GCLink : un cadre de prédiction de liens par contraste graphique pour l'inférence de réseaux de régulation génique

Contexte de la recherche Les réseaux de régulation génique (Gene Regulatory Networks, GRNs) sont des outils essentiels pour comprendre les processus biologiques complexes à l’intérieur des cellules. Ils révèlent les interactions entre les facteurs de transcription (Transcription Factors, TFs) et les gènes cibles, contrôlant ainsi le processus de tr...

Alignement de trajectoire de la dynamique d'expression génique

Le séquençage de l’ARN monocellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) a fourni une résolution sans précédent pour étudier la dynamique de l’expression génique au cours du développement et de la différenciation cellulaire. Cependant, en raison de la complexité des processus biologiques, les trajectoires de développement cellulaire dans diffé...

Stockage efficace et calcul de régression pour les études de séquençage du génome à l'échelle de la population

Avec la popularité croissante des biobanques de population à grande échelle, le potentiel des données de séquençage du génome entier (Whole Genome Sequencing, WGS) dans la recherche sur la santé humaine et les maladies a été considérablement renforcé. Cependant, les énormes besoins en calcul et en stockage des données WGS posent des défis majeurs a...

Marqueurs cliniques et génétiques de la toxicité vasculaire chez les patients atteints de glioblastome : perspectives de NRG Oncology RTOG-0825

Marqueurs cliniques et génétiques de la toxicité vasculaire chez les patients atteints de glioblastome : enseignements de NRG Oncology RTOG-0825 Contexte académique Le glioblastome (GBM) est une forme de cancer du cerveau hautement agressive, représentant près de 80 % des tumeurs cérébrales primaires malignes. Bien que le traitement standard inclue...

Réanalyse génomique d'une ressource européenne pour les maladies rares aboutit à de nouveaux diagnostics

Réanalyse des données génomiques des maladies rares en Europe : nouveaux diagnostics et perspectives futures Contexte académique Les maladies rares sont définies comme des affections qui touchent une faible proportion de la population, avec un seuil de moins de 50 personnes sur 100 000 dans l’Union européenne. Bien qu’il existe plus de 6 000 types ...

Édition de base à haute efficacité dans la rétine des primates et des tissus humains

Édition de bases à haute précision dans la rétine chez les primates et les tissus humains Contexte de l’étude La maladie de Stargardt est une maladie neurodégénérative héréditaire actuellement incurable, principalement causée par des mutations avec perte de fonction dans le gène ABCA4, entraînant une dégénérescence maculaire et la cécité. Le gène A...

Une voie hormone-neuropeptide inhibe la réceptivité sexuelle chez les femelles de Drosophila immatures

Une voie hormone-neuropeptide inhibe le comportement de réceptivité sexuelle chez les femelles drosophiles immatures Contexte académique La maturation sexuelle est un événement clé du développement qui marque la transition entre la période juvénile et l’âge adulte, accompagnée de multiples changements physiologiques et comportementaux. Chez la dros...

Les niveaux de PTDP-43 corrèlent avec des altérations moléculaires spécifiques au type cellulaire dans le cortex préfrontal des patients atteints de C9orf72 ALS/FTD

Corrélation entre les niveaux de PTDP-43 et les altérations moléculaires spécifiques aux types cellulaires dans le cortex préfrontal des patients atteints de C9orf72 ALS/FTD Introduction La sclérose latérale amyotrophique (Amyotrophic Lateral Sclerosis, ALS) et la démence frontotemporale (Frontotemporal Dementia, FTD) sont deux maladies neurodégéné...

Identification des mutants faux-sens de la polycystine 2 ciblés pour la dégradation associée au réticulum endoplasmique

Identification des mutants de polycystine 2 ciblés pour la dégradation associée au réticulum endoplasmique Contexte académique La polykystose rénale autosomique dominante (PKDAD) est une maladie génétique courante qui conduit finalement à l’insuffisance rénale terminale. La PKDAD est principalement causée par des mutations dans les gènes PKD1 et PK...

Cartographie de l'étiologie cellulaire de la schizophrénie et des phénotypes cérébraux complexes

Classification des types cellulaires des maladies mentales : une nouvelle étude révèle les bases cellulaires de maladies cérébrales complexes comme la schizophrénie Contexte académique Les maladies mentales, telles que la schizophrénie, la dépression et le trouble bipolaire, sont des problèmes de santé publique majeurs à l’échelle mondiale. Ces mal...