空間的に分離されたマクロファージ集団は結腸癌における異なる結果を予測します

空間的に分離されたマクロファージ集団は結腸癌における異なる結果を予測します

空間隔離されたマクロファージ群が結腸癌の異なる結果を予測する はじめに マクロファージは組織内の哨兵免疫細胞であり、多くの機能を果たしています。これには病原体防御、抗原提示、死んだ細胞の貪食、および組織修復を促進するシグナルの分泌が含まれます。腫瘍内では、マクロファージの浸潤はしばしば予後不良を示します。そのため、腫瘍関連マクロファージ(TAMs)は潜在的な癌治療の標的として広く注目されています。しかし、現行のマクロファージを標的とする治療法(例えば、CSF1経路阻害剤)は実体腫瘍に対してほとんど効果がないことが示されています。これは、おそらくマクロファージの異質性が無視されているためです。したがって、マクロファージの分子および機能的多様性をよりよく理解することが、癌治療において合理的にマク...

植物の遺伝子発現を制御するためのCRISPRiベースの回路

植物の遺伝子発現を制御するためのCRISPRiベースの回路

学術背景:植物バイオテクノロジーの分野では、従来の遺伝子操作方法は遺伝子を持続的に発現させることで所望の表現型や細胞活性を生産することに焦点を当てています。しかし、強力な持続的プロモーターは、遺伝子サイレンシング、代謝負担、または収量に対するその他の悪影響を引き起こす可能性があり、遺伝子の潜在的な利益を十分に引き出せないことがあります。合成生物学の方法を用いて合成遺伝子回路を構築することは、これらの課題を解決することが期待されており、合成遺伝子回路は複数の入力信号を統合して遺伝子出力を制御し、遺伝子発現の時空的制御を強化します。 著者および出典:この研究はオーストラリア西オーストラリア大学分子科学学院のMuhammad Adil Khan、Gabrielle Herring、Jia Yuan...

臨床的に誘導された培養方法を使用して、造血幹/前駆細胞から同種異系CAR-NKT細胞を生成する

臨床応用に向けたCAR-NKT細胞の生成に関する探討 研究背景 キメラ抗原受容体(CAR)T細胞療法は、FDA(食品医薬品局)によってB細胞悪性腫瘍や多発性骨髄腫の治療のために承認されています。しかし、自家CAR-T細胞製品の使用には、高コスト、製造時間の長さ、患者からの入手の難しさといった問題があります。特に、病状が進行している患者や前治療を受けた患者においては、CAR-T細胞の製造に用いるのに十分なT細胞が得られない場合があります。「オフザシェルフ(即時利用可能)」な細胞治療製品の開発に向けて、二つのアプローチが探求されています。一つは、移植片対宿主病(GVHD)のリスクを減少させるために内因性TCRの発現を削除した通常のαβT細胞を使用する方法であり、もう一つは、元々GVHDリスクの低...

ディープロングリードRNA-Seqを用いた高齢者前頭葉皮質における医学的に関連するRNAアイソフォームの多様性のマッピング

学術的背景 RNA選択的スプライシング(RNAアイソフォーム)は、遺伝子発現の調節において重要な役割を果たしています。ヒトのタンパク質コーディング遺伝子は平均して8つ以上のRNA選択的スプライシングを含み、これにより約4つのユニークなタンパク質コーディング配列が生じます。従来の短読長シーケンシング技術は読取り長の制限により、RNA選択的スプライシングを正確に組み立てて定量することができず、基礎生物学の理解が大幅に簡略化されていました。ますます多くの研究が、同じ遺伝体の異なる選択的スプライシングがタンパク質レベルでユニークな相互作用ネットワークを持っていることを示しています。特に、同じ遺伝体の一部の選択的スプライシングが細胞内で全く異なる、あるいは逆の機能を果たすことが示されています。例えばb...

DNAまたはRNAターゲット結合によって活性化されたCas9の転ヌクレアーゼ活性

本研究では、crRNAとtracrRNAによって指示され、DNAまたはRNAの標的の結合によって活性化される、「trans-cleavage」活性を持つ別のタイプの2型CRISPR-Casシステム、II型Cas9システムを実証しました。Cas9エフェクターヌクレアーゼのtrans-cleavage活性と核酸増幅技術を組み合わせることで、DACDおよびRACDと名付けた特異的なDNAおよびRNAサンプル検出プラットフォームを作成しました。 Cas9は、キメラsgRNAおよびノンキメラcrRNAとtracrRNAの指示の下で、顕著に異なるssDNA trans-cleavage活性を示しました。酵素動力学分析によると、crRNAおよびtracrRNAによって指示されるCas9 trans-cle...

原位AAV-SB-CRISPRスクリーニングによる腫瘍浸潤性NK細胞の遺伝的チェックポイントの同定

AAV-SB-CRISPRによる腫瘍浸潤原代自然殺細胞のスクリーニングが明らかにするCAR-NK療法の遺伝子的チェックポイント 生物技術と遺伝子編集技術の急速な発展に伴い、自然殺細胞(NK細胞)によるがん治療の臨床的潜在性を向上させるための研究への関心が高まっています。NK細胞療法は臨床治療において大きなポテンシャルを秘めていますが、その成功は多くの制限によって妨げられています。『Nature Biotechnology』誌に掲載された最新の研究では、研究者たちは原代NK細胞を用いて体内腺関連ウイルス(AAV)-睡美人(Sleeping Beauty, SB)-CRISPRスクリーニングを実施し、四種の固形腫瘍マウスモデルにおける腫瘍浸潤NK(TINK)細胞について研究しています。同時に、T...

塩基編集スクリーニングによるヒト初代T細胞の抗腫瘍変異効果のマッピング

塩基編集スクリーニングによるヒト初代T細胞の抗腫瘍変異効果のマッピング

塩基編集スクリーニング技術の腫瘍免疫治療T細胞研究への応用 免疫細胞療法、例えばT細胞移入療法やCAR T細胞療法は、一部の疾患分野において臨床がん治療の重要なツールとなっています。しかし、大多数のがん患者は細胞療法から恩恵を受けることができず、抵抗性は癌細胞の内在的変化(例えばB2Mの欠失、抗原の欠失またはCD58の欠失やダウンレギュレーション)または免疫抑制性腫瘍微小環境における細胞製品の制御による可能性があります。本研究は、塩基編集スクリーニング技術を用いて、既知または潜在的に臨床関連のある遺伝子部位における数千の変異体を生成し、これらの変異体がT細胞のバイオマーカーに与える影響を探索し、これらの変異体を利用して既存および将来の細胞癌免疫療法を改善する可能性を提案しています。 研究背景...

選択遺伝子ドライブによる腫瘍進化のプログラミングで薬剤耐性に積極的に対抗する

選択的な遺伝子ドライブによる腫瘍進化のプログラミングを通じて、薬剤耐性に積極的に対抗する 腫瘍の発展に伴い、がんへの標的治療は通常、薬剤耐性の進化によって失敗することが多い。本研究では、遺伝的異質性が事前に存在している場合でも、腫瘍進化を繰り返し操作して治療のチャンスを設計する方法を示している。私たちは選択的な遺伝子ドライブシステムを開発し、2つの遺伝子(スイッチ)で構成される癌細胞へ安定に導入することができ、誘導可能な適応的優位性を共有する適応コストと結びつけることができる。進化ダイナミクスの確率モデルを用いて、選択的遺伝子ドライブの設計基準を特定し、承認済みの複数のチロシンキナーゼ阻害剤の選択的プレッシャーを利用するプロトタイプを構築し、プロドラッグ触媒や免疫活性化誘発など、様々な治療メ...

代谢工学と生物触媒を通じた高収率ポルフィリン生産

代谢工学と生物触媒を通じた高収率ポルフィリン生産

研究背景 葉緑素及びその誘導体は医学、食品、エネルギー、材料分野において広く応用されているが、これらの化合物の効率的な生産には大きな課題がある。研究者は紫色非硫光合成細菌 Rhodobacter sphaeroides を効果的な細胞工場として利用し、酵素触媒と代謝工学を組み合わせて葉緑素化合物を生産した。 研究過程 プロセス設計 研究プロセスには遺伝子編集、発酵の促進、代謝調節および酵素催化のステップが含まれる。 遺伝子編集 研究チームはCRISPRiスクリーニングを通じて R. sphaeroides 内でターゲット遺伝子heMNを特定し、これによりcoproporphyrin III(CPIII)生産の改善が可能となった。 発酵の促進 PrrAB二成分系の時間調節と連続バッチ発酵戦略の...

酸化リン酸化はB細胞効果因子サイトカインを調節し、多発性硬化症における炎症を促進する

酸化リン酸化が B 細胞のエフェクターサイトカインを調節し、多発性硬化症における炎症反応を促進する 背景紹介 近年、B細胞の抗体非依存機能が健康および疾患において注目されており、特にさまざまなサイトカインを分泌する能力が話題となっている。これらの因子は局所免疫反応を活性化または抑制することができる。研究によると、B細胞のサイトカインの不調整は、複数の免疫介在性疾患、特に多発性硬化症(Multiple Sclerosis, MS)の原因の一つである。しかし、B細胞のサイトカイン発現の調節メカニズムについては依然として限られた理解しかない。本論文では、炎症促進性(例:GM-CSF表現)および抗炎症性(例:IL-10表現)のB細胞サイトカインの分泌がどのように調節されるか、特に酸化リン酸化(Oxi...