques des réponses immunitaires et pour développer des immuno...

SCICONE : Appel de nombre de copies et reconstruction de l'histoire des événements à cellule unique

Au cours du développement des tumeurs, les altérations du nombre de copies génomiques (Copy Number Alterations, CNAs) sont un facteur clé qui influence l’hétérogénéité et l’évolution tumorales. Comprendre ces variations est essentiel pour développer des méthodes de diagnostic et de traitement personnalisées du cancer. Le séquençage unicellulaire of...

ImmunoTar—Prioritisation intégrative des cibles de surface cellulaire pour l'immunothérapie du cancer

Le cancer reste l’une des principales causes de mortalité dans le monde. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés ces dernières années dans l’immunothérapie, comme le succès des thérapies par cellules CAR-T (récepteur antigénique chimérique) et des conjugués anticorps-médicament (ADCs), l’identification efficace des cibles protéiques d...

Alignement de trajectoire de la dynamique d'expression génique

Le séquençage de l’ARN monocellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) a fourni une résolution sans précédent pour étudier la dynamique de l’expression génique au cours du développement et de la différenciation cellulaire. Cependant, en raison de la complexité des processus biologiques, les trajectoires de développement cellulaire dans diffé...

Apprentissage par cartographie contrastive pour la reconstruction spatiale des données de séquençage d'ARN unicellulaire

La technologie de séquençage d’ARN monocellulaire (scRNA-seq) permet une analyse transcriptomique à haut débit à la résolution d’une seule cellule, ce qui a considérablement fait progresser la recherche en biologie cellulaire. Cependant, une limitation notable de la technologie scRNA-seq est qu’elle nécessite la dissociation des tissus, ce qui entr...

APNet : Un modèle d'apprentissage profond parcimonieux explicable pour découvrir les facteurs actifs différentiels de la COVID-19 sévère

Contexte académique La pandémie de COVID-19 a eu un impact considérable sur les systèmes de santé publique mondiaux. Bien que la situation se soit améliorée, les mécanismes immunopathologiques complexes de la maladie, les séquelles à long terme (comme le “COVID long”) et les menaces similaires potentielles continuent de stimuler la recherche. En pa...

Combinaison synergique de perphénazine et de témozolomide supprime les sphères tumorales de glioblastome dérivées de patients

Contexte académique Le glioblastome (Glioblastoma, GBM) est une tumeur cérébrale primaire hautement maligne. Malgré les traitements standards actuels, tels que la résection chirurgicale, la radiothérapie et la chimiothérapie, son pronostic reste très sombre, avec une survie médiane des patients de seulement 14,6 mois. Les traitements traditionnels ...