ZNF397の欠損がTET2駆動の系統可塑性と前立腺がんにおけるAR標的治療耐性を誘発する 学術的背景と研究動機 現行の研究証拠によると、がん細胞の系統可塑性とエピジェネティックな再プログラミングは、それらが系統依存の標的治療から逃れることを可能にします。しかし、これらのがん細胞がエピジェネティックな調節機構を利用して系統可塑性と治療耐性を獲得する背後のメカニズムは依然として未知の部分が多いです。本論文の著者たちは、亜鉛フィンガータンパク質397（ZNF397）が真のアンドロゲン受容体（AR）共新活化因子であり、AR駆動の前立腺がん細胞における内腔系統の維持に重要な役割を果たすことを識別しました。ZNF397の欠失は、がん細胞がAR駆動の内腔系統からTET2駆動の系統可塑性状態に変わることを...
这項研究は、新しい標的可能な癌症サブタイプ、すなわちMETチロシンキナーゼドメイン(TKD)の活性化点突変を明らかにしました。研究者たちは60万例以上の癌症患者のゲノムデータを分析し、約0.5%の患者にMET TKD活性化変異が存在することを発見しました。これらの変異はさまざまな腫瘍タイプに分布しており、その中でも腎細胞癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、および黒色腫が最も一般的です。 In vitroおよび動物モデル研究を通じて、これらの変異の発癌活性が証明され、異なる変異がMET阻害剤に対する感受性に差異を持つことが判明しました。興味深いことに、一部のMET TKD変異は以前、METエクソン14欠失(METex14)のNSCLCでMET阻害剤耐性を獲得した後に出現する部位変異として発見されま...
鉄（鉄イオン3+）依存のテロメラーゼ再活性化が結直腸癌の進展を駆動する 一、研究背景 結直腸癌（Colorectal Cancer, CRC）は世界で三番目に多い癌であり、その発生原因は遺伝的要因と非遺伝的要因が関わっている。これまでの研究で、鉄含量の過剰や遺伝性鉄過剰症とCRCとの間に顕著な関連があることが分かっているが、金属を介したシグナル伝達経路がどのように発癌作用を引き起こすかは解明されていない。赤肉に含まれるヘテロサイクリックアミンや多環芳香族炭化水素などが発癌物質と考えられているが、鉄含量の増加がCRCの発生をどのように駆動するかに関する研究は少ない。さらに、鉄は細胞に必須の正常生理機能を担っているが、鉄含量の異常は組織損傷やDNA損傷を引き起こし、癌細胞の成長を促進する可能性が...
研究背景: 自殺は世界的な公衆衛生の課題であるが、行動的要因と生理的要因と自殺未遂（suicide attempts，SA）との関係には依然として多くの不確実性が存在する。これまでの研究は、うつ病のような精神疾患、絶望感のような人格や心理的特徴、低い社会的支援や生活のストレスといった社会的および家庭の要因など、限られた仮説に集中していた。このような狭い視点は、他のリスク要因を見逃す可能性がある。これらの研究空白を埋めるため、本研究チームは大規模な系統的分析およびメンデルランダム化分析を実施し、イギリス生物銀行データセットでSAに関連する可能性のある行動および生理的リスク要因を特定した。 研究来源: この論文は以下の研究者による著作である：Bei Zhang、Jia You、Edmund T....
双方向エピジェネティック編集が遺伝子制御の階層構造を明らかにする 背景と研究動機 ヒトゲノムにおいて、エンハンサーなどの非コード要素が遺伝子制御に果たす役割は広く認識されています。しかし、現在一般的に用いられているCRISPR干渉法は、非コード要素と遺伝的相互作用の研究においていくつかの限界があります。主に、従来のCRISPR手法、例えばCRISPR干渉（CRISPRi）やCRISPR活性化（CRISPRa）は、一度に単一の遺伝子座を編集することしかできないため、遺伝子制御ネットワークにおける相互作用の理解が制限されています。したがって、本研究はこれらの問題を解決するために、二方向のエピジェネティック特性を編集できるシステムを開発することを目指します。 出典と著者情報 この論文「Bidire...
この報告では、Nature Human Behaviour誌に掲載された科学論文「英国のバイオバンク表型データからの原則的抽出が人間の変異の潜在的な構造を明らかにする」というタイトルの研究を詳細に評価しました。この研究はCaitlin E. Carey、Rebecca Shafee、Robbee Wedowらによって担当され、オンライン投稿日はXX年XX月XX日で、出所はhttps://doi.org/10.1038/s41562-024-01909-5です。 研究背景と意義 公共部門と民間部門が大規模なデータ収集と統合への投資を行っている中、バイオバンクと呼ばれるデータレポジトリが登場し、健康成果と数千人の個人サンプルを関連付けています。バイオバンクは、EHR（電子健康記録）、自己申告調査...
user: 以下は《Nature Biotechnology》上に発表された「Multiplexed Orthogonal Base Editor (MOBE) Systems Development（多重化正交ベースエディター（MOBE）システムの開発）」という学術報告の全文です。 近年来，随着基因编辑工具的快速发展，特别是CRISPR-Cas9系统的引入，使得精确修饰特定DNA序列成为可能。当前，引入单碱基变异（Single-Nucleotide Variants，SNVs）作为研究基因功能和疾病关联性的有力工具，尤其在精准医学领域显得尤为重要。现有基因编辑工具在指向性编辑方面已展现出显著效能，但在同时引入多个点突变时常遇到问题，此时需要借助多路复用编辑系统来提升效率。 近年、遺伝子編集...
学術的背景 RNA選択的スプライシング（RNAアイソフォーム）は、遺伝子発現の調節において重要な役割を果たしています。ヒトのタンパク質コーディング遺伝子は平均して8つ以上のRNA選択的スプライシングを含み、これにより約4つのユニークなタンパク質コーディング配列が生じます。従来の短読長シーケンシング技術は読取り長の制限により、RNA選択的スプライシングを正確に組み立てて定量することができず、基礎生物学の理解が大幅に簡略化されていました。ますます多くの研究が、同じ遺伝体の異なる選択的スプライシングがタンパク質レベルでユニークな相互作用ネットワークを持っていることを示しています。特に、同じ遺伝体の一部の選択的スプライシングが細胞内で全く異なる、あるいは逆の機能を果たすことが示されています。例えばb...
序論 新型コロナウイルスのパンデミックの影響で、mRNAワクチン技術は顕著な進展を遂げましたが、その短い半減期と高用量の要件が副作用と可用性の問題を引き起こしています。これらの課題を克服するために、自己増幅RNA（self-amplifying RNA, saRNA）が研究の焦点となっています。saRNAは、アルファウイルスから取得されたRNA依存性RNAポリメラーゼ（RNA-dependent RNA polymerase, RdRP）を利用して自己複製を行い、理論的には用量と注射頻度を減らすことでワクチンの効果と安全性を向上させることができます。しかし、saRNAの初期研究では、その強力なインターフェロン（Interferon, IFN）応答が抗原の発現を抑制し、ワクチンの効力を低下させ...
本研究では、crRNAとtracrRNAによって指示され、DNAまたはRNAの標的の結合によって活性化される、「trans-cleavage」活性を持つ別のタイプの2型CRISPR-Casシステム、II型Cas9システムを実証しました。Cas9エフェクターヌクレアーゼのtrans-cleavage活性と核酸増幅技術を組み合わせることで、DACDおよびRACDと名付けた特異的なDNAおよびRNAサンプル検出プラットフォームを作成しました。 Cas9は、キメラsgRNAおよびノンキメラcrRNAとtracrRNAの指示の下で、顕著に異なるssDNA trans-cleavage活性を示しました。酵素動力学分析によると、crRNAおよびtracrRNAによって指示されるCas9 trans-cle...