MGA 删除通过调节线粒体氧化磷酸化促进Richter转化 本篇文章主要围绕慢性淋巴细胞白血病（chronic lymphocytic leukemia，CLL）转化为侵袭性淋巴瘤，即里希特转化（Richter’s Transformation，RT），探讨了MGA（Max基因关联）的功能和分子机制。MGA是一种功能性MYC抑制因子，在CLL中的突变率为3%，而在RT中则升高至36%。鉴于MGA突变在RT中的频繁出现，但其在CLL转化成RT过程中的具体作用和机制仍不明，本研究通过建立MGA基因敲除鼠来探索其在RT中的角色。 学术背景与研究目的 RT是CLL进展为侵袭性淋巴瘤的过程，主要转化为弥漫性大B细胞淋巴瘤（diffuse large B-cell lymphoma，DLBCL），其预后...

呼吸机患者膈肌肌肉的超松弛肌球蛋白对膈肌功能衰退的影响 背景介绍 在重症监护病房（ICU）中接受机械通气的患者中，膈肌收缩力弱是一种常见问题。这导致患者脱机困难，增加了病死率，也带来了巨大的经济负担。尽管动物研究显示药物干预的潜在好处，但我们对其分子机制的理解仍不完整，因此目前尚无有效治疗方法来改善这些患者的膈肌强度。研究者们发现，约80%的接受机械通气的ICU患者在脱机时会出现膈肌功能衰退，传统上认为这是由于膈肌萎缩导致的，但超过50%的ICU患者并未出现膈肌萎缩，提示可能有其他因素在起作用。 来源介绍 这篇论文由Marloes van den berg、Zhonghua Shi、Wout J. Claassen等多名作者联合研究完成，主要作者隶属于Amsterdam UMC、Bispeb...

“Revisiting Distinct Nerve Excitability Patterns in Patients with Amyotrophic Lateral Sclerosis” 学术背景 肌萎缩侧索硬化症（Amyotrophic Lateral Sclerosis, ALS）是一种毁灭性的神经退行性疾病，表现为中枢和外周运动神经元的逐渐丧失。虽然该疾病在临床和遗传上具有异质性，但轴突高兴奋性是普遍观察到的现象，被认为是神经退行性过程中的早期病理生理步骤。因此，阐明导致轴突高兴奋性的机制及其与患者临床特征的关系显得尤为重要。外周神经兴奋性测量值通过神经兴奋性记录直接得出，尽管其生物物理基础难以推断。数学模型可以帮助解释这些数据，但只有在应用于组平均记录时才可靠，限制了其在个体患...

Alzheimer’s病中基于CRISPR-Cas的表观基因组编辑：通过光诱导蛋白质递送系统优化的工程外泌体 背景介绍 阿尔茨海默病（Alzheimer’s Disease, AD）是一种常见的神经退行性疾病，特征是认知功能和记忆力逐渐下降，而目前对该疾病的治疗方法仍然有限。基因组编辑技术，如CRISPR-Cas9，和表观基因组编辑技术在治疗各种疾病中展示出巨大的潜力。然而，将这些功能性蛋白质高效地递送到细胞内部一直是一个巨大的挑战。外泌体是由细胞自然分泌的纳米级囊泡，可以作为递送治疗性生物分子的载体，具有稳定性、高生物相容性和低免疫原性等优势。 研究来源 本文发表在2024年8月7日的《Science Translational Medicine》上，题为“Engineered Exoso...

胰岛素受体重新激活能恢复早期缺乏Lepr的小鼠脑功能 背景介绍 肥胖是由过量脂肪积累引起的慢性疾病，影响了身体和大脑的健康。胰岛素受体（Leptin receptor, Lepr）的缺乏被认为是肥胖发病机制中的一个重要因素。胰岛素在多个神经过程和关键发育环节中起着重要作用。之前的研究表明，幼年时期的胰岛素缺乏会导致青年小鼠的永久性发育问题，如能量稳态失衡、黑皮质素系统和生殖系统的改变以及脑质量的减少。在人体研究中，肥胖与脑萎缩和认知损伤相关，因此有必要确定幼年时期的胰岛素缺乏对大脑结构和记忆功能的长期影响。 研究来源 此篇论文由Caroline Fernandes等一众科研人员撰写，主要来自Federal University of Rio de Janeiro、Queen’s Univer...

小鼠卵泡发育中卵母细胞与颗粒细胞间的转录组动力学及细胞对话研究 概述 卵泡的发育与成熟是一个复杂且多阶段的过程。在此过程中，卵母细胞及其周围体细胞的动态基因表达和它们之间的对话起着关键作用。本研究通过精确分类卵母细胞和卵泡发育阶段，并分析小鼠卵母细胞及其周围颗粒细胞和积液细胞的基因表达，揭示了这些细胞在不同发育阶段的转录组变化和细胞间的对话机制。本研究由Wenju Liu、Chuan Chen、Yawei Gao、Xinyu Cui等人完成，作者来自同济大学、南京医科大学等机构，成果发表在2024年的《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》期刊上。 研究背景 卵母细胞起源于原始生殖细胞，并在卵泡内发育。卵母细胞和卵泡的发育是一个多阶段的过程，通常通过卵泡...

综合单细胞多组学HIV潜伏逆转研究揭示病毒再活化的全新调控因子 该篇题为《integrated single-cell multiomic analysis of hiv latency reversal reveals novel regulators of viral reactivation》的论文，由Manickam Ashokkumar、Wenwen Mei等多位研究者共同完成，分别来自于美国北卡罗来纳大学教堂山分校（University of North Carolina at Chapel Hill）和德州农工大学（Texas A&M University）等多家机构，并于2024年6月20日提前发表在《Genomics, Proteomics & Bioinformatics...

小细胞肺癌的蛋白质组学分型：预后和治疗方案分析 研究背景 小细胞肺癌（Small Cell Lung Cancer, SCLC）是一种高度恶性且异质性强的癌症，其快速生长、早期转移及耐药性使得治疗手段有限，预后预测模型也有待改进。目前已知的基因组分析大多集中在TP53和RB1失活，这两种基因在超过98%的SCLC患者中出现异常。此外，PI3K/AKT/mTOR通路的基因突变也频繁出现。然而，SCLC的有效分型标志物和治疗靶点依然有限。这就导致尽管在过去几十年间进行了许多化疗方案和生物制剂的临床试验，但患者总生存率并未显著改善。当前的5年生存率约为20%-25%（局限期SCLC, LS-SCLC）和1%-2%（广泛期SCLC, ES-SCLC），使得SCLC成为最致命的癌症之一。 早期的细胞系...

基因集合评分工具对单细胞ATAC-seq数据的基准测试 作者： Xi Wang, Qiwei Lian, Haoyu Dong, Shuo Xu, Yaru Su, Xiaohui Wu 单位： Pasteurien College（苏州大学苏州医学院），厦门大学自动化系，福州大学数学与计算机科学学院 通讯作者： xhwu@suda.edu.cn 期刊： 《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》 发布日期： 2024年2月9日（在线公布） 导论 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）是一种强大且常用的表观基因组技术，通过测序分析全基因组范围内的染色质可及性。近来，单细胞ATAC-seq（scATAC-seq）技术使得研究单细胞中的染色质可及性成为可能，...

猴痘病毒蛋白序列和密码子使用的分子进化 研究背景 2022年的猴痘病毒（Monkeypox virus, MPXV）疫情引发了全球公共卫生的巨大关注。然而，猴痘病毒的进化机制仍未被完全了解。猴痘病毒是一种线性双链DNA病毒，属于痘病毒科Poxviridae，弦状痘病毒亚科Chordopoxvirinae和正痘病毒属Orthopoxvirus。其基因组约为197 kb，编码约200个基因。猴痘病毒可以感染多种动物，包括人类、非人灵长类和啮齿动物。与天花病毒（Variola virus, VARV）和牛痘病毒（Vaccinia virus, VACV）类似，猴痘病毒也能导致人类疾病和死亡。 猴痘病毒最早于1958年在丹麦的一个动物设施中被发现，1970年首次在刚果民主共和国的人类病例中分离出来。...