高通量发现MHC I类和II类限制T细胞表位的新型合成细胞回路 研究背景及问题 近年来，抗原发现技术已经取得了显著进展，特别是针对人类T细胞受体（TCRs）在主要组织相容性复合体（Major Histocompatibility Complex, MHC）I类限制性识别中的运用。然而，针对MHC II类限制与小鼠TCR活性的研究与技术相对滞后。这种局限性阻碍了多种免疫相关疾病如癌症、传染病和自身免疫疾病的治疗和研究。这篇文章旨在报告一种新型的TCR抗原发现方法，即抗原肽的TCR映射（TCR mapping of Antigenic Peptides, TCR-MAP），以填补这一研究空白。 论文来源 这篇文章由Ayano C. Kohlgruber、Mohammad H. Dezfulian...
空间隔离的巨噬细胞群体预测结肠癌的不同结果 引言 巨噬细胞是组织中的前哨免疫细胞，执行多种功能，包括病原防御、抗原呈递、吞噬死亡细胞以及分泌驱动组织修复的信号。在肿瘤中，巨噬细胞的渗透常常意味着病人预后不良。因此，肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）作为潜在的癌症治疗靶点受到了广泛关注。然而，目前针对TAMs的单一药物（如CSF1通路抑制剂）在对抗实体肿瘤方面显示出极小的疗效，这可能是因为这些疗法忽视了巨噬细胞的异质性。显然，需要更好地理解巨噬细胞的分子和功能多样性，以便合理地在癌症治疗中对巨噬细胞进行靶向治疗并预测临床结果。 论文信息 本文由Magdalena Matusiak等人撰写，来自斯坦福大学病理学系、生物医学信息学研究中心、生物医学数据科学系、生物工程系、微生物学和免疫学系、发育生物学系...
贫困对精神疾病的影响研究：基于UK Biobank的孟德尔随机化分析 本文旨在探究贫困与精神疾病之间的因果关系。尽管已有多项研究表明低社会经济地位和精神疾病之间存在关联，但大多数研究未能确定贫困是否直接导致精神疾病，还是精神疾病导致了贫困。本文通过英国生物银行（UK Biobank）和精神病学基因组联盟（Psychiatric Genomics Consortium）的数据，分析了九种精神疾病（注意缺陷多动障碍（ADHD）、厌食症（AN）、焦虑症（ANX）、自闭症（ASD）、双相障碍（BD）、重度抑郁障碍（MDD）、强迫症（OCD）、创伤后应激障碍（PTSD）和精神分裂症（SZ））与贫困之间的因果关系。 研究的背景 早在1958年，Hollingshead和Redlich研究发现社会经济背景...
综合分析多基因风险评分与生活方式对心血管疾病发病风险的联合影响：来自中国Kadoorie生物库的研究报告 引言 心血管疾病（CVD）是全球范围内主要的健康威胁之一。尽管过去几十年间，50岁以上成年人中CVD的发病率和流行率保持稳定或逐渐下降，但15-49岁人群中的CVD发病率却呈上升趋势。尤其是早发性CVD影响了越来越多的年轻人，凸显了有效预防的迫切需求。遗传和环境因素共同影响早发性CVD的风险。多基因风险评分（PRS），通常来源于全基因组关联研究（GWAS），已经成为量化个体遗传易感性的重要工具。然而，现有PRS在东亚人群中，尤其是预测中风等CVD亚型时表现不佳。此外，针对中国人群脑出血（ICH）的PRS研究尚属空白。本研究通过结合多种CVD及相关风险因素的PRS，开发出三个特定疾病的多基...
研究背景: 自杀是全球性的公共卫生挑战，但关于行为因素和生理因素与自杀企图（suicide attempts，SA）之间的关系仍然存在很大的不确定性。以往的研究往往集中于有限的假设因素，如精神疾病（如抑郁症）、个性和心理特征（如绝望感）以及社会和家庭因素（如低社会支持和生活压力）。这样的狭隘视角可能导致其他风险因素被忽视。为了填补这些研究空白，本研究团队开展了大规模的种系统分析和孟德尔随机化分析，以确定英国生物银行数据集中可能与SA相关的行为和生理风险因素。 研究来源: 此论文由以下研究人员撰写：Bei Zhang、Jia You、Edmund T. Rolls、Xiang Wang、Jujiao Kang、Yuzhu Li、Ruohan Zhang、Wei Zhang、Huifu Wang...
考古学证据揭示冰河时代澳洲原住民仪式的持续传承 研究背景 本研究旨在探索原住民社会中通过考古学途径追溯传统仪式的可能性。工具书写的社会中，少有超过几百年的民族志知识能够通过考古学方法验证。研究团队应该Gunaikurnai原住民长者的邀请，在澳大利亚阿尔卑斯山脉的Cloggs洞穴开展了考古发掘。在Gunaikurnai区域，洞穴在19世纪中叶的殖民时期并未用于居住，而是作为原住民医疗人员和女性执行仪式的隐蔽场所。通过对Cloggs洞穴的发掘，考古学家发现了年代可追溯至冰河时代末期、距今约11,000至12,000年的迷你壁炉和修剪的木制物品，他们与19世纪民族志记载中的Gunaikurnai仪式装置相符。这一发现表明，一个具有民族志记载的仪式实践延续了500代，起源可以追溯至冰河时代末期。 ...
双向表观遗传编辑揭示基因调控的层次结构 背景和研究动机 在人类基因组中，非编码元件如增强子（enhancer）在基因调控中的作用已被广泛认知。然而，目前常用的CRISPR干扰方法在研究非编码元件和遗传相互作用方面仍存在一些局限性。主要是因为传统的CRISPR方法，如CRISPR干扰（CRISPRi）和CRISPR激活（CRISPRa），仅能一次性进行单个位点的编辑。这限制了研究人员对基因调控网络中相互作用的深入理解。因此，本研究致力于开发一种可以双向编辑表观遗传特性的系统，以解决这些问题。 来源和作者信息 这篇题为”Bidirectional Epigenetic Editing Reveals Hierarchies in Gene Regulation”的研究论文，发表于《Nature ...
在本报告中，我们详细评估了一篇刊登于Nature Human Behaviour杂志的科研论文，标题为《原则性提炼英国生物库表型数据揭示人类变异的潜在结构》。该研究由Caitlin E. Carey、Rebecca Shafee、Robbee Wedow等负责，在线发表时间为XX年XX月XX日，出处为https://doi.org/10.1038/s41562-024-01909-5。 研究背景和意义 随着公共和私人对大规模数据收集和整合的投资，近年来出现了称为生物库的数据仓库，将健康成果与成千上万个个体的生物样品关联起来。生物库包含丰富而详细的从电子健康记录（EHR）、自报调查措施、实验室检验和体力及认知评估中提取的数千个变量。尽管这些庞大的资源现在推动了人类健康和疾病的发现，但数据的广度...
阿尔茨海默病诊断和预测的脑脊液蛋白质组学研究 背景与研究目的 阿尔茨海默病（AD）是一种导致记忆丧失和认知能力下降的神经退行性疾病，目前全球范围内仍无有效的治愈方法。传统上，AD的病理特征包括β淀粉样蛋白（Aβ）斑块和tau蛋白神经原纤维缠结。然而，这些特征仅反映了AD复杂病理过程的一部分，未能全面揭示其生物学基础。近年来，针对Aβ和tau的疾病修正治疗效果不佳，这进一步突显了扩展AD生物标志物研究的重要性。为了准确诊断和预后AD，尤其是在疾病早期阶段，识别更多高性能生物标志物是至关重要的。 论文来源与作者 本文发表于《Nature Human Behaviour》杂志，题为“Multiplex cerebrospinal fluid proteomics identifies biomar...
不利童年事件、情绪及焦虑障碍与物质依赖的基因和环境效应研究 一、研究背景及意义 不利童年事件（ACE，adverse childhood events）常常对个体的精神健康和物质依赖产生深远影响。已有研究表明，ACE与情绪和焦虑障碍（Mood and Anxiety Disorders，M/AD）以及物质使用障碍（Substance Use Disorders，SUD）之间存在密切关联。然而，具体效果到底是直接的还是间接的，这些效应是否受到基因风险的调节，目前尚不清楚。 这篇发表在《Nature Human Behaviour》上的研究文章，旨在探讨ACE对M/AD和SUD的影响机制，并研究多基因风险评分（Polygenic Risk Scores，PRS）在这个过程中的调节作用。研究者通过...