肺癌脳転移における多オミクス統合解析により代謝の脆弱性が新たな治療標的であることを解明 学術的背景 肺癌は世界的に発症率および死亡率が最も高い癌の一つであり、特に肺癌脳転移（Lung Cancer Brain Metastases、LC-BMs）は肺癌患者によく見られる合併症で予後が極めて悪いです。近年、肺癌の治療技術は進歩しているものの、脳転移をターゲットとした標準治療法は依然として限られており、その効果も十分ではありません。そのため、肺癌脳転移の分子メカニズムおよび腫瘍微小環境を深く理解することは、新規治療戦略の開発にとって極めて重要です。 肺癌脳転移の発生メカニズムは複雑であり、ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームおよびメタボロームなど複数のレベルでの変化が関与します。近年、多オ...

ゲノム医学におけるCRISPRガイド配列再注釈：EXORCISEアルゴリズムの応用と検証 学術的背景 CRISPR-Cas9技術は、その登場以来、特に遺伝子の必須性や化学-遺伝相互作用の研究において、遺伝子スクリーニング分野を劇的に変化させました。特定の遺伝子を標的とするガイドRNA（guide RNA, gRNA）の設計を通じて、CRISPR-Cas9システムは細胞内で正確な遺伝子ノックアウトを導入でき、遺伝子機能や疾患におけるその役割の理解を進める助けとなります。しかし、CRISPRライブラリーの設計は通常、参照ゲノムに基づいて行われますが、実際に研究対象となる細胞系（特にがん細胞系）はしばしばゲノム変異を持ちます。これにより、CRISPRガイド配列のミスマッチや偏りが生じ、実験結果の正...

長鎖リードシークエンシングによる多剤耐性微生物ゲノム監視研究 学術背景 多剤耐性微生物（Multidrug-Resistant Organisms, MDROs）は、世界的な公衆衛生における重大な脅威です。これらの微生物は複数の抗生物質に耐性を持ち、感染の治療を難しくし、医療負担を増大させています。MDROsの拡散を効果的に監視・制御するためには、その耐性遺伝子、分子型の変化、および伝播経路を正確に特定することが極めて重要です。従来の分子タイピング手法（例：パルスフィールド電気泳動法（Pulsed-Field Gel Electrophoresis, PFGE）、多部位配列タイピング（Multi-Locus Sequence Typing, MLST）など）は、過去には重要な役割を果たしてき...

学術背景と問題提起 腫瘍抑制遺伝子（Tumour Suppressor Genes, TSGs）の機能喪失（Loss-of-Function, LOF）変異は癌において非常に一般的ですが、これらの変異が原因でタンパク質の機能が低下または消失するため、従来の薬物標的戦略ではこれらの変異を直接対象とすることは困難です。そのため、研究者はこれらの変異による細胞の脆弱性を解明し、新たな治療標的を発見する方法を開発する必要があります。KMT2Dは多くの癌で頻繁に変異する腫瘍抑制遺伝子であり、その機能喪失変異は様々な癌の発生や進展に密接に関係しています。しかしながら、KMT2Dの機能ネットワークやその癌細胞における脆弱性については、まだ包括的な研究が行われていません。 本研究では、計算モデルを用いてKM...

統合単細胞解析により、タモキシフェン耐性乳がんにおけるエピジェネティックに制御されるがん細胞状態と異質性に基づくコアシグネチャーを明らかにする 学術的背景 乳がんは女性において最も一般的ながんの一つであり、内分泌療法（タモキシフェンなど）はエストロゲン受容体α（ER）陽性乳がん患者の標準治療法です。内分泌療法は再発リスクを大幅に減少させますが、約3分の1の患者は最終的に内分泌耐性を獲得し、再発します。腫瘍間および腫瘍内の異質性は、内分泌耐性の発症に重要な要因であると考えられています。近年、単細胞RNAシーケンシング（scRNA-seq）および単細胞ATACシーケンシング（scATAC-seq）技術の進歩により、単細胞解像度で腫瘍異質性を探ることが可能になりました。しかし、このような統合単細胞...

Pitx2の発現およびネアンデルタール人からの遺伝子流入が現代人の歯のサイズ変異に寄与する 背景と目的 歯の形態はヒトの進化過程において顕著な多様性を示していますが、この多様性の遺伝的基盤についてはほとんど解明されていません。歯は保存性が高く、形態の多様性が豊かであるため、進化研究で重要な特徴として扱われます。また、現代人類集団間でも歯の形態的変異が観察されており、これらの特徴は集団遺伝学や個人識別にも利用されています。しかし、一般集団での歯の形態変異に関する遺伝的基盤の研究は限定的であり、歯の発育に関わる遺伝子を数多く特定する動物研究があるにもかかわらず、これを人類の個々の形態変異に結びつける研究は不十分です。 本研究の目的は、多層的な-オミクス解析を通じ、現代人の歯冠サイズの変異に寄与す...

CHEK2遺伝子の低リスク変異とがん表現型の関係に関する研究 学術的背景 CHEK2遺伝子（OMIM 604373）は乳がんの感受性遺伝子の一つであり、その単一アレルの病原性変異（pathogenic variants, PVs）は乳がん、大腸がん、腎臓がん、甲状腺がんのリスク増加と関連しています。しかし、CHEK2遺伝子の二アレル変異の表現型に関する研究は少なく、特に低リスク（low-risk, LR）変異であるp.I157T、p.S428F、p.T476Mのがん感受性についてはまだ十分に研究されていません。これらの低リスク変異は一般集団で比較的頻繁に見られますが、二アレル状態でのがんリスクについては十分に解明されていません。したがって、本研究はCHEK2遺伝子の二アレル低リスク変異とがん...

遺伝性網膜疾患の遺伝子検出率における人種的差異 学術的背景 遺伝性網膜疾患（Inherited Retinal Diseases, IRDs）は、遺伝子変異によって引き起こされる網膜変性疾患の一群であり、視力の喪失や失明を引き起こす可能性があります。遺伝子発見と次世代DNAシーケンシング技術の進歩により、多くの患者が遺伝子検査を通じて明確な遺伝的診断を得ることができるようになりました。これらの診断は、疾患の確認、予後の予測、遺伝カウンセリング、生殖に関する意思決定、および臨床試験への参加に重要な情報を提供します。しかし、現在の遺伝子検査プラットフォームが異なる人種グループ間で一貫した検出率を持っているかどうかは不明です。特に、がん遺伝学の分野では、アフリカ系の人々はBRCA1/BRCA2乳が...

原発性開放隅角緑内障の多遺伝子リスクスコアと疾患発症リスクについて：ランダム化臨床試験の事後解析 学術的背景 原発性開放隅角緑内障（Primary Open-Angle Glaucoma, POAG）は最も一般的な緑内障の型であり、多くの場合、眼圧（Intraocular Pressure, IOP）の上昇と関連しています。緑内障は不可逆的な視神経の疾患であり、早期の治療が行われない場合、視力を失うことがあります。眼圧を下げる局所薬の使用によりPOAGの発症を遅らせることが可能ですが、眼圧が高いすべての患者が緑内障を発症するわけではありません。そのため、リスクの高い患者を正確に特定し、リスクの低い患者に対する過剰診断を避けることが臨床実践において重要な課題となっています。 多遺伝子リスクスコ...

青年性黄色肉腫に関する研究が新しい遺伝的変異を明らかに 青年性黄色肉腫 (Juvenile Xanthogranuloma, JXG) は、通常皮膚で発症するまれな組織球性腫瘍であり、稀に軟部組織や中枢神経系 (CNS) など皮膚外の部位でも発症しますが、その遺伝的原因は完全には解明されていません。最近、複数の国際的医療センターの研究チームが、これらまれな組織球性腫瘍に関連する新しい遺伝的変異と潜在的な治療ターゲットを明らかにするオリジナル研究論文を発表しました。本稿では、組織病理学的および分子的データを統合し、治療戦略および分子診断に役立つ新しい科学的知見を紹介します。 背景と研究の動機 JXG は通常、自然消退する皮膚病変として現れ、特に小児の早期にしばしば消退します。しかし、皮膚外（例...