AlphaFoldを用いた阻害性タンパク質フラグメントのハイスループット発見

高精度で蛋白フラグメントの抑制活性を予測する新方法:FragFoldの応用 学術背景 蛋白質間相互作用は細胞生命活動において重要な役割を果たし、ペプチド(peptides)や蛋白フラグメント(protein fragments)は特定の蛋白質界面に結合して、蛋白質機能を調節したり、甚至抑制剤として機能したりします。近年、高スループット実験技術の発展により、生細胞中での大量の蛋白フラグメントの抑制活性を測定することが可能になりました。しかし、これまで計算方法が存在せず、どの蛋白フラグメントが目標蛋白質と結合し、抑制作用を発揮するか、さらにはその結合モードを予測することはできませんでした。この研究領域の空白を埋めるために、研究者は新しい計算ツールを開発しました。 AlphaFoldの登場は蛋白質...

ω-3脂肪酸が2型糖尿病患者の高中性脂肪血症、リピドミクス、および腸内マイクロバイオームに与える影響

Omega-3脂肪酸対2型糖尿病患者の脂質および腸内細菌叢への影響に関する研究 背景紹介 2型糖尿病(Type 2 Diabetes, T2D)は、世界中で一般的な代謝疾患であり、高トリグリセライド血症(Hypertriglyceridemia, HTG)などの脂質異常を伴うことが多い。脂質異常は心血管疾患(Cardiovascular Disease, CVD)の重要なリスク要因であり、特に高トリグリセライド(Triglycerides, TG)レベルは心血管イベントの発生と密接に関連しています。ステアチン系薬剤がコレステロール制御において著しい効果を示しているものの、高トリグリセライド血症は依然として解決すべき臨床的な問題です。 オメガ-3脂肪酸、特に魚油に豊富に含まれるエイコサペンタエ...

GNAO1脳症の亜鉛治療:臨床前プロファイリングと臨床例

GNAO1(Gタンパク質αサブユニットO1)遺伝子の突然変異は、重度の小児脳症の主要な原因の一つと考えられています。この脳症は通常、てんかん、運動障害、発達遅延、知的障害などの症状を示し、既存の治療法では効果が限定的です。GNAO1遺伝子がコードするGαOタンパク質は、神経細胞のシグナル伝達に重要な役割を果たしており、その突然変異によりシグナル伝達に異常が生じ、一連の神経系疾患を引き起こします。これまでの研究では、亜鉛塩(zinc salts)がGNAO1突然変異タンパク質の機能異常を部分的に矯正できることが示されていますが、その具体的な作用メカニズムや臨床応用の安全性は十分に検証されていません。 本稿では、系統的な前臨床研究と初の人間試験を通じて、亜鉛塩がGNAO1関連脳症の治療における有...

G-四重鎖はエネルギー地形を再形成することでタンパク質の折りたたみを触媒する

G-四重鎖が蛋白質折りたたみを触媒する研究報告 学術的背景 蛋白質の折りたたみは、生物体内で複雑かつ未解決の問題である。多くの蛋白質はin vitro(体外)での折りたたみ速度が非常に遅く、生理条件での許容範囲をはるかに超えている。この課題に対処するために、ATP(アデノシン三リン酸)依存の分子シャペロン(chaperonins)が蛋白質の折りたたみを加速し、生理的に許容される時間内に完了すると考えられている。しかし、この能力がATP依存のシャペロンにのみ限られるかどうかは未解明である。本研究の核心は、他の分子がATP依存のシャペロンと同様に蛋白質の折りたたみを触媒し、細胞がより短時間で蛋白質の折りたたみを完了するのを助けるかどうかを探索することである。 G-四重鎖(G-quadruplex...

ウェーブレットを用いた金融価格ジャンプの新たなクラスの識別

小波分析に基づく金融価格ジャンプの新しいクラスの識別に関する研究報告 学術背景 金融市場における価格ジャンプ(price jumps)とは、非常に短時間に価格が大幅に変動する現象を指し、通常は外生的要因(ニュースの発表など)または内生的要因(市場内部のフィードバックメカニズム)によって引き起こされます。これらの2つの異なるタイプの価格ジャンプを区別することは、市場のダイナミクスを理解し、極端なイベントを予測し、効果的な規制戦略を策定するために重要です。しかし、既存の研究方法は監視学習に依存することが多く、明確なラベル(ニュースイベントなど)が必要で、実際の応用では多くの価格ジャンプが明確なニュースの背景を持たないため制限があります。 より良い価格ジャンプの識別と分類、特に明確な外生的トリガー...

タリンABSSとF-アクチン相互作用の生化学的および構造的基盤

学術的背景 細胞生物学において、フォーカルアデヘッション(focal adhesions, FAs)は細胞と細胞外基質(ECM)の間の重要な接続点であり、インテグリン受容体を介して細胞内のアクチン骨格とつながり、細胞移動や極性化に重要な役割を果たします。Talinはフォーカルアデヘッションの中心的なタンパク質で、インテグリン受容体とアクチン骨格を直接つなぎます。Talinタンパク質には3つのアクチン結合部位(actin-binding sites, ABSs)があり、これらの部位はフォーカルアデヘッションの形成と成熟の過程で異なる役割を果たします。しかし、TalinがどのようにF-アクチンと相互作用するのか、特にTalinのABSsがF-アクチンにどのように結合するのかについては、まだ完全に...

左右非対称性の胎生発達における早期起源 学術背景 動物界において、双方向対称性(bilateral symmetry)は広く存在する身体構造の特徴です。しかし、脊椎動物は外見上双方向対称性を示す一方で、内部器官では左右(left-right, LR)非対称性を示します。この非対称性は、特に鳥類や哺乳類などの羊膜動物の胎生発達において重要な役割を果たし、胚が発達する過程で双方向対称性から左右非対称性に変化します。近年、科学者たちはこの変化のメカニズムについて深く研究してきましたが、特にHensen’s node(Hensenノード)が左右非対称性形成に果たす役割についてです。しかし、左右非対称性が最初にいつ現れるのか、その背後の物理的メカニズムについては未解明な点が多くあります。 本研究では、...

霊長類の腹側前運動皮質における時間知覚の文脈的神経ダイナミクス

腹側前運動皮質における時間知覚の神経動態に関する研究 学術背景 時間知覚は神経科学研究の中心的な問題の一つであり、特に認知的要求が変化する際に大脳がどのように時間を符号化するかが重要な課題です。時間は「長」または「短」と分類されるか、または連続的な時間間隔として正確に表現されます。腹側前運動皮質(ventral premotor cortex, VPC)は複雑な時系列処理、例えば言語処理において重要な役割を果たしますが、その時間推定における具体的な役割はまだ十分に探求されていません。本研究では、霊長類が時間間隔比較タスク(time interval comparison task, TICT)と時間間隔分類タスク(time interval categorization task, TCT)...

ヘッドマウント型視線追跡を用いた自由行動中のマーモセットの視覚研究

猿類の自由な活動中の視覚行動研究:革新的な眼動追跡システムの開発と応用 学術的背景 視覚システムは、特に大脳皮質内の視覚経路のメカニズムにおいて、霊長類の神経系の中で最も深く研究されている領域の一つです。しかし、現在までに霊長類が現実世界の環境で自由に活動し、探求する際の視覚機能に関する研究は非常に限られています。この研究の空白は、主に自由に活動する個体の目の動きを正確に、高速かつ高解像度で追跡できる技術の欠如によるものです。従来の研究方法では、通常動物を頭部固定して実験室内で観察するため、自然な行動における視覚システムの理解が制限されていました。したがって、動物の自由な活動を制限せずに目の動きを正確に記録できる技術を開発することは重要な研究方向となりました。 論文の出典 「Active v...

セマンティック分析と神経画像メタ分析によるドメイン一般覚醒の証拠は、覚醒に関する相反する見解を調和させます

「ドメイン一般性覚醒」に関する神経科学研究レポート 学術背景 覚醒(Arousal)は、神経科学の核心概念であり、大脳と身体状態の変動を指し、通常は動機付けられた行動と関連しています。覚醒という用語は広く使用されていますが、その定義は不明確で、教科書によって異なる解釈があります。一つの見解では、覚醒は多様な生物過程の抽象的な反映であるとされ、別の見解では共通の神経学的基礎があるとされます。この概念的な対立により、覚醒の分類と定義は解決すべき重要な問題となっています。さらに、覚醒に関する科学文献は非常に豊富(約50,000編の論文)ですが、系統的なレビューやデータ駆動型の分析による本質の解明はこれまでありませんでした。この空白を埋めるために、本研究では大規模テキストマイニング技術と神経イメージ...