以下是《Nature Biotechnology》上发表名为”Multiplexed Orthogonal Base Editor (MOBE) Systems Development（多路复用正交基因编辑器（MOBE）系统的开发）”的学术报告的全文： 近年来，随着基因编辑工具的快速发展，特别是CRISPR-Cas9系统的引入，使得精确修饰特定DNA序列成为可能。当前，引入单碱基变异（Single-Nucleotide Variants，SNVs）作为研究基因功能和疾病关联性的有力工具，尤其在精准医学领域显得尤为重要。现有基因编辑工具在指向性编辑方面已展现出显著效能，但在同时引入多个点突变时常遇到问题，此时需要借助多路复用编辑系统来提升效率。 Quinn T. Cowan、Sifeng Gu...

引言 在新冠疫情的推动下，mRNA疫苗技术取得了显著进展，但其短半衰期和高剂量需求导致了副作用和可及性问题。为了克服这些挑战，自我扩增RNA（self-amplifying RNA, saRNA）成为了研究热点。saRNA利用来自甲病毒的RNA依赖RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, RdRP）进行自我复制，理论上可以通过减少剂量和注射频率来提高疫苗的效力和安全性。然而，saRNA的早期研究表明，其诱导的强烈干扰素（Interferon, IFN）响应会抑制抗原表达，降低疫苗效力。本研究旨在通过完全替代改性核苷酸，抑制干扰素响应，提高saRNA的长效蛋白表达和疫苗保护效力。 研究背景 本文的研究团队来自波士顿大学，包括生物医学工程系、生物设计中心、病毒学、...

AAV-SB-CRISPR筛查肿瘤内浸润的原代自然杀伤细胞揭示CAR-NK疗法的遗传性检查点 随着生物技术和基因编辑技术的飞速发展，对于提高自然杀伤（NK）细胞治疗癌症的临床潜力的研究愈发受到关注。尽管在临床治疗中充满潜力，但NK细胞疗法的成功受到多重限制的制约。在《Nature Biotechnology》上发表的一项最新研究中，研究人员基于原代NK细胞执行了一项体内腺相关病毒（AAV）-睡美人（Sleeping Beauty, SB）-CRISPR筛查，针对四种固态肿瘤小鼠模型的肿瘤浸润NK（TINK）细胞展开研究。与此同时，研究人员对TINK细胞进行了单细胞转录组景观的分析，并鉴定出了之前未曾探究的NK细胞亚群和差异表达的TINK基因。 雷鹏、保罗·A·雷瑙尔、贾科莫·斯费鲁扎、罗家杨...

选择性基因驱动器编程肿瘤进化以主动对抗药物耐药性 随着肿瘤的发展，针对癌症的靶向疗法通常会因药物抵抗性的进化而失败。本研究展现了一种可重复操纵肿瘤进化以设计治疗机会的方式，即使在遗传异质性预先存在的情况下。我们开发了一种选择性基因驱动器系统，可以稳定地引入到癌细胞中，由两个基因（或开关）组成，将可诱导的适应性优势与共享的适应性成本相耦合。利用随机模型的进化动力学，我们确定了选择性基因驱动器的设计准则，并建造了可以利用多个已批准的酪氨酸激酶抑制剂选择性压力的原型，并采用了多种治疗机制，如前药催化和免疫活性诱导。我们证明选择性基因驱动器能在体外消除多种形式的遗传抗性。最终，我们展示了在小鼠实体瘤模型中，模型引导的开关激活可以有效针对预先存在的抗性。这些结果为进化引导的抗癌治疗确立了选择性基因驱动...

用于研究肿瘤微环境复杂性的长期化模型：患者来源的迷你结肠 背景介绍： 肿瘤与其周围微环境的相互作用对癌症的发展和治疗具有深远的影响。然而，现有的体外肿瘤模型缺乏捕捉这些复杂交互作用的能力。为解决这一问题，该研究创新性地开发了一种基于患者特定癌细胞和其微环境的迷你结肠模型，为癌症治疗提供了一个新的实验平台。 研究团队与出版信息： 这项研究由L. Francisco Lorenzo-Martin等人领导，来自瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)干细胞生物工程实验室等多个科研机构共同完成。研究成果发表在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上。 研究流程： 研究目的与设计：为了克服现有模型的局限性，本研究旨在开发一种能够长期稳定模型化肿瘤与微环境复杂性的系统。研究聚焦于结直肠癌...

本研究发表在 Nature Biotechnology 杂志，doi为10.1038/s41587-024-02267-3。本文的通讯作者是来自华东理工大学的陈海宏、王耀宏等，发表日期为2024年4月26日。文章研究了通过代谢工程和生物催化进行高产叶绿素的生产。 研究背景 叶绿素及其衍生物在医学、食品、能源和材料领域具有广泛应用，但高效生产这些化合物面临巨大挑战。研究人员利用紫色非硫光合细菌 Rhodobacter sphaeroides 作为有效的细胞工厂，并通过酶催化结合代谢工程来生产叶绿素化合物。 研究过程 流程设计 研究流程包括基因编辑、发酵促进、代谢调节与酶催化等步骤。 基因编辑 研究团队通过基因组范围的CRISPRi筛选在 R. sphaeroides 中发现目标基因heMN，这...

通过外周克隆删除靶向消耗PD-1表达细胞诱导实现免疫耐受 背景介绍 建立T细胞受体（TCR）库的胸腺负选择是实现自耐受和器官移植后获得性耐受的关键过程。然而，尚不清楚外周克隆性删除的具体机制是否能够诱导移植耐受。本研究旨在探索通过靶向程序性细胞死亡蛋白1（PD-1）表达的细胞来诱导免疫耐受的可行性与机制。PD-1是一个在T细胞激活和衰竭过程中表现突出的表面受体，其对于慢性感染和肿瘤免疫逃逸有显著的贡献。 在器官移植后，PD-1被认为是反应性T细胞的一个表面标志物，且与同种抗原遭遇后的克隆性扩展有关。本研究旨在通过自备和抗体手段删除PD-1阳性细胞，重新塑造TCR库，并探索其是否能促进小鼠移植模型中的免疫耐受。 来源与作者信息 本文由Jikai Cui、Heng Xu、Jizhang Yu、S...

YAP抑制TEAD-NF-κB复合体并抑制透明细胞肾细胞癌的生长 研究背景 常规认知中，Hippo信号通路通过磷酸化转录辅助因子YAP将其留在细胞质中从而抑制YAP-TEAD转录复合物的形成，发挥着抑制肿瘤生长的作用。但是，来自新乡医学院、山东大学齐鲁医院等机构的研究者们发现，在清细胞肾细胞癌（CCRCC）中，YAP扮演了抑制肿瘤的角色。这项研究意味着通过激活YAP可能成为治疗患者的新策略。该研究由Zhongbo Li和Peng Su等人共同完成，于2024年7月2日发表在Science Signaling杂志上。 研究方法与发现 研究者在细胞培养、异种移植和患者源试验模型中发现，抑制上游Hippo通路激酶MST1和MST2或表达一个持续活性的YAP突变体阻碍了CCRCC增殖，降低了由转录因...

科学报告 背景介绍 感知和神经处理感官信息极大程度上受先验期望的影响。感知不仅仅是被动的接收，而是通过将现有的感官信息与基于过去经验和当前情境获得的先验信息结合而成的一种主动推理过程。这种信息的结合方式可以通过不同的机制表现出来：一种是专注于异常输入，即预测误差信号处理（Prediction Error，简称PE）；另一种是通过对预期信息的增强实现的锐化表示。本文研究了这两种机制在面孔感知中的表现。 研究来源 本研究由德国汉堡大学医疗中心(University Medical Center Hamburg-Eppendorf)系统神经科学系的Annika Garlichs和Helen Blank进行，论文发表于2024年4月的《Nature Communications》期刊。 研究流程及方...

在阅读障碍儿童中基于阅读任务的脑连接分析（使用 EEG 信号） 阅读障碍是一种影响正常阅读能力的神经发育性疾病，即使智力水平正常的儿童也可能受到影响。本文研究了在阅读任务中，阅读障碍儿童与正常儿童的大脑连通性差异，并通过图论方法进行了分析。研究检测了阅读障碍和控制组儿童在阅读任务期间的脑功能连通性，并提出可能的脑网络受损证据。 研究背景 发展性阅读障碍（Developmental Dyslexia, DD）是一种影响大约5%到10%人口的神经发育性阅读障碍。尽管这些孩子智力水平正常，但在学业表现上存在显著差距。为了避免这些儿童面临学术挑战和心理问题，理解阅读障碍的神经生理学原因及早期检测非常重要。尽管已有大量行为研究表明阅读障碍个体和正常个体在阅读技能上的差异，但其根本原因仍不明确，需要进一...