患者由来のミニ結腸は腫瘍微小環境の複雑性を長期モデリングすることを可能にする

患者由来のミニ結腸は腫瘍微小環境の複雑性を長期モデリングすることを可能にする

患者由来のミニコロンを用いた腫瘍微小環境の複雑性の長期モデル 背景紹介: 腫瘍とその周囲の微小環境との相互作用は、がんの発展と治療に深い影響を与えます。しかし、既存のin vitro腫瘍モデルは、これらの複雑な相互作用を捉える能力に欠けています。この問題を解決するため、本研究では、患者特有のがん細胞とその微小環境に基づくミニコロンモデルを革新的に開発し、がん治療のための新しい実験プラットフォームを提供しました。 研究チームと出版情報: この研究は、スイス連邦工科大学ローザンヌ校(EPFL)幹細胞生物工学研究所のL. Francisco Lorenzo-Martinらの指導の下、複数の研究機関が共同で行いました。研究成果は『ネイチャー・バイオテクノロジー(Nature Biotechnolog...

シンテニー分析を用いた複雑な微生物群の株追跡により種ごとの進化モードが明らかに

複雑な微生物群集における遺伝子配列分析を用いた菌株追跡による種特異的進化パターンの解明 背景紹介 微生物の集団は、単一ヌクレオチドの変異と構造変化(組換え、挿入、欠失など)を通じて異なる菌株に分化します。大多数の菌株比較方法は主に単一ヌクレオチド多型(SNP)の差異を量化し、構造変化を無視しています。しかし、組換えは多くの種(ヒト病原体を含む)の表現型の多様化の重要な推進要因です。本稿では、SynTrackerと呼ばれるツールを紹介します。このツールは遺伝子配列(ゲノム内の相同領域のシーケンスブロックの順序)を使用して微生物菌株を比較します。遺伝子配列は既存の菌株比較ツールによって十分に活用されていない豊富なゲノム情報源です。SynTrackerはSNP感度が低く、データベースを必要とせず、...

単一サンプルの腫瘍サブクローン再構築のクラウドソースベンチマーク

群体リソースに基づく単一サンプル腫瘍サブクローン再構築アルゴリズム 背景紹介 癌の進化過程と腫瘍の遺伝的異質性は、現代腫瘍学研究の重要な分野です。腫瘍は正常細胞から進化し、体細胞変異を獲得することで徐々に発展します。これらの変異は細胞クロマチン構造や内因性及び外因性の誘変圧力の影響を受け、確率的に発生します。特定の変異が細胞に選択的優位性を提供すると、その子孫細胞は局所環境で拡大することができます。長年の蓄積を経て、最終的に多くの癌の特性を持つ細胞集団、すなわちクローンが形成されます。異なる腫瘍細胞亜群(サブクローン)は、ドリフトまたは選択圧力を通じて細胞集団内に出現します。この進化的特徴は臨床上重要であり、遺伝的異質性は予後不良、変異の多さ、耐薬性に関連しています。そのため、腫瘍の進化過程...

代谢工学と生物触媒を通じた高収率ポルフィリン生産

代谢工学と生物触媒を通じた高収率ポルフィリン生産

研究背景 葉緑素及びその誘導体は医学、食品、エネルギー、材料分野において広く応用されているが、これらの化合物の効率的な生産には大きな課題がある。研究者は紫色非硫光合成細菌 Rhodobacter sphaeroides を効果的な細胞工場として利用し、酵素触媒と代謝工学を組み合わせて葉緑素化合物を生産した。 研究過程 プロセス設計 研究プロセスには遺伝子編集、発酵の促進、代謝調節および酵素催化のステップが含まれる。 遺伝子編集 研究チームはCRISPRiスクリーニングを通じて R. sphaeroides 内でターゲット遺伝子heMNを特定し、これによりcoproporphyrin III(CPIII)生産の改善が可能となった。 発酵の促進 PrrAB二成分系の時間調節と連続バッチ発酵戦略の...

中枢神経系自己免疫疾患患者における抗BCMA CAR T細胞療法の単細胞分析

中枢神经系统(CNS)自身免疫性疾病,如視神経脊髄炎スペクトラム障害(NMOSD),は視神経炎と脊髄炎の再発を特徴とする炎症性自身免疫脱髄疾患です。NMOSDの治療において重大な進展があるにもかかわらず、一部の患者は現行の治療に反応せず、病状が反復し治癒が難しい場合があります。これは、現在の治療法がCNS内の免疫失調を効果的にターゲットにできていない可能性があります。抗水チャネルプロテイン4(AQP4)免疫グロブリンG(IgG)は抗体依存性細胞媒介性細胞毒性および補体依存性細胞毒性を含む多様な経路を通じてCNS脱髄損傷を引き起こします。 キメラ抗原受容体(CAR)T細胞治療は血液癌の長期管理において潜在能力を示し、いくつかの難治性自身免疫疾患の治療において初期効果を示しています。しかし、CA...

酸化リン酸化はB細胞効果因子サイトカインを調節し、多発性硬化症における炎症を促進する

酸化リン酸化が B 細胞のエフェクターサイトカインを調節し、多発性硬化症における炎症反応を促進する 背景紹介 近年、B細胞の抗体非依存機能が健康および疾患において注目されており、特にさまざまなサイトカインを分泌する能力が話題となっている。これらの因子は局所免疫反応を活性化または抑制することができる。研究によると、B細胞のサイトカインの不調整は、複数の免疫介在性疾患、特に多発性硬化症(Multiple Sclerosis, MS)の原因の一つである。しかし、B細胞のサイトカイン発現の調節メカニズムについては依然として限られた理解しかない。本論文では、炎症促進性(例:GM-CSF表現)および抗炎症性(例:IL-10表現)のB細胞サイトカインの分泌がどのように調節されるか、特に酸化リン酸化(Oxi...

核塩基アダクトはMR1に結合し、MR1制限T細胞を刺激する

核酸塩基付加物がMR1と結合しMR1制限性T細胞を刺激 摘要 本論文は、VacchiniらによるMR1制限性T細胞(MR1T細胞)に関する最新の研究成果を概説している。この研究では、リボ核酸塩基付加物がMR1T細胞抗原として存在することを発見し、それらが腫瘍細胞内での代謝経路と生理機能を明らかにした。研究成果は、生理および病理条件下におけるMR1T細胞の役割とその治療潜力の理解に重要な意義を持つ。 研究背景 MR1T細胞は新しく発見されたT細胞サブセットで、微生物感染に依存せずにMR1分子によって提示される自己抗原を認識することができる。現在、MR1T細胞の自己抗原の性質は明確ではなく、それが生理機能と治療潜力の理解を妨げている。本研究は、遺伝子、薬理学、および生化学的手法を組み合わせて、M...

TREM2欠損が腸マクロファージと微生物群を再プログラムして抗PD-1腫瘍免疫療法を強化

TREM2欠損による腸管マクロファージと微生物叢の再構築による抗PD-1腫瘍免疫療法の強化 ワシントン大学医学校の研究チーム、ブランダ・ディ・ルッチアなど複数の科学者が率いるグループは、先ごろ「Science Immunology」誌に研究論文を発表し、腸管微生物叢および腫瘍関連マクロファージがどのように抗PD-1免疫チェックポイント阻害治療に影響を与えるかを明らかにしました。この研究は、マクロファージ上のトリガーレセプターTREM2をブロックまたは削除することで、体内の抗腫瘍T細胞応答を強化することができることを確認し、TREM2欠損マウスでは抗PD-1治療後、腸管マクロファージが炎症促進状態に転じ、腸管微生物叢内のルミノコッカス属細菌(Ruminococcus gnavus)が増加するこ...

B7H6リガンドがT細胞反応に与える影響

免疫グロブリン超ファミリーリガンド B7H6 が T 細胞反応を NK 細胞の監視下に置く 背景紹介 免疫学の分野では、T 細胞免疫の調節メカニズムを理解することが、自己免疫疾患、慢性感染症、およびがんなどの T 細胞機能不全に関連する病気に対する効果的な治療法を開発するために重要である。T 細胞はウイルス感染、腫瘍、および自己免疫において特異的な免疫反応を媒介し、抗原認識後に厳密に調節された増幅と持続性を経る。抑制性免疫細胞(例:T 調節細胞や一部の骨髄系細胞)は、チェックポイント分子や抑制性細胞因子を上方調節することで、体内の恒常性や自己耐性を維持するために T 細胞反応を弱める。しかし、T 細胞の活性化が失調すると、T 細胞が駆動する自己免疫や腫瘍に対する効果のない免疫反応を引き起こす...

IL-1β-Stat5軸の自己免疫性神経炎症における役割と潜在的な治療戦略

研究助力免疫神経炎症治療の重大突破 背景紹介 ステロイド抵抗性は多くの炎症性疾患の治療における重大な課題であり、特に自己免疫神経炎症(autoimmune neuroinflammation)において大きな問題となっています。これらの疾患において、TH17 細胞(T helper 17 cells)がステロイド抵抗性を引き起こす主要因と広く認識されていますが、その背後にあるメカニズムは完全には理解されていません。現在の研究は実験的自己免疫性脳脊髄炎(Experimental Autoimmune Encephalomyelitis, EAE)動物モデルに焦点を当てており、このモデルは中枢神経系(CNS)炎症の免疫病理メカニズムの研究に広く用いられています。本論文の核心的問題は、IL-1βおよ...