NID2基因单核苷酸多态性与中国汉族人群胶质瘤风险及预后的关联

学术背景

胶质瘤是最常见的原发性颅内肿瘤，具有高死亡率和预后不佳的特点。尽管已取得了一定的诊断和治疗策略进展，但常规治疗对胶质瘤患者预后的改善仍有限。目前，胶质瘤的具体发病机制尚不明确，但与环境和遗传因素密不可分。离子辐射被认为是已确认的环境风险因素，而遗传多态性、端粒维护、遗传综合征和家族聚集性等遗传因素也与胶质瘤的易感性和预后有关。尽管已有基因组广泛关联研究（GWAS）在某些基因中发现了与胶质瘤风险相关的位点，例如TP53、EGFR、CDKN2A/B和TERT，但这些研究主要集中在欧美人群中。因此，有必要在中国汉族人群中确定与胶质瘤发展相关的基因变异的作用。

NID2（nidogen-2）作为细胞粘附蛋白，能够结合胶原蛋白I和IV以及层粘连蛋白，参与了许多生理和病理过程中，通过调节胚胎发生、细胞粘附和迁移，以及癌症侵袭和转移。已有研究表明，NID2是多种癌症（如结直肠癌、乳腺癌、膀胱癌和口腔鳞状细胞癌）的预后生物标志物。作为潜在的脑肿瘤原性分子，NID2也被验证。由于目前关于NID2多态性与胶质瘤风险和预后相关性的研究较少，因此本研究旨在调查NID2基因的单核苷酸多态性（SNPs）对中国汉族人群胶质瘤风险和预后的影响。

研究资料来源

本文由来自中国西北大学和海南医学院的研究人员共同撰写，分别是Jie Hao、Congmei Huang、Weiwei Zhao、Lin Zhao、Xiuxia Hu、Wenjie Zhang、Le Guo、Xia Dou、Tianbo Jin和Mingjun Hu。研究发表于《Neuromolecular Medicine》期刊，文章收录于2024年第26卷第27页，于2023年7月24日提交，2023年10月5日被接受。

研究方法和过程

研究对象

本研究中的529例胶质瘤患者和478例健康对照来自中国西安长安区医院神经外科。从各医学院收集的患者均为中国汉族人，且首次诊断为胶质瘤，其中409例诊断为星形细胞瘤。根据世界卫生组织（WHO）对中枢神经系统肿瘤的分类，大部分患者在诊断后接受了手术、放疗或化疗。收集了所有受试者的社会人口学信息、临床信息以及随访数据。所有参与者均签署了书面知情同意书，并在研究前充分了解研究信息。研究获得了西安长安区医院伦理委员会的批准，实验程序符合《赫尔辛基宣言》。

SNP基因分型

通过Ensembl数据库获得了NID2基因在染色体14位置的信息。根据1000基因组计划、dbSNP数据库以及Vannoportal数据库的打分原则，随机选择了4个小于0.05的次等位基因频率（MAF）和大于95%的呼叫率的SNP进行后续研究。随后，采用全血基因组DNA分离试剂盒提取样本DNA，并使用纳米滴2000（Thermo Fisher Scientific）测量DNA浓度。使用基于基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱法（MALDI-TOF MS）的高通量平台Agena MassARRAY进行基因分型，并通过Agena Typeranalyzer软件解释和组织检测结果。同时，对约5%的样本进行了随机再基因分型，重复基因分型的一致性为100%。

统计分析

使用Mann–Whitney U和χ2检验评估研究对象临床特征的差异。使用Plink 1.90程序在不同的遗传模型（等位基因、共显性、显性、隐性和加性模型）下进行NID2变体与胶质瘤风险关联分析。应用二项逻辑回归检测两个位点（SNPs）间的成对基因互作，通过SPSS 26.0软件进行统计分析。Kaplan–Meier法用于绘制总生存率（OS）和无进展生存率（PFS）曲线。

研究结果

研究对象特征

研究对象分为529例胶质瘤患者（284男性，245女性）和478例健康对照（255男性，223女性），平均年龄分别为40.55 ± 18.10岁和40.00 ± 13.84岁。两组在人口统计学变量（如年龄、性别、吸烟状态、饮酒习惯和BMI）上无显著差异。星形细胞瘤患者约占所有胶质瘤患者的77.30%。

NID2 SNPs与胶质瘤风险的关联

按照调整协变量的前提下，使用五种遗传模型调查NID2多态性与胶质瘤风险的关系。结果显示，在等位基因模型下，rs11846847和rs1874569显著增加了胶质瘤风险。此外，rs1874569还显著与胶质瘤患者的较差预后相关，特别是CC基因型与高等级胶质瘤患者的整体生存期和无进展生存期较短相关。

回归分析

通过Kaplan–Meier生存分析和Cox比例风险回归分析发现，rs11846847在年龄小于40岁的人群中显著增加胶质瘤风险，而rs1874569在喝酒的人群中有显著的胶质瘤风险相关性。与此同时，Gross Total Resection手术或化疗在中国汉族胶质瘤患者中的预后改善。这表明，NID2变体可能是肿瘤进展调控的驱动因子。

结论与价值

这是首次提供NID2 SNPs与胶质瘤风险和预后相关性证据的研究，表明NID2变体可能是胶质瘤的潜在风险因素。该研究不仅在理论上填补了关于中国汉族人群的相关研究空白，还为未来的医学检测和治疗策略提供了新的思路和方法，凸显了其科学价值和应用价值。

尽管研究存在一定局限性，如样本单一和未考虑某些高风险环境因素，但研究结果无疑为进一步探索胶质瘤的发病机制提供了宝贵的数据支持。未来将扩大样本规模，补充更多数据信息，以全面评估NID2与胶质瘤风险和预后的关系。

本文所进行的研究为NID2基因SNP与中国汉族人群胶质瘤风险及预后之间的关联提供了初步证据，具有重要的潜在应用价值。