肺癌ゲノミクスの最新研究：非小細胞肺癌の血液循環腫瘍DNA検査分析 背景と研究動機 近年、非小細胞肺癌（NSCLC）の治療は標的治療の成功により著しい変化を遂げました。国家総合癌症ネットワークガイドラインは、標的治療で恩恵を受ける可能性のある患者を特定するために、肺癌の広範な分子検査を推奨しています。しかし、NSCLC患者が十分な組織生検サンプルを取得することがますます難しくなっています。生物マーカーの数が増加することで、サンプルが完全な分子分析には不足しています。また、腫瘍の位置や患者の臨床状況から組織採取が非常に困難です。これらの組織検査の限界を克服するため、血液中の循環腫瘍DNA（ctDNA）を用いた次世代シーケンシング（NGS）が期待されています。 研究の出所 この研究はHsin-Y...
複数のがんにわたる研究により、MUTYH遺伝子の二等アレル失活と異なる種類の固形腫瘍における塩基除去修復欠損が明らかに 研究背景 日常生活において、細胞は内因性および外因性の酸化ストレスに頻繁にさらされています。これらのストレスは細胞呼吸の副産物や様々な外因性化合物の接触によって引き起こされます。MUTYHは塩基除去修復（Base Excision Repair, BER）経路の重要な構成要素であり、内因性および外因性由来の酸化DNA損傷を修復する役割を果たします。酸化損傷の最も一般的な産物の一つは8-酸化-7,8-ヒドロキシグアニン（8-oxoG）です。MUTYHは誤対合したアデニンを除去することによって、これらの酸化損傷が引き起こすG:CからT:Aへの変異を防ぎ、多くの酸化損傷に高頻度で...
遺伝性癌症症候群のスクリーニングと結果：都市安全ネット病院の研究 研究背景 遺伝性癌症症候群（Hereditary Cancer Syndromes, HCS）患者の生涯がんリスクは高い。しかし、歴史的にサービスが行き届いていない群体の遺伝子評価率は低い。このため、研究者は都市安全ネット患者集団においてHCS評価を行う人口統計学的要因を理解しようと試みた。 論文情報 本研究はSydney Brehany, MD、Meryl Colton, MD、Cassandra Duarte, MD、Michael Baliton, BS、Alec S. McCranie, BA、Sonia Okuyama, MDにより共同で完成された。アメリカ臨床腫瘍学会（American Society of Cli...
稀な膵臓癌未分化肉腫サブタイプのゲノム特性 学術背景 膵管腺癌（Pancreatic Ductal Adenocarcinoma、PDAC）は最も致命的な癌の一つであり、早期侵襲と転移の特徴を持っています。未分化肉腫癌（Undifferentiated Sarcomatoid Carcinoma、USC）はPDACの中でも特に凶悪で稀なサブタイプであり、全PDAC症例の2%-3%を占めています。USCの組織学的特徴には腺体分化の欠如と間質様紡錘形細胞の存在が含まれます。その稀少性のため、USCのゲノム景観および腫瘍微小環境（Tumor Microenvironment, TME）は十分に表現されておらず、既存の情報は主に症例報告や小規模なコホート研究に基づいています。 先行の一部症例報告では...
脳転移性乳癌におけるCDK12構造再編成の集積現象に関する研究報告 研究背景と目的 乳癌（Breast Cancer, BC）は、中枢神経系（Central Nervous System, CNS）に関連する第二の一般的な固形腫瘍です。脳転移性乳癌（Breast Cancer Brain Metastases, BCBMs）は、転移性乳癌患者にますます一般的になっています。活発な脳転移患者は通常臨床試験から除外され、この分野の臨床研究が遅れを取っています。次世代シーケンシング（Next-Generation Sequencing, NGS）技術の応用により、脳転移癌を特性化し、原発性腫瘍と比較することができ、そのゲノムの差異を明らかにすることができます。さらに、以前の研究ではBCBMsに免疫...
高次元マッピングにおけるヒトCEACAM1の免疫細胞上の発現と黒色腫耐性の関連性 研究背景 ヒトがん胚抗原細胞接着分子1（CEACAM1）は、同種および異種リガンドとの結合を通じて作用する抑制性細胞表面タンパク質です。人体腫瘍の免疫細胞におけるこのタンパク質の発現はまだ明らかではありません。PD1およびPD-L1が免疫療法のターゲットとして大きな進展を遂げたにもかかわらず、これらの療法に耐性を持つ患者の腫瘍も依然として存在します。耐性の関連因子を理解し、潜在的な新しい治療ターゲットを識別するために、本研究では黒色腫患者の免疫細胞サブセットにおけるCEACAM1、PD1およびPD-L1の詳細な発現マッピングを行い、その治療耐性状態との関係を探ります。 研究出典 この研究はYu-Hwa Huan...
将来の「抗生物質後の時代」の脅威の下で抗生物質への期待と需要を減らす方法 序論 抗生物質耐性は世界的な公衆衛生の脅威となりつつあります。この耐性の進化は生物学的プロセスであるにもかかわらず、特に農業生産や人間の医療における不必要な抗生物質の使用がこの進行を大幅に加速させました。この問題に対処するために、公衆衛生機関や活動は、抗生物質の乱用の結果を強調する脅威的な情報を伝達することがよくあります。例えば、抗生物質が完全に効かなくなる未来の「終末シナリオ」を描いています。しかし、この脅威的な情報の有効性は依然として議論の余地があり、特にCOVID-19のパンデミックの後では、一般市民の認識が変化した可能性があります。本研究は、この脅威的な情報の有効性とCOVID-19パンデミック中におけるその影...
臨床サンプル中の微生物を迅速に検出する統合メタゲノミクス手法の研究 背景紹介 本研究の背景は、現在の臨床メタゲノミクスの限界に基づいている。臨床メタゲノミクスとは、臨床サンプル中のすべての微生物のゲノムをシーケンスする方法であり、理想的にはヒトDNAを枯渇させた後に実施して感度を向上させ、ターンアラウンドタイムを短縮するものである。しかし、現在のヒトDNA枯渇方法は通常、DNAまたはRNAを含む微生物のみを優先的に保留するだけであり、両方を同時に保留することはできない。本研究は、実用的で迅速な機械的宿主枯渇方法を導入し、RNAおよびDNA微生物をナノポアシーケンシングで同時に検出できるものとするためのものである。 出典 この論文はAdela Alcolea-Medina、Christophe...
衰老誘導の MCPH1 核輸送がネクローシスを活性化し造血幹細胞機能を損なう研究 研究背景 造血幹細胞の老化は、多くの血液疾患のリスク増加と関連しており、DNA損傷は造血幹細胞老化の重要な要因の一つです。しかし、その背後にある分子メカニズムはまだ完全には理解されていません。最新の研究では、微脳蛋白（MCPH1）がマウスの造血幹細胞の核と細胞質で異なる機能を持つことが示されています。核内ではゲノムの安定性を維持し、細胞質ではリン酸化RIPK3と結合してネクローシスを抑制します。加齢に伴い、MCPH1は細胞質から核内に移動し、その結果、細胞質内のMCPH1の量が減少し、ネクローシスの活性化と造血幹細胞の機能悪化を引き起こします。 研究源 この研究はHangqing He、Yuqian Wang、...
研究背景 本研究は晩発性低テストステロン血症（LOH）を中心に展開され、加齢に関連する精巣機能の偏差、例えば LOH のメカニズムについての理解が未だに十分ではないことを明らかにすることを目指しています。本研究ではシングルセル RNA シーケンシング技術を用いて、LOH を患った人間の精巣を分析し、支持細胞（SCs）が精巣の微小環境における重要な代謝コーディネーターであることを特定しました。研究結果では、高齢の SCs においてリソソームの酸性度が低下し、これがオートファジーおよびファゴサイトーシス経路に影響を与え、SCs に代謝物、特にコレステロールが蓄積され、炎症遺伝子の発現が上昇しました。このため、これらの細胞を病的に変化した SCs と呼びました。食事によって誘導される高脂肪ストレス...