フェーズドパンゲノムを活用したハイブリッドジャガイモのハプロタイプ設計

分相パンゲノムを活用したハイブリッドジャガイモのハプロタイプ設計 学術的背景 ジャガイモ(Solanum tuberosum L.)は、世界で最も重要な塊茎作物の一つであり、毎年120以上の国々で13億人以上の人々に食料を提供しています。しかし、ジャガイモの四倍体ゲノムとクローン繁殖の方法により、その育種の進展は遅く、従来の育種方法では有益な形質を迅速に蓄積することが困難です。ジャガイモの改良を加速するために、科学者たちは二倍体自殖系に基づく種子繁殖ハイブリッドシステムを提案しています。しかし、二倍体自殖系の開発は、多数の有害な変異によって妨げられており、これらの有害変異の存在はジャガイモの成長と全体的な適応性に深刻な影響を与えています。したがって、これらの有害変異の本質を理解し、それらを除...

患者由来オルガノイドを用いた迅速かつスケーラブルな個別化ASOスクリーニング

患者由来オルガノイドを用いたパーソナライズドアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)スクリーニングプラットフォームの確立 学術的背景 近年、ゲノムシーケンシング技術の急速な進展に伴い、特定の遺伝子変異に関連する多くの希少遺伝性疾患が発見されています。アンチセンスオリゴヌクレオチド(Antisense Oligonucleotides, ASOs)は、特定のRNA配列を標的とする治療手段として、さまざまな遺伝性疾患の治療においてその可能性を示しています。ASOsは標的mRNAに結合し、RNAの加工プロセスを調節したり、タンパク質の発現レベルに影響を与えることで、遺伝子変異によって引き起こされる病理学的表現型を修正します。しかし、ASOsが研究室や臨床で顕著な成果を上げているにもかかわらず、その...

末梢血単核細胞の多部位DNAメチル化変化はAIS/ステージI肺腺癌の診断のための新規バイオマーカーとして機能する:多施設コホート研究

末梢血単核細胞のDNAメチル化に基づく早期肺腺癌診断の新手法 背景紹介 肺腺癌(Lung Adenocarcinoma, LUAD)は、世界的にがん関連死亡の主要な原因の一つであり、肺癌症例の約40%を占めています。近年、肺腺癌の治療は著しく進歩していますが、その予後は依然として不良です。その主な理由の一つは、早期診断の難しさにあります。多くの患者は初診時にはすでに進行期に達しており、治療効果が低くなっています。現在、低線量コンピュータ断層撮影(Low-Dose Computed Tomography, LDCT)は早期肺腺癌スクリーニングの一般的なツールですが、その偽陽性率は96.4%と高く、既存の血清バイオマーカー(CEAなど)も早期肺腺癌診断における感度と特異性が低いという課題がありま...

生物学的老化と遺伝的感受性の組み合わせによる静脈血栓塞栓症のリスク集団の特定:394,041名の参加者を対象とした前向きコホート研究

生物学的老化と遺伝的素因の組み合わせにより静脈血栓塞栓症の高リスク集団を特定 学術的背景 静脈血栓塞栓症(Venous Thromboembolism, VTE)は、深部静脈血栓症(Deep Vein Thrombosis, DVT)と肺塞栓症(Pulmonary Embolism, PE)を含む、世界で3番目に致命的な心血管疾患です。VTEの発生率は年齢と密接に関連しており、特に40歳以上の個人では、10年ごとにVTEのリスクがほぼ倍増します。しかし、年齢そのものは個人の生物学的老化速度を完全に反映するものではありません。生物学的老化速度とは、個人の生物学的年齢と実年齢の差を指し、この差は同じ年齢層の個人間で疾患リスクに大きな違いをもたらす可能性があります。そのため、生物学的老化速度がVT...

miRNA遺伝子における多型性一塩基多型と大腸癌感受性:ペアワイズおよびネットワークメタ分析、Thakkinstianのアルゴリズム、FPRP基準による総合評価

miRNA遺伝子における多型性一塩基多型(SNP)と大腸癌感受性の関連研究 学術的背景 大腸癌(Colorectal Cancer, CRC)は、世界的に見ても発症率と死亡率が高い悪性腫瘍の一つです。2022年の世界がん統計によると、大腸癌は世界で3番目に多いがんであり、年間190万例以上の新規症例と90万例以上の死亡例が報告されています。大腸癌の発症メカニズムは複雑ですが、遺伝的要因がその発生と進行に重要な役割を果たしています。特に、miRNA遺伝子における一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)の変異は、大腸癌の感受性と密接に関連していると考えられています。 miRNA(マイクロRNA)は、短鎖の非コードRNAであり、mRNAの相補的な配列...

肺がんの精密診断における有望なバイオマーカーとしての循環細胞外小胞:展望

外泌体を肺癌の精密診断のバイオマーカーとして 学術的背景 肺癌は、世界中のがん関連死亡の主要な原因の一つであり、特に非小細胞肺癌(NSCLC)と小細胞肺癌(SCLC)の早期診断と精密治療は依然として大きな課題を抱えています。従来の組織生検は肺癌診断の「ゴールドスタンダード」とされていますが、その侵襲性、時間のかかるプロセス、および高コストが早期診断における応用を制限しています。近年、液体生検(liquid biopsy)は非侵襲的な診断方法として注目を集めており、血液などの体液中の循環腫瘍細胞(CTCs)、循環腫瘍DNA(ctDNA)、および外泌体(extracellular vesicles, EVs)などのバイオマーカーを分析することで、肺癌の早期診断と精密治療に新たな可能性を提供してい...

高効率siRNA負荷とpH応答性小型細胞外小胞を用いた乳癌への遺伝子送達の強化

高効率siRNA負荷とpH応答性小型細胞外小胞を用いた乳癌への遺伝子送達の強化

乳がんへの遺伝子送達を強化する効率的なsiRNA負荷とpH応答性の小細胞外小胞 学術的背景 近年、小細胞外小胞(small extracellular vesicles, sEVs)は、その天然由来と固有のホーミング特性から、薬物送達分野で注目を集めています。sEVsは、ほとんどの真核細胞から分泌される脂質ナノ粒子で、直径は通常50〜150ナノメートルです。これらはさまざまな生物分子を運び、細胞間コミュニケーションを通じて情報を伝達し、体内で良好な構造的および生理的安定性を示します。これらの特性により、sEVsは特に薬物送達分野において、さまざまな疾患の治療に大きな可能性を秘めています。 しかし、sEVsが薬物送達において広範な可能性を示しているにもかかわらず、その臨床応用にはまだ多くの課題...

多重液滴デジタルPCRアッセイを用いた8種類のがんの同時検出

多癌種検出のための多重液滴デジタルPCRメチル化検出法 背景紹介 がんは世界的に死亡の主要な原因の一つであり、2020年には約1000万人の死亡が報告されました。多くのがんは早期発見と治療によって治癒可能ですが、多くの患者が依然として進行した段階で診断されており、治療効果が低くなっています。現在、ほとんどの西洋諸国では、大腸がん、乳がん、子宮頸がんに対してのみスクリーニングプログラムが実施されており、他のがん種には効果的な早期検出手段が不足しています。そのため、複数のがん種を同時に検出できる早期診断ツールの開発が重要です。 DNAメチル化(DNA methylation)は、がんの初期段階で変化するバイオマーカーであり、高い安定性と一貫性を持っています。変異とは異なり、メチル化パターンはがん...

がんにおけるCXXC5の信号統合機能

CXXC5のがんにおけるシグナル統合機能 学術的背景 CXXC5(CXXC型亜鉛フィンガー蛋白質5)は、ZF-CXXC蛋白質ファミリーの一員であり、細胞シグナルネットワークにおいてシグナル統合と情報伝達の重要な役割を果たしています。CXXC5は、Wnt/β-catenin、TGF-β/BMP、ATM/p53などの複数のシグナル経路や遺伝子発現を調節することで、細胞増殖、分化、アポトーシス、代謝などのプロセスに関与しています。その異常な発現や機能不全は、特にがんの発生や進行を含む多くの病理学的プロセスと関連しています。しかし、CXXC5のがんにおける具体的な作用機序や治療的価値はまだ完全には解明されていません。したがって、本稿では、CXXC5の細胞シグナルネットワークにおける機能、特にがんにお...

発達多能性関連因子4は細胞幹性を強化することにより下垂体神経内分泌腫瘍の攻撃性を増加させる

Dppa4遺伝子の下垂体神経内分泌腫瘍における発がん作用 学術的背景 下垂体神経内分泌腫瘍(Pituitary Neuroendocrine Tumors, PitNETs)は、一般的な頭蓋内腫瘍であり、通常ホルモン分泌機能を持ち、人間の性腺機能低下や不妊の重要な原因の一つです。ほとんどのPitNETsは手術や薬物治療でコントロール可能ですが、一部の腫瘍は治療に対する感受性が低く、再発を示すことがあり、さらには周囲組織への広範な浸潤や遠隔転移などの侵襲性を示すことがあります。現在、PitNETsの侵襲性のメカニズムは不明であり、特に腫瘍幹細胞の役割は十分に研究されていません。 近年の研究では、腫瘍幹細胞がPitNETsの侵襲性と薬剤耐性において重要な役割を果たす可能性が示唆されています。胚性...