Des mutations bialléliques dans le gène SNUPN causent une dystrophie musculaire des ceintures avec des caractéristiques myofibrillaires Contexte académique Les dystrophies musculaires sont un groupe de maladies neuromusculaires complexes et hétérogènes caractérisées par une faiblesse musculaire progressive et une atrophie dues à la perte de fibres ...
Étude de la dynamique transcriptomique et du dialogue cellulaire entre les ovocytes et les cellules granuleuses au cours du développement folliculaire chez la souris Aperçu Le développement et la maturation des follicules est un processus complexe et multi-étapes. Au cours de ce processus, l’expression dynamique des gènes dans les ovocytes et les c...
Une étude intégrée de l’omique unicellulaire sur la réversion de la latence du VIH révèle de nouveaux régulateurs de la réactivation virale Cet article intitulé “Integrated single-cell multiomic analysis of HIV latency reversal reveals novel regulators of viral reactivation” a été réalisé conjointement par Manickam Ashokkumar, Wenwen Mei et plusieu...
Le séquençage du génome complet révèle l’octoploïdie autosomique et la trajectoire évolutive de l’esturgeon chinois Contexte L’esturgeon chinois (Acipenser sinensis), membre de la sous-classe des esturgeons, est un groupe de poissons ancien. En raison de sa structure génomique unique et de sa valeur économique, la protection et l’étude de l’esturge...
Test de référence des outils de notation des ensembles de gènes pour les données scATAC-seq Auteurs : Xi Wang, Qiwei Lian, Haoyu Dong, Shuo Xu, Yaru Su, Xiaohui Wu Affiliations : Pasteurien College (École de médecine de Suzhou, Université de Suzhou), Département d’automatisation de l’Université de Xiamen, École de mathématiques et d’informatique de...
Évolution moléculaire des séquences protéiques et de l’utilisation des codons du virus de la variole du singe Contexte de recherche L’épidémie de virus de la variole du singe (Monkeypox virus, MPXV) en 2022 a suscité une grande attention mondiale en matière de santé publique. Cependant, les mécanismes d’évolution du virus de la variole du singe ne ...
Les données multi-omiques révèlent l’influence du butyrate de sodium sur l’expression génique et la modification des protéines chez les Streptomyces Contexte académique Les Streptomyces attirent une grande attention en raison de leurs riches groupes de gènes et de leur potentiel à produire une grande quantité de produits naturels. Les inhibiteurs d...
Grepore-seq : un flux de travail robuste pour détecter les changements post-édition génique par PCR à longue portée et séquençage nanopore Contexte de la recherche Le système CRISPR/Cas9, en tant que système d’endonucléase ADN guidé par ARN, a été largement utilisé dans l’édition génomique. Avec l’augmentation continue de son potentiel dans les tra...
Comparaison entre SaCas9 et SpCas9 pour une haute fidélité et différents résultats d’édition génique Contexte de la recherche Les systèmes CRISPR basés sur la protéine Cas9 sont devenus des outils puissants pour l’édition génomique, largement utilisés dans la recherche fondamentale et la thérapie génique clinique. Actuellement, les variantes de Cas...
Sensibilité élevée du séquençage métagénomique à haut débit dans les biopsies de tissus coliques : élimination de l’impact de l’ADN de l’hôte Contexte L’évaluation de la structure taxonomique bactérienne par des techniques de séquençage de nouvelle génération sans culture est devenue une méthode courante pour étudier la relation entre le déséquilib...