Hétérogénéité allélique des variants structurels dans le syndrome de duplication MECP2 fournit un aperçu de la gravité clinique et de la variabilité de l'expression de la maladie

Rapport sur l’article académique décrivant les variations structurelles dans le syndrome de duplication de MECP2 Contexte académique Le syndrome de duplication de MECP2 (MECP2 Duplication Syndrome, MRXSL) est une maladie génomique liée au chromosome X, principalement causée par un gain de copies du gène MECP2 situé sur le chromosome X. Ce syndrome ...

Études d'association à l'échelle de l'épigénome identifiant de nouveaux sites de méthylation de l'ADN associés au TSPT : une méta-analyse de 23 cohortes militaires et civiles

Le trouble de stress post-traumatique (TSPT) est un trouble psychiatrique grave qui survient généralement après des événements traumatisants. Les symptômes du TSPT incluent des souvenirs intrusifs, l’évitement ou l’engourdissement émotionnel face à des situations déclenchant ces souvenirs, ainsi qu’une hypervigilance persistante qui peut affecter c...

Modèles d'instabilité génomique chez les patientes atteintes de cancer de l'ovaire

Le cancer de l’ovaire, en tant que tumeur gynécologique létale, concentre les recherches récentes sur l’exploration de thérapies ciblées. L’introduction des inhibiteurs de la poly(ADP-ribose) polymérase (PARP) a représenté une avancée majeure dans le traitement de ce cancer, avec des résultats particulièrement efficaces chez les patientes présentan...

Le modèle SIRCLE révèle les mécanismes de régulation du phénotype dans le cancer du rein

L’objectif principal de cette étude était de développer un modèle appelé SIRCLE (Signature Regulatory Clustering) pour intégrer les données de méthylation de l’ADN, de transcription (RNA-seq) et de protéomique afin de découvrir les mécanismes de régulation des phénotypes dans les cancers, notamment le carcinome rénal à cellules claires (ccRCC). Ce ...

Réexamen de la résistance mutationnelle à l'ampicilline et au céfotaxime chez Haemophilus influenzae

Réexamen de la résistance mutationnelle à l’ampicilline et au céfotaxime chez Haemophilus influenzae Contexte et Motivation Haemophilus influenzae est un pathogène bactérien opportuniste pouvant causer des infections graves des voies respiratoires et des infections invasives telles que la septicémie et la méningite, en particulier chez les populati...

Utilisation de données fonctionnelles multiplexées pour réduire les inégalités de classification des variants dans les populations sous-représentées

Réduction des inégalités dans la classification des variantes chez les populations sous-représentées grâce à des données fonctionnelles multiplexées. Références de l’article Dawood et al., Genome Medicine (2024) 16:143. DOI : https://doi.org/10.1186/s13073-024-01392-7 Résumé du rapport Introduction Dans le domaine de la médecine génomique, une des ...

Identification complète des agents pathogènes et prédiction de la résistance aux antimicrobiens à partir de cultures sanguines positives en utilisant la technologie de séquençage par nanopores

Rapport académique sur l’article scientifique basé sur la technologie de séquençage nanopore pour l’identification des pathogènes des infections sanguines et la prédiction de la résistance aux antibiotiques Contexte académique Les infections sanguines (Bloodstream Infections, BSI) constituent une pathologie clinique grave et sont souvent diagnostiq...

Analyses intégrées de données multi-omiques révèlent la vulnérabilité métabolique comme nouvelle cible thérapeutique dans les métastases cérébrales du cancer du poumon

Analyse intégrative multi-omique des métastases cérébrales du cancer du poumon révélant la vulnérabilité métabolique comme une cible thérapeutique innovante Contexte académique Le cancer du poumon est l’un des cancers les plus courants et l’une des principales causes de mortalité liée au cancer dans le monde. Les métastases cérébrales du cancer du ...

Annotation génomique des guides CRISPR valide les cibles dans les lignées cellulaires variantes et améliore la découverte dans les criblages

annotation des guides CRISPR ciblant le génome à l’aide de l’algorithme EXORCISE Contexte académique La technologie CRISPR-Cas9 a révolutionné les criblages génétiques, notamment en analysant l’essentialité des gènes et les interactions chimio-génétiques. En programmant des ARN guides (gRNAs) pour cibler des séquences spécifiques du génome, ce syst...

Surveillance génomique des organismes multirésistants basée sur le séquençage à lecture longue

Contexte académique Les organismes multirésistants (Multidrug-Resistant Organisms, MDROs) représentent une menace majeure pour la santé publique mondiale. Ces micro-organismes, résistants à plusieurs classes d’antibiotiques, compliquent le traitement des infections et augmentent les charges médicales. Pour surveiller et contrôler efficacement leur ...