单细胞视角下的表观遗传年龄性质

单细胞视角下的表观遗传老化本质研究 研究背景 随着生物学研究的深入,科学家们发现DNA甲基化(DNA methylation, DNAm)的变化构成了预测年龄最可靠的指标之一——表观遗传时钟。然而,这些时钟确切衡量的衰老方面的机制尚不清楚。本研究旨在通过对比小鼠组织和单细胞的DNAm动态,阐明表观遗传老化的特性,并进一步通过单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)分析支持我们的发现。 研究来源 本研究由Andrei E. Tarkhov等人撰写,其来自Brigham and Women’s Hospital和Harvard Medical School等机构,于2024年6月由《Nature Aging》(自然老化)期刊发表。 研究方法 ...

通过PD-L1信号诱导的上皮−间质转化预测PD-L1高表达肺癌对免疫检查点抑制剂的响应欠佳

肿瘤细胞内在PD-L1信号诱导上皮间质转化(EMT)在PD-L1高表达的肺癌中预测免疫检查点抑制剂响应不良 研究背景及动机 在癌症免疫治疗中,程序性死亡配体-1(Programmed Death Ligand-1,简称PD-L1)通过与免疫细胞上的程序性死亡受体-1(Programmed Death-1,PD-1)结合来抑制免疫反应。然而,基于阻断PD-1/PD-L1相互作用的免疫检查点抑制剂(Immune Checkpoint Inhibitors,ICIs)已成为治疗非小细胞肺癌(Non-Small-Cell Lung Cancer,NSCLC)的主要方法之一。尽管PD-L1阳性患者对PD-1/PD-L1阻断的响应率约为40%,但仍需找到更有效的生物标志物来预测ICI治疗的效果。 大量研...

缺氧和辐射后再氧合作用诱导的HMHA1/ARHGAP45表达促进癌细胞HIF依赖性侵袭

癌细胞在缺氧和放射后再氧化诱导的HMHA1/ARHGAP45表达对癌细胞侵袭的贡献:依赖于HIF的机制 背景与研究动机 在本文研究之前,已有大量研究表明,固体肿瘤中的癌细胞在缺氧(hypoxia)环境下会获得例如侵袭性和抗治疗性等恶性特征,导致患者预后差(参考文献[3]、[6])。缺氧诱导因子(Hypoxia-Inducible Factor, HIF)作为代谢酶调节的主要角色,参与了许多缺氧响应的关键因子的调控。 特别是在放射治疗后,癌细胞在严重缺氧区域内幸存下来,经历了放射再氧化处理后,其侵袭性通过HIF依赖机制增强,进一步迁移到肿瘤血管附近从而导致复发。然而,这些再氧化处理后,HIF如何具体介导癌细胞的侵袭性变化,还尚未完全明确。为了解决这一科学问题,本研究主要针对HIF依赖机制如何在...

Oncofetal SNRPE通过调控FGFR4的可变剪接促进肝细胞癌的肿瘤发生

关于Oncofetal snrpe在肝细胞癌肿瘤发生发展中起关键作用的研究 研究背景及目的 肝细胞癌(HCC)是全球第六大流行癌症,导致癌症相关死亡的第三大原因。然而,由于对肿瘤关键分子事件认识的不足,针对HCC的有效治疗靶点仍然十分有限。本研究聚焦于剪接体相关基因在HCC中的显著改变,探索了胚胎肝发育与HCC过程中剪接体相关的胎儿蛋白作为肿瘤治疗靶点的潜力。 研究来源 本研究由Wu Qipeng、Liao Ruyan、Miao Chunmeng、Hasnat Muhammad、Li Le、Sun Lixin、Wang Xinru、Yuan Ziqiao、Jiang Zhenzhou、Zhang Luyong和Yu Qinwei联合完成。研究所属机构包括中国药科大学、广州海关技术中心、拉合尔...

神经母细胞瘤的肿瘤微环境介导的耐药性研究

背景 研究背景:内在和外在的肿瘤微环境(Tumor Microenvironment, TME)因素均会导致治疗抗药性。本文揭示了TME中产生的转化生长因子(Transforming Growth Factor, TGF)-β1增加了神经母细胞瘤(Neuroblastoma, NB)细胞的药物抗性。抗药性是癌症治疗失败的主要原因,通常由于癌细胞固有的基因组和染色体不稳定性以及选择压力和肿瘤异质性相关的表观遗传改变导致。另外,抗药性也可能由外部因素(如异常的血流和TME的影响)导致,称之为环境介导的药物抗性(Environment-Mediated Drug Resistance, EMDR)。 神经母细胞瘤是小儿最常见的颅外实体瘤,具有高复发风险。大约50%的NB患儿被归类为高风险癌症。尽管...

细胞膜损伤限制酵母的复制寿命并诱发人类成纤维细胞的早衰

科研报告:细胞质膜损伤限制酵母的复制寿命并诱导人类成纤维细胞的过早衰老 背景与研究动机 细胞质膜损伤(Plasma Membrane Damage, PMD)是所有细胞类型在面对环境干扰和细胞自发活动时都会经历的一种现象。已有研究表明,细胞质膜损伤后可能导致两种结果:细胞膜修复或细胞死亡。然而,对于这些损伤的长期结果,尤其是在复制寿命延长和细胞衰老等方面的影响仍然知之甚少。因此,本研究旨在探讨PMD在酵母和正常人类成纤维细胞中的具体影响,进一步揭示其在细胞衰老过程中的角色。 来源与作者 这项研究由来自多个日本科学研究机构的学者共同完成,包括Kojiro Suda、Yohsuke Moriyama、Nurhanani Razali等,他们分别隶属于Okinawa Institute of Sc...

HLA-A+三级淋巴结构与反应性肿瘤浸润淋巴细胞在食管鳞状细胞癌中的积极免疫治疗反应相关

在食道鳞状细胞癌(ESCC)中,免疫检查点阻断(ICB)疗法取得了显著的临床效益,然而,ICB治疗的总体响应率仍然很低。这一研究旨在识别食道鳞状细胞癌对ICB疗法的生物标志物以及探讨其潜在的临床相关性。 论文作者来自多个科研机构,包括复旦大学、中山医院、北京中国医学科学院和北京协和医学院。本研究的相关成果发表在2024年的《英国癌症杂志》(British Journal of Cancer)上。研究组共有多位成员共同参与了这项研究,其中张丹丹、蒋冬宪和蒋丽萍为共同第一作者,贾宇晨、刘云和刘志华为通讯作者。 研究方法包括对42例未经治疗的ESCC肿瘤组织的基因表达进行调查,识别了与不同免疫治疗响应相关的差异表达基因、肿瘤浸润淋巴细胞和免疫相关基因签名。通过NanoString GeoMx数字空...

SOX11 基因的表观遗传激活与原位导管癌复发和进展到浸润性乳腺癌的关联

Sox11在乳腺导管原位癌复发和进展中的表观遗传激活 背景介绍 乳腺导管原位癌(Ductal Carcinoma In Situ, DCIS)是一种非侵袭性的乳腺癌,其主要特征是管腔上皮细胞的过度增殖而被肌上皮细胞包围。DCIS在乳腺癌筛查中约占25%,并且其潜在生物学特性和预后存在异质性。虽然DCIS本身不是一种侵袭性疾病,但其进展为侵袭性导管癌(Invasive Ductal Carcinoma, IDC)的风险仍是一个重要的临床挑战。因此,迫切需要开发预测DCIS进展为侵袭性癌症的生物标志物。 目前,尽管有一些潜在的生物标志物如雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人类表皮生长因子受体-2(HER2)可用于预测DCIS的预后,更多关于DCIS进展的生物标志物仍然是亟待解决的问题。此前...

基于时序纵向磁共振成像的胶质瘤生长建模及其占位效应研究

肿瘤生长数学模型研究——利用纵向磁共振成像探究胶质瘤的扩展 近日发表在《IEEE Transactions on Biomedical Engineering》上的一篇文章,对胶质瘤(glioma)的数学建模及生长规律进行了系统性研究。该研究由Birkan Tunç、David A. Hormuth II、George Biros和Thomas E. Yankeelov完成,主要通过纵向磁共振成像(MRI)数据评估三种不同数学模型在模拟肿瘤生长以及质量效应(mass effect)中的性能差异。 研究背景 胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme, GBM)是最常见的原发性脑肿瘤,患者预后较差。GBM一个显著的特征是对周围脑组织的严重变形效应,即“质量效应”,目前已有大量...

磷酸肌酸促进通过稳定BRD2以促进胶质母细胞瘤生长的表观遗传重编程

由陈丽舒(Lishu Chen)、齐庆辉(Qinghui Qi)、姜晓庆(Xiaoqing Jiang)等多位科学家合作完成的研究成果在开创性的癌症发现(Cancer Discovery)杂志上发表,报道了磷酸肌酸(Phosphocreatine,PCr)如何通过稳定含溴结构域蛋白2(BRD2)来促进胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)的生长,这一发现为胶质母细胞瘤治疗提供了新的视角。 胶质母细胞瘤是最常见也是最致命的恶性脑肿瘤,其生存率非常低。尽管肿瘤的代谢重塑被认为是癌症的标志之一,但胶质母细胞瘤的特定代谢特征目前还未完全明了。研究者们发现,在GBM中存在一类具有自我更新能力的特殊细胞亚群,称为GBM干细胞(GSCs),它们对肿瘤的发展和对GBM治疗的抗性起着关键作用。最近的...