単一細胞視角からのエピジェネティック老化の本質の研究 研究背景 生物学研究が進展するにつれて、科学者たちはDNAメチル化（DNA methylation, DNAm）の変化が年齢を予測する上で最も信頼性の高い指標の一つであるエピジェネティック時計を構成していることを発見しました。しかし、これらの時計が具体的に測定している老化の側面のメカニズムはまだ明らかではありません。本研究は、マウスの組織と単一細胞のDNAmダイナミクスを比較することで、エピジェネティック老化の特性を明らかにし、さらに単一細胞RNAシーケンシング（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）分析で我々の発見を支持することを目的としています。 研究出典 本研究はAndrei E. Tarkho...
小腸腺癌ゲノミクス概況：三大データベースに基づくデータ統合解析 背景および研究の重要性 小腸腺癌（Small Bowel Adenocarcinoma, SBA）は稀な腫瘍ですが、その発症率は近年増加しており、とりわけ十二指腸腺癌において顕著です。SBA患者の約20%は、クローン病やリンチ症候群のような感受性疾患を持っています。既存の研究では、小腸腺癌がゲノムレベルでの大腸腺癌に近いことが示されていますが、胃腺癌とは異なります。しかし、異なる段階のSBAの遺伝子プロファイルやその予後に対する価値についての体系的な研究は未だ限られています。 本論文の著者は、大規模なゲノム解析を行い、SBAの遺伝子変異分布とその疾患予後との関係を探求しました。この研究は臨床的にも研究的にも重要な意義を持ちます。...
癌遺伝子変異性転移性結腸直腸癌患者へのエンコラフェニ・セツキシマブ療法の実効性－有効性分析のコホート研究 研究背景 個別化医療の発展とともに、標的治療は多くの癌治療において重要な手段となっています。転移性結腸直腸癌（mCRC）において、エンコラフェニ・セツキシマブの組み合わせ療法は予防治療を受けたBRAF^V600E^変異患者に対して有効と考えられています。しかし、無作為化比較試験（例えばBEACON試験）で有効性が証明された治療法であっても、実際の使用条件の違いにより、有効性と実効性（efficacy-effectiveness）のギャップが生じる可能性があります。回顧的なコホート研究は、総体的な患者についてより包括的な知見を提供することができるため、本研究は臨床実践におけるこの薬物組み合...
高度胃腸膵神経内分泌腫瘍の総合的な遺伝子および転写組特性の研究報告 研究の背景 高度胃腸膵神経内分泌腫瘍（high-grade gastro-entero-pancreatic neuroendocrine neoplasms, HG GEP-NENs）は、神経内分泌分化の特徴を持つ異質性のある悪性腫瘍である。WHO 2019 [1]および2022 [2]基準によると、GEP-NENsは現在、神経内分泌腫瘍（NETs）、神経内分泌癌（NECs）、および混合型非神経内分泌-神経内分泌腫瘍の三種類に分類されている。国際臨床ガイドライン[3, 4]では、GEP-NET G3とGEP-NECsを包括的な概念としてHG GEP-NENsとして認めているが、GEP-NET G3とGEP-NECsの予後お...
全自動マルチモーダルMRI多タスク学習によるグリオーマ分割とIDH遺伝子分類の研究報告 研究背景 グリオーマは中枢神経系で最も一般的な原発性脳腫瘍で、世界保健機関（WHO）2016年分類によると、グリオーマは低悪性度グリオーマ（LGG、グレードIIおよびIII）と高悪性度グリオーマ（HGG、グレードIV）に分類されます。イソクエン酸デヒドロゲナーゼ（Isocitrate Dehydrogenase, IDH）変異の状態はグリオーマにおける最も重要な予後指標の一つです。臨床研究では、IDH変異を持つ低悪性度グリオーマ患者の予後は通常、野生型患者よりも良好であることがわかっています。従来のグリオーマの手動セグメンテーションは時間と労力を要するもので、正確なIDH遺伝子分類と正確なグリオーマ分割は...
世界的に見て、悪性脳腫瘍の中で最も一般的で致命的なのは膠芽腫（Glioblastoma, GBM）です。近年、機械学習技術を通じて術前の単一モダリティまたは多モダリティの画像表現型に基づいてGBM患者の総生存時間（Overall Survival, OS）を予測しようとする研究が続けられています。これらの機械学習方法は予測において一定の進展を遂げましたが、多くの研究では放射線学に基づくOS予測方法に含まれる腫瘍の遺伝子型情報を考慮しておらず、この情報は予後に強い指示作用を持っています。この問題を解決するために、Tang Zhenyu、Xu Yuyun、Jin Lei などの研究者が2020年6月に《IEEE Transactions on Medical Imaging》に「Deep Lea...
CHD2調節小児膠腫における神経元-膠腫相互作用に関する研究報告 背景紹介 高グレード膠腫（High-grade gliomas, HGG）は成人および小児患者にとって致命的な疾患です。近年の研究により、神経活動が多様な高グレード膠腫サブグループの進展を促進することが示されています。しかし、このプロセスを調節するエピジェネティックなメカニズムは未解明のままです。本文では、新たなエピジェネティック調節メカニズムであるChromodomain Helicase DNA-binding Protein 2（CHD2）が、腫瘍関連H3.1K27M変異を特徴とするびまん性中線膠腫（Diffuse Midline Glioma, DMG）において、神経元-膠腫相互作用を調節する役割について報告します。 ...
St. Jude Survivorship Portal: 小児癌サバイバーの大規模臨床およびゲノムデータの分析と共有 研究背景 アメリカにおいて、小児癌の5年生存率は1970年代の約60%から今日の85%以上に上昇しました。生存率が著しく向上したにもかかわらず、これらの小児癌サバイバーは癌及びその治療に起因する様々な健康リスクに直面しています。これらのリスクには、早期死亡、器官機能障害、新たな腫瘍、不良な社会経済的結果、心理社会的課題、及び全体的な生活の質の低下が含まれます。これらの問題に対処するため、主要な研究はその潜在的な原因、関連リスク、および最も感受性の高い患者亜群を特定することに焦点を当てています。 これに関連する大規模縦断研究として、St. Jude Lifetime Coho...
引言 健康な造血過程では、一群の造血幹細胞（Hematopoietic Stem Cells、略してHSC）が血液関連のすべての系統に貢献します。しかし、年齢が上がるにつれて、この過程はしばしばクローン性造血（Clonal Hematopoiesis、略してCH）を引き起こし、特定のHSCクローンの拡張により多くの血細胞や血小板が占められます。このクローン拡張現象は、生命過程でHSCが獲得する体細胞変異によって駆動され、高齢者において高度に一般的です。CHに関連する遺伝子変異はHSCに成長の優位性を与え、造血過程で正の選択を受けます（1-13）。近年、多くの研究がCHが血液悪性腫瘍の発症、心血管疾患、全死因死亡率、実体腫瘍、および感染症のリスク増加と関連していることを示しています（2, 7,...
在当今腫瘍治療領域、精密医療は研究のホットスポットと発展のトレンドであり続けている。科学技術の進展に伴い、腫瘍細胞の特性およびその生存の依存性をより正確に理解するようになり、新しい治療標的を見つけることを目指している。特に合成致死の原理に基づく戦略、すなわち腫瘍固有の遺伝的欠陥を対象とした標的治療薬の開発は、がん治療の難題を解決する新たな希望となっている。合成致死戦略は主に腫瘍細胞と正常細胞の分子レベルでの違いに基づいており、腫瘍細胞の生存に不可欠だが正常細胞には影響が少ない分子メカニズムを標的にすることで、正常細胞を損傷させずに選択的に腫瘍細胞を殺す目的である。 マイクロサテライト不安定性（Microsatellite Instability, MSI）は腫瘍遺伝的特徴であり、ミスマッチ修...