MECP2 重复综合征中的结构变异与表型变异性研究报道 学术背景 MECP2 重复综合征（MECP2 Duplication Syndrome，MRXSL）是一种 X 连锁基因组疾病，主要由 X 染色体上 MECP2 基因的拷贝数增加所致。这种疾病主要影响男性，临床特征多样，包括婴儿低张力、严重的发育迟缓、智力残疾、语言能力丧失、渐进性痉挛性瘫痪、胃肠问题、频繁的呼吸道感染和癫痫。虽然 MRXSL 病例表现出显著的临床多样性，但目前尚不清楚基因组结构变异与临床表型之间的具体联系。此外，复杂基因组重排（Complex Genomic Rearrangements, CGRs）在高达 38% 的 MRXSL 家庭中被发现，这进一步加深了对该疾病的复杂性认知。鉴于此，研究者希望通过综合基因组学、转...
全基因组范围甲基化研究揭示PTSD相关的新DNA甲基化位点：23个军民队列的Meta分析 学术背景及研究目标 创伤后应激障碍（Posttraumatic Stress Disorder, PTSD）是一种严重的精神疾病，通常发生在个人经历极端创伤事件后。PTSD的症状包括侵入性记忆、对触发记忆情境的回避或情感麻木，以及持续的高警觉反应，这些特征可能显著影响心理与生理健康。PTSD已被证明与慢性疾病风险增加相关，如心血管疾病等，这与其患者自我保健水平较低、药物依从性差及更高的物质使用率有关。 尽管大多数人遭遇过创伤事件，但只有少数发展为PTSD，这表明遗传和环境因素对PTSD的发生具有重要作用。以往的全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies, GWAS）...
关于卵巢癌基因组不稳定性研究的综合报道 背景与研究问题 卵巢癌作为一种致命的妇科恶性肿瘤，近年来的研究集中于拓展靶向疗法的可行性。多聚腺苷二磷酸核糖聚合酶（Poly(ADP-ribose) polymerase, PARP）抑制剂的引入，为治疗卵巢癌带来了划时代的治疗新选择，这种疗法尤其对患有同源重组缺陷（Homologous Recombination Deficiency, HRD）的患者具有显著疗效。然而，HRD的驱动因素除经典的BRCA1和BRCA2突变（BRCA1/2 mutations，以下简写为BRCAM）之外，还有哪些基因或变异参与其中仍不清晰。此外，关于非BRCA基因组不稳定性模式及其对HRD检测和精准治疗的影响也缺乏系统性的理解。 基于此，Alan Barnicle等研究...
重新审视Haemophilus influenzae的氨苄西林和头孢他啶的突变性耐药研究 背景与研究动机 Haemophilus influenzae（流感嗜血杆菌）是一种机会性细菌病原体，能够引发严重的呼吸道感染及侵袭性感染，如败血症和脑膜炎，特别是在婴儿、老年人和免疫力低下的个体中。近年来，随着β-内酰胺酶阴性氨苄西林耐药（BLNAR，β-lactamase-negative ampicillin-resistant）菌株的出现，以及基因型和表型耐药性之间的不明确关联，临床经验性治疗和患者管理面临严峻挑战。 β-内酰胺类药物如氨苄西林曾是治疗H. influenzae感染的首选，但由于氨苄西林耐药菌株的不断增加，许多国家的治疗方案已经向包含β-内酰胺酶抑制剂的联合治疗或第三代头孢菌素转变...
肺癌脑转移的多组学整合分析揭示代谢脆弱性作为新型治疗靶点 学术背景 肺癌是全球范围内发病率和死亡率最高的癌症之一，尤其是肺癌脑转移（Lung Cancer Brain Metastases, LC-BMs）是肺癌患者常见的并发症，且预后极差。尽管近年来肺癌的治疗手段有所进步，但针对脑转移的标准治疗方案仍然有限，疗效不佳。因此，深入理解肺癌脑转移的分子机制和肿瘤微环境，对于开发新的治疗策略至关重要。 肺癌脑转移的发生机制复杂，涉及基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多个层面的变化。近年来，随着多组学技术的发展，研究人员能够从多个维度全面解析肿瘤的分子特征，从而为精准治疗提供新的思路。然而，目前关于肺癌脑转移的多组学研究仍然较少，尤其是针对原发肺癌与脑转移病灶的配对分析更为稀缺。因此，本研究旨在通...
CD30对生发中心B细胞动态及IgG1转换B细胞扩展的影响 背景介绍 CD30（也称为TNFRSF8）是肿瘤坏死因子受体（TNF-R）超家族的成员之一，最初被认为是霍奇金淋巴瘤的标志物。然而，随后的研究发现，CD30也表达在其他淋巴瘤（如弥漫性大B细胞淋巴瘤和原发性渗出性淋巴瘤）以及活化的B细胞和T细胞表面。在生理条件下，表达CD30的B细胞数量非常少，主要存在于生发中心（GC）或非GC表型的B细胞中，且通常位于GC内部或边缘。 CD30通过与CD30配体（CD30-L，也称为CD153）的相互作用激活，CD30-L由活化的T细胞等细胞表达。CD30和CD30-L以三聚体结构相互作用，进而招募TNF-R相关因子（TRAF）并激活NF-κB、MAPK和JAK/STAT等信号通路。然而，CD30...
eIF4A1 和 eIF4A2 在 B 细胞发育和功能中的关键及差异作用 学术背景 在哺乳动物细胞中，翻译起始（translation initiation）是蛋白质合成的关键步骤，而真核起始因子 4A（eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A）在这一过程中扮演着重要角色。eIF4A 是一种 ATP 依赖的 RNA 解旋酶，能够解开 mRNA 5’ 非翻译区（5’ untranslated region, 5’ UTR）的二级结构，帮助 43S 前起始复合物（preinitiation complex, PIC）扫描 5’ UTR 以找到起始密码子。eIF4A 有两个高度同源的亚型：eIF4A1 和 eIF4A2。尽管它们在体外可以自由交换并参与 eIF4...
学术背景与问题提出 肿瘤抑制基因（Tumour Suppressor Genes, TSGs）的功能丧失（Loss-of-Function, LOF）突变在癌症中非常常见，但由于这些突变导致蛋白质功能的丧失或减弱，传统的药物靶向策略难以直接针对这些突变。因此，研究人员需要开发新的方法来揭示这些突变带来的细胞脆弱性，并寻找潜在的治疗靶点。KMT2D 是一个在多种癌症中频繁发生突变的肿瘤抑制基因，其功能丧失突变与多种癌症的发生和发展密切相关。然而，KMT2D 的功能网络及其在癌症细胞中的脆弱性尚未得到全面研究。 本文的研究旨在通过计算模拟的方法，绘制 KMT2D 的遗传网络，揭示其功能关联和癌症细胞的脆弱性，特别是通过合成致死（Synthetic Lethality, SL）相互作用，寻找潜在的...
UBXN6在巨噬细胞自噬诱导和炎症控制中的关键作用 背景介绍 先天免疫系统是机体抵御病原体入侵和炎症反应的第一道防线。单核细胞和巨噬细胞作为先天免疫系统的主要细胞类型，在感染和炎症过程中发挥着关键作用。然而，当这些细胞的功能失调时，可能会引发有害的炎症反应。因此，理解单核细胞和巨噬细胞如何调控炎症和先天免疫反应的机制，对于开发新的治疗策略以应对感染和炎症性疾病（如败血症）至关重要。尽管这一领域的研究已经取得了一些进展，但炎症与先天免疫之间的平衡机制仍未完全阐明。 蛋白质稳态（proteostasis）是维持细胞内蛋白质平衡的重要生物学过程，涉及自噬（autophagy）、内质网相关蛋白降解（ERAD）和蛋白酶体降解等多种途径。自噬是一种通过溶酶体降解大分子蛋白聚集体和受损细胞器的过程，在调控...
NUDT21通过自噬通路调控巨噬细胞过度激活 学术背景 炎症反应是机体免疫防御的重要组成部分，能够帮助清除病原体并促进组织修复。然而，炎症反应的失调可能导致慢性炎症性疾病，如炎症性肠病（IBD）、类风湿性关节炎（RA）、银屑病和系统性红斑狼疮（SLE）等。这些疾病通常伴随着免疫系统的异常激活和持续的炎症反应，严重时可能发展为危及生命的疾病，如噬血细胞性淋巴组织细胞增多症（HLH）。巨噬细胞的过度激活是这些炎症性疾病的关键特征，其异常功能会导致组织损伤、持续的炎症反应以及疾病严重程度的加剧。因此，研究巨噬细胞激活的复杂调控机制对于及时调整炎症反应、防止过度炎症具有重要意义。 在分子水平上，精确的转录调控和RNA代谢的改变与巨噬细胞的激活状态和细胞因子的产生密切相关。RNA代谢包括RNA的合成、...