Le séquençage du génome complet révèle l’octoploïdie autosomique et la trajectoire évolutive de l’esturgeon chinois Contexte L’esturgeon chinois (Acipenser sinensis), membre de la sous-classe des esturgeons, est un groupe de poissons ancien. En raison de sa structure génomique unique et de sa valeur économique, la protection et l’étude de l’esturge...
Test de référence des outils de notation des ensembles de gènes pour les données scATAC-seq Auteurs : Xi Wang, Qiwei Lian, Haoyu Dong, Shuo Xu, Yaru Su, Xiaohui Wu Affiliations : Pasteurien College (École de médecine de Suzhou, Université de Suzhou), Département d’automatisation de l’Université de Xiamen, École de mathématiques et d’informatique de...
Évolution moléculaire des séquences protéiques et de l’utilisation des codons du virus de la variole du singe Contexte de recherche L’épidémie de virus de la variole du singe (Monkeypox virus, MPXV) en 2022 a suscité une grande attention mondiale en matière de santé publique. Cependant, les mécanismes d’évolution du virus de la variole du singe ne ...
Les données multi-omiques révèlent l’influence du butyrate de sodium sur l’expression génique et la modification des protéines chez les Streptomyces Contexte académique Les Streptomyces attirent une grande attention en raison de leurs riches groupes de gènes et de leur potentiel à produire une grande quantité de produits naturels. Les inhibiteurs d...
Grepore-seq : un flux de travail robuste pour détecter les changements post-édition génique par PCR à longue portée et séquençage nanopore Contexte de la recherche Le système CRISPR/Cas9, en tant que système d’endonucléase ADN guidé par ARN, a été largement utilisé dans l’édition génomique. Avec l’augmentation continue de son potentiel dans les tra...
Comparaison entre SaCas9 et SpCas9 pour une haute fidélité et différents résultats d’édition génique Contexte de la recherche Les systèmes CRISPR basés sur la protéine Cas9 sont devenus des outils puissants pour l’édition génomique, largement utilisés dans la recherche fondamentale et la thérapie génique clinique. Actuellement, les variantes de Cas...
Sensibilité élevée du séquençage métagénomique à haut débit dans les biopsies de tissus coliques : élimination de l’impact de l’ADN de l’hôte Contexte L’évaluation de la structure taxonomique bactérienne par des techniques de séquençage de nouvelle génération sans culture est devenue une méthode courante pour étudier la relation entre le déséquilib...
Techniques d’omique unicellulaire pour décoder la biologie humaine et les maladies Contexte La cellule est l’unité fondamentale de la vie. Un seul ovule fécondé peut se développer en un corps humain complexe composé d’environ 37 000 milliards de cellules, organisées en divers tissus, organes et systèmes. Les méthodes traditionnelles de classificati...
Intégration Multi-Omique Dépendante du Temps dans la Dysfonction Hépatique Associée à la Septicémie Introduction La septicémie, en particulier dans les cas graves, provoque une défaillance multisystémique due à une infection généralisée, tuant jusqu’à 5 millions de personnes chaque année dans le monde. Traditionnellement, la dysfonction hépatique a...
Application des défauts de réparation par recombinaison homologue (HRD) dans l’évaluation des patients atteints de cancer et la planification du traitement Contexte La recombinaison homologue (HR) est un mécanisme important pour réparer les cassures double-brin de l’ADN (DSBs). Cependant, lorsque des gènes clés de la voie de réparation HR subissent...