高级别胃肠胰腺肿瘤的全面基因组和转录组特征

高级别胃肠胰腺肿瘤的全面基因组和转录组特征

高级别胃肠胰腺神经内分泌肿瘤的综合基因组和转录组特征研究报告 研究背景 高级胃肠胰腺神经内分泌肿瘤(high-grade gastro-entero-pancreatic neuroendocrine neoplasms, HG GEP-NENs)是一类具有神经内分泌分化特征的异质性恶性肿瘤。根据WHO 2019 [1]和2022 [2]标准,GEP-NENs目前被分为三类:神经内分泌肿瘤(NETs),神经内分泌癌(NECs)和混合型非神经内分泌-神经内分泌肿瘤。国际临床指南[3, 4]认可将GEP-NET G3和GEP-NECs作为一个覆盖性概念HG GEP-NENs,但强调GEP-NET G3和GEP-NECs在预后和治疗上的差异。GEP-NECs的预后较差,晚期患者中位总生存时间(OS...

磷酸肌酸促进通过稳定BRD2以促进胶质母细胞瘤生长的表观遗传重编程

由陈丽舒(Lishu Chen)、齐庆辉(Qinghui Qi)、姜晓庆(Xiaoqing Jiang)等多位科学家合作完成的研究成果在开创性的癌症发现(Cancer Discovery)杂志上发表,报道了磷酸肌酸(Phosphocreatine,PCr)如何通过稳定含溴结构域蛋白2(BRD2)来促进胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)的生长,这一发现为胶质母细胞瘤治疗提供了新的视角。 胶质母细胞瘤是最常见也是最致命的恶性脑肿瘤,其生存率非常低。尽管肿瘤的代谢重塑被认为是癌症的标志之一,但胶质母细胞瘤的特定代谢特征目前还未完全明了。研究者们发现,在GBM中存在一类具有自我更新能力的特殊细胞亚群,称为GBM干细胞(GSCs),它们对肿瘤的发展和对GBM治疗的抗性起着关键作用。最近的...

CHD2调控儿童神经胶质瘤细胞与神经元的相互作用

CHD2调控儿科胶质瘤中神经元-胶质瘤相互作用的研究报告 背景介绍 高等级胶质瘤(High-grade gliomas,HGG)是成人和儿科患者中致命的疾病。近年来研究表明,神经元活动能促进多种高等级胶质瘤亚群的进展。然而,调控这一过程的表观遗传机制尚不明确。本文报告了一种新的表观遗传调控机制,即染色质重塑因子Chromodomain Helicase DNA-binding Protein 2(CHD2)在以肿瘤相关H3.1K27M突变为特征的弥散性中线胶质瘤(Diffuse Midline Glioma,DMG)中调控神经元-胶质瘤相互作用的角色。 研究来源 这项研究由Xu Zhang、Shoufu Duan、Panagiota E. Apostolou等多位作者联合完成,来自Colum...

St. Jude Survivorship Portal:分享和分析大规模临床和基因组数据集

St. Jude Survivorship Portal:分享和分析大规模临床和基因组数据集

St. Jude Survivorship Portal: 分析及共享儿童癌症幸存者的大规模临床和基因组数据 研究背景 在美国,儿童癌症的五年生存率已从20世纪70年代的约60%上升到今天的超过85%。尽管生存率显著提高,但这些儿童癌症幸存者却面临着由于癌症及其治疗而导致的各种不良健康结果的风险。这些不良结果包括过早死亡、器官功能障碍、新生肿瘤、不良的社会经济结果、心理社会挑战以及总体生活质量的下降等。为了应对这些问题,主要的研究工作集中在确定其潜在原因、相关风险以及最易感的患者亚群。 与此有关的大规模纵向研究如St. Jude Lifetime Cohort (SJLife)和Childhood Cancer Survivor Study (CCSS)已生成了大量关于幸存者的综合数据,涵盖...

新型WRN解旋酶抑制剂选择性靶向微卫星不稳定癌细胞

在当今肿瘤治疗领域,精准医疗持续成为研究热点和发展趋势。随着科学技术的进步,人们开始更为精准地理解肿瘤细胞的特性及其生存的依赖性,以期找到新的治疗靶点。尤其是基于合成致死原理的策略,即针对肿瘤特有的遗传缺陷进行靶向治疗的药物研发,成为解决癌症治疗棘手问题的新希望。合成致死策略主要是基于肿瘤细胞与正常细胞在分子层面的差异,通过靶向那些对于肿瘤细胞存活至关重要,但对正常细胞影响较小的分子机制,达到选择性杀死肿瘤细胞,而不损害正常细胞的目的。 微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, MSI)是一种肿瘤遗传特征,常见于一些错配修复(Mismatch Repair, MMR)缺陷型癌症,如结直肠癌、子宫内膜癌和胃癌等。由于这类肿瘤细胞在基因组DNA水平上存在不稳定性,它...

ror2在胰腺肿瘤和腺癌中的细胞可塑性调控

ror2在胰腺肿瘤和腺癌中的细胞可塑性调控

研究报告:ROR2在胰腺癌细胞可塑性中的调节作用 背景介绍 胰腺导管腺癌(PDAC)是一种致命的疾病,绝大部分患者缺乏治愈的可能性。这部分是因为难以早期检测。PDAC的特征之一是其广泛的肿瘤细胞异质性,这种异质性既体现在“经典型”和“基底样”分子亚型之间的变化,也反映了由于细胞间的可塑性导致的治疗抵抗深层机制。在PDAC的进展中,细胞可塑性贯穿始终,包括正常细胞转化为前癌变性病变和恶性肿瘤的过程,同时伴随着不同细胞身份的获取。 已有研究表明,不同的胰管和腺泡细胞在胰腺癌小鼠模型中可以生成PDAC。腺泡细胞在小鼠中更易于转化。炎症或KRASG12D的致癌表达会诱导腺泡细胞转化为具有导管样性质的前体细胞,即腺泡导管化生(ADM)。化生性导管细胞的特征是上调定义正常导管细胞的基因表达(例如KRT1...

致癌KRAS依赖的基质Interleukin-33引导胰腺微环境促进肿瘤生长

胰腺癌组织中IL-33促肿瘤生长的作用机制及其潜在治疗靶点 背景介绍 胰腺癌(Pancreatic Cancer, PDA)是全球最致命的恶性肿瘤之一,其临床表现进展迅速且治疗效果不佳,五年生存率仅为13%。在美国,PDA目前是第3大癌症相关死亡原因。超过95%的PDA病例中发现了小GTP酶KRAS的驱动性突变,最常见的是KRAS^G12D突变。KRAS^G12D在小鼠模型中可以驱动胰腺组织向癌前病变转化,如胰腺上皮内肿瘤(Pancreatic Intraepithelial Neoplasia, PanIN),最终进展为侵袭性PDA。 胰腺癌中存在着大量的纤维炎症性微环境,这种环境中不仅包含基质细胞,还包括免疫抑制性免疫细胞及丰盛的细胞外基质(Extracellular Matrix, E...

ZNF397缺陷触发TET2驱动的谱系可塑性和前列腺癌中的AR靶向治疗耐药性

ZNF397缺陷触发TET2驱动的谱系可塑性和前列腺癌中的AR靶向治疗耐药性

ZNF397缺乏引发TET2驱动的谱系可塑性和前列腺癌中的AR靶向治疗耐药性 学术背景及研究动机 现有的研究证据表明,癌细胞的谱系可塑性和表观遗传重新编程允许它们通过采用谱系可塑性来逃避谱系依赖的靶向治疗。然而,这些癌细胞利用表观遗传调控机制获得谱系可塑性和治疗抵抗性背后的机制仍然知之甚少。本文的作者们识别出锌指蛋白397(ZNF397)是一种真正的雄激素受体(AR)共激活子,在维持AR驱动的前列腺癌细胞中的内腔谱系中具有关键作用。ZNF397的缺失促进了癌细胞从AR驱动的内腔谱系向由TET2驱动的谱系可塑状态的转变,最终导致对AR信号抑制疗法的抗药性。令人着迷的是,该研究发现TET2抑制剂可以消除那些ZNF397缺乏肿瘤对AR靶向治疗的耐药性。这些发现揭示了前列腺癌通过表观遗传重塑获得谱系...

CD28 共刺激增强 NK 细胞中 CAR 信号传导 via Lck/CD3ζ/ZAP70 信号轴

CD28共刺激作用通过LCK/CD3ζ/ZAP70信号轴增强CAR-NK细胞的功能 研究背景与目的 嵌合抗原受体(Chimeric Antigen Receptor, CAR)T细胞治疗在治疗某些晚期癌症患者中表现出显著效果。然而,CAR-T细胞疗法存在着诸多限制,例如高成本、制备过程繁琐及细胞因子释放综合征和神经毒性等。因此,研究人员转向探讨替代方法,其中自然杀伤(Natural Killer, NK)细胞作为癌症免疫治疗的热门候选者,因为其可作为现成的细胞免疫疗法且不会引起移植物抗宿主病(Graft-Versus-Host Disease, GVHD)。 在本研究中,科研人员研究了在针对CD70的CAR构建中,采用不同的共刺激分子对NK细胞抗瘤活性的影响,试图找出最有效的共刺激信号域并评...

CRISPR依赖性筛选在原代造血干细胞中鉴定出KDM3B是IDH2和TET2突变基因型的特异性易感性

CRISPR依赖筛选在原代造血干细胞中识别出KDM3B作为IDH2和TET2突变基因型的特异性易感性 背景和研究意义 克隆性造血(Clonal Hematopoiesis, CH)是指由特定突变的造血干细胞(Hematopoietic Stem Cell, HSC)引发的基因上不同的亚群细胞的异常生长。这种现象在60岁以上的人群中十分普遍,影响了超过20%的人口。CH与急性髓系白血病(AML)的恶性转化风险增加有关,并且还与更高的全因死亡率和各种与年龄相关的疾病(如心血管疾病)相关联。尽管之前的基因研究已经识别出与CH相关的基因突变,但迄今为止在CH中识别治疗靶点的工作还存在挑战。这主要是因为缺乏适用于研究初级造血干细胞(HSPC)的体外平台。在这一研究中,作者利用HSPC和骨髓内皮细胞(B...