双向表观遗传编辑揭示基因调控层次

双向表观遗传编辑揭示基因调控的层次结构 背景和研究动机 在人类基因组中,非编码元件如增强子(enhancer)在基因调控中的作用已被广泛认知。然而,目前常用的CRISPR干扰方法在研究非编码元件和遗传相互作用方面仍存在一些局限性。主要是因为传统的CRISPR方法,如CRISPR干扰(CRISPRi)和CRISPR激活(CRISPRa),仅能一次性进行单个位点的编辑。这限制了研究人员对基因调控网络中相互作用的深入理解。因此,本研究致力于开发一种可以双向编辑表观遗传特性的系统,以解决这些问题。 来源和作者信息 这篇题为”Bidirectional Epigenetic Editing Reveals Hierarchies in Gene Regulation”的研究论文,发表于《Nature ...

UK Biobank的原则性提炼揭示了人类变异的潜在结构

在本报告中,我们详细评估了一篇刊登于Nature Human Behaviour杂志的科研论文,标题为《原则性提炼英国生物库表型数据揭示人类变异的潜在结构》。该研究由Caitlin E. Carey、Rebecca Shafee、Robbee Wedow等负责,在线发表时间为XX年XX月XX日,出处为https://doi.org/10.1038/s41562-024-01909-5。 研究背景和意义 随着公共和私人对大规模数据收集和整合的投资,近年来出现了称为生物库的数据仓库,将健康成果与成千上万个个体的生物样品关联起来。生物库包含丰富而详细的从电子健康记录(EHR)、自报调查措施、实验室检验和体力及认知评估中提取的数千个变量。尽管这些庞大的资源现在推动了人类健康和疾病的发现,但数据的广度...

多重脑脊液蛋白质组学识别阿尔茨海默病诊断和预测的生物标志物

阿尔茨海默病诊断和预测的脑脊液蛋白质组学研究 背景与研究目的 阿尔茨海默病(AD)是一种导致记忆丧失和认知能力下降的神经退行性疾病,目前全球范围内仍无有效的治愈方法。传统上,AD的病理特征包括β淀粉样蛋白(Aβ)斑块和tau蛋白神经原纤维缠结。然而,这些特征仅反映了AD复杂病理过程的一部分,未能全面揭示其生物学基础。近年来,针对Aβ和tau的疾病修正治疗效果不佳,这进一步突显了扩展AD生物标志物研究的重要性。为了准确诊断和预后AD,尤其是在疾病早期阶段,识别更多高性能生物标志物是至关重要的。 论文来源与作者 本文发表于《Nature Human Behaviour》杂志,题为“Multiplex cerebrospinal fluid proteomics identifies biomar...

不利的童年经历对情绪和焦虑障碍及物质依赖的基因环境作用和中介效应

不利童年事件、情绪及焦虑障碍与物质依赖的基因和环境效应研究 一、研究背景及意义 不利童年事件(ACE,adverse childhood events)常常对个体的精神健康和物质依赖产生深远影响。已有研究表明,ACE与情绪和焦虑障碍(Mood and Anxiety Disorders,M/AD)以及物质使用障碍(Substance Use Disorders,SUD)之间存在密切关联。然而,具体效果到底是直接的还是间接的,这些效应是否受到基因风险的调节,目前尚不清楚。 这篇发表在《Nature Human Behaviour》上的研究文章,旨在探讨ACE对M/AD和SUD的影响机制,并研究多基因风险评分(Polygenic Risk Scores,PRS)在这个过程中的调节作用。研究者通过...

决策不确定性作为运动记忆的情境线索

决策不确定性作为运动记忆的情境线索 背景介绍 在足球比赛中的点球大战中,队员可能面临两种截然不同的决策情境。例如,某位球员可能决定果断地将球踢向右侧角落,因为看见守门员正在向另一侧移动,或者他可能在不确定守门员动作时,踢出相同的射门动作。我们普遍认为,无论前期决策是否确定,两种情况调用和执行的运动记忆(例如,踢球到右侧的运动程序)应该是相同的。然而,这一假设是否成立呢?这是本文的研究核心。 现有的知觉决策模型认为,一旦做出决策,随后的运动程序会不考虑之前决策过程中的不确定性,实现单一的运动任务。然而,在本文的研究中,作者挑战了这一观点,提出决策不确定性实际上可以作为运动记忆的情境线索。 运动学习方面的主流理论认为,大脑通过情境推断过程,灵活地形成和切换不同的运动记忆,这主要依赖于直接指定动作...

心理健康对健康老龄化的因果效应的孟德尔随机化证据

科研报告:心理健康对健康老龄化的因果效应 研究背景 随着人均寿命的显著增加,老龄化问题日益突出。人们面临的共病(comorbidity)和残疾、社会整体的医疗服务和财政稳定性等挑战日趋严重。实现健康老龄化,即使在寿命显著延长的情况下保持良好的健康质量成为了亟待解决的问题。心理健康(mental well-being)被认为在多种生活习惯和疾病中起着重要作用,并且是健康老龄化的关键因素。尽管一些调查和队列研究发现了心理健康与理想的身体健康、较好的功能能力或增加的生存率之间的联系,但由于观察性研究的内在局限性,如混杂偏倚和逆向因果关系,心理健康和健康老龄化之间的因果关系尚未得到确定。 此外,心理健康和老龄化轨迹与社会经济地位(SES,socioeconomic status)复杂交织,这进一步增...

比较11个国家的经验和描述基础经济偏好

比较11个国家的经验和描述基础经济偏好 背景与动机 近年来的研究显示,人类在对奖励价值的编码过程中存在高度情境依赖性,这在某些情况下会导致次优决策。然而,这种计算限制是否是人类认知的普遍特征仍不清楚。在这项研究中,作者研究了来自11个国家(阿根廷、伊朗、俄罗斯、日本、中国、印度、以色列、智利、摩洛哥、法国和美国)的561名个体的行为,旨在探索奖励价值编码的情境依赖性是否是人类认知的一致特征。 研究来源 该研究由Hernán Anlló、Sophie Bavard、Fatimaezzahra Benmarrakchi、Darla Bonagura等多位学者合作完成,分别来自多个国际知名学术机构,参与团队包括巴黎高等师范学校、瓦瑟达大学等。研究结果发表于《Nature Human Behavio...

人类腹内侧前额叶皮层在亲社会动机中的必要性

人类腹内侧前额叶皮层对亲社会动机的必要性 研究背景及动机 腹内侧前额叶皮层(ventromedial prefrontal cortex,vmpfc)在决策过程中扮演着至关重要的角色。功能性神经影像学研究表明,vmpfc在处理奖励和努力方面起着关键作用,同时也与亲社会行为相关。然而,vmpfc是否在这些功能中必不可少,仍然是未知的。许多关于vmpfc的病灶研究多为个案研究或包含少于十名患者的小组研究,考虑到个体在社会行为、努力和奖励处理方面的典型变异性,较大的样本量对于得出可靠的结论至关重要。因此,本研究旨在通过比较具有罕见焦点vmpfc病灶的患者(n=25)、其他部位病灶的患者(n=15)和健康对照组(n=40),探讨vmpfc在亲社会行为中的因果作用。 论文来源 这篇研究论文由Patri...

脑全功能连接在功能性磁共振成像扫描中的伪影性膨胀

基于功能磁共振成像扫描的大脑范围内的功能连接性与时间增强的非神经源低频振荡(SLFO)血流信号有关 在神经科学领域,一个核心的问题是大脑的连接如何随着时间的推移重新配置,以支持适应性功能的变化。这种随时间动态变化的神经元变化可以通过功能磁共振成像(fMRI)在人类中测量,通过功能连接性(FC)的估计。FC量化了神经元活动在大脑不同区域间的协调程度,从而反映了神经连接的强度。 精确测量FC及其随时间变化的能力,依赖于基于fMRI的血氧水平依赖(BOLD)信号的可靠性、有效性和特异性——这是量化神经活动的基本输入。这项研究显示,基于fMRI的大脑功能连接性估计在静息态和任务基础的扫描期间以空间异质的速率人为膨胀。这造成了假阳性连接强度变化和大脑连接图的空间扭曲。数据证明,这种伪影是由SLFO血流...

基于CRISPRi的植物基因表达控制电路

基于CRISPRi的植物基因表达控制电路

学术背景:在植物生物技术领域,传统的基因操作方法侧重于通过持续表达转基因来生产所需的表型和细胞活性。然而,强大的持续启动子可能会导致基因沉默、代谢负担或对产量产生其他不良影响,从而无法充分实现转基因的潜在益处。通过合成生物学方法,构建合成基因回路有望解决这些挑战,合成基因回路通过整合多种输入信号来控制基因输出,增强对基因表达的时空控制。 作者及来源:本研究源自澳大利亚西澳大学分子科学学院的多位研究人员,包括Muhammad Adil Khan、Gabrielle Herring、Jia Yuan Zhu 等,在《Nature Biotechnology》杂志上发表,文章发表日期为接收日期:2022年7月29日,接受日期:2024年4月10日,发布日期和在线更新请查阅文章。 研究流程: 1)首...