患者由来のミニ結腸は腫瘍微小環境の複雑性を長期モデリングすることを可能にする

患者由来のミニ結腸は腫瘍微小環境の複雑性を長期モデリングすることを可能にする

患者由来のミニコロンを用いた腫瘍微小環境の複雑性の長期モデル 背景紹介: 腫瘍とその周囲の微小環境との相互作用は、がんの発展と治療に深い影響を与えます。しかし、既存のin vitro腫瘍モデルは、これらの複雑な相互作用を捉える能力に欠けています。この問題を解決するため、本研究では、患者特有のがん細胞とその微小環境に基づくミニコロンモデルを革新的に開発し、がん治療のための新しい実験プラットフォームを提供しました。 研究チームと出版情報: この研究は、スイス連邦工科大学ローザンヌ校(EPFL)幹細胞生物工学研究所のL. Francisco Lorenzo-Martinらの指導の下、複数の研究機関が共同で行いました。研究成果は『ネイチャー・バイオテクノロジー(Nature Biotechnolog...

シンテニー分析を用いた複雑な微生物群の株追跡により種ごとの進化モードが明らかに

複雑な微生物群集における遺伝子配列分析を用いた菌株追跡による種特異的進化パターンの解明 背景紹介 微生物の集団は、単一ヌクレオチドの変異と構造変化(組換え、挿入、欠失など)を通じて異なる菌株に分化します。大多数の菌株比較方法は主に単一ヌクレオチド多型(SNP)の差異を量化し、構造変化を無視しています。しかし、組換えは多くの種(ヒト病原体を含む)の表現型の多様化の重要な推進要因です。本稿では、SynTrackerと呼ばれるツールを紹介します。このツールは遺伝子配列(ゲノム内の相同領域のシーケンスブロックの順序)を使用して微生物菌株を比較します。遺伝子配列は既存の菌株比較ツールによって十分に活用されていない豊富なゲノム情報源です。SynTrackerはSNP感度が低く、データベースを必要とせず、...

単一サンプルの腫瘍サブクローン再構築のクラウドソースベンチマーク

群体リソースに基づく単一サンプル腫瘍サブクローン再構築アルゴリズム 背景紹介 癌の進化過程と腫瘍の遺伝的異質性は、現代腫瘍学研究の重要な分野です。腫瘍は正常細胞から進化し、体細胞変異を獲得することで徐々に発展します。これらの変異は細胞クロマチン構造や内因性及び外因性の誘変圧力の影響を受け、確率的に発生します。特定の変異が細胞に選択的優位性を提供すると、その子孫細胞は局所環境で拡大することができます。長年の蓄積を経て、最終的に多くの癌の特性を持つ細胞集団、すなわちクローンが形成されます。異なる腫瘍細胞亜群(サブクローン)は、ドリフトまたは選択圧力を通じて細胞集団内に出現します。この進化的特徴は臨床上重要であり、遺伝的異質性は予後不良、変異の多さ、耐薬性に関連しています。そのため、腫瘍の進化過程...

中枢神経系自己免疫疾患患者における抗BCMA CAR T細胞療法の単細胞分析

中枢神经系统(CNS)自身免疫性疾病,如視神経脊髄炎スペクトラム障害(NMOSD),は視神経炎と脊髄炎の再発を特徴とする炎症性自身免疫脱髄疾患です。NMOSDの治療において重大な進展があるにもかかわらず、一部の患者は現行の治療に反応せず、病状が反復し治癒が難しい場合があります。これは、現在の治療法がCNS内の免疫失調を効果的にターゲットにできていない可能性があります。抗水チャネルプロテイン4(AQP4)免疫グロブリンG(IgG)は抗体依存性細胞媒介性細胞毒性および補体依存性細胞毒性を含む多様な経路を通じてCNS脱髄損傷を引き起こします。 キメラ抗原受容体(CAR)T細胞治療は血液癌の長期管理において潜在能力を示し、いくつかの難治性自身免疫疾患の治療において初期効果を示しています。しかし、CA...

酸化リン酸化はB細胞効果因子サイトカインを調節し、多発性硬化症における炎症を促進する

酸化リン酸化が B 細胞のエフェクターサイトカインを調節し、多発性硬化症における炎症反応を促進する 背景紹介 近年、B細胞の抗体非依存機能が健康および疾患において注目されており、特にさまざまなサイトカインを分泌する能力が話題となっている。これらの因子は局所免疫反応を活性化または抑制することができる。研究によると、B細胞のサイトカインの不調整は、複数の免疫介在性疾患、特に多発性硬化症(Multiple Sclerosis, MS)の原因の一つである。しかし、B細胞のサイトカイン発現の調節メカニズムについては依然として限られた理解しかない。本論文では、炎症促進性(例:GM-CSF表現)および抗炎症性(例:IL-10表現)のB細胞サイトカインの分泌がどのように調節されるか、特に酸化リン酸化(Oxi...

核塩基アダクトはMR1に結合し、MR1制限T細胞を刺激する

核酸塩基付加物がMR1と結合しMR1制限性T細胞を刺激 摘要 本論文は、VacchiniらによるMR1制限性T細胞(MR1T細胞)に関する最新の研究成果を概説している。この研究では、リボ核酸塩基付加物がMR1T細胞抗原として存在することを発見し、それらが腫瘍細胞内での代謝経路と生理機能を明らかにした。研究成果は、生理および病理条件下におけるMR1T細胞の役割とその治療潜力の理解に重要な意義を持つ。 研究背景 MR1T細胞は新しく発見されたT細胞サブセットで、微生物感染に依存せずにMR1分子によって提示される自己抗原を認識することができる。現在、MR1T細胞の自己抗原の性質は明確ではなく、それが生理機能と治療潜力の理解を妨げている。本研究は、遺伝子、薬理学、および生化学的手法を組み合わせて、M...

TREM2欠損が腸マクロファージと微生物群を再プログラムして抗PD-1腫瘍免疫療法を強化

TREM2欠損による腸管マクロファージと微生物叢の再構築による抗PD-1腫瘍免疫療法の強化 ワシントン大学医学校の研究チーム、ブランダ・ディ・ルッチアなど複数の科学者が率いるグループは、先ごろ「Science Immunology」誌に研究論文を発表し、腸管微生物叢および腫瘍関連マクロファージがどのように抗PD-1免疫チェックポイント阻害治療に影響を与えるかを明らかにしました。この研究は、マクロファージ上のトリガーレセプターTREM2をブロックまたは削除することで、体内の抗腫瘍T細胞応答を強化することができることを確認し、TREM2欠損マウスでは抗PD-1治療後、腸管マクロファージが炎症促進状態に転じ、腸管微生物叢内のルミノコッカス属細菌(Ruminococcus gnavus)が増加するこ...

LRIG1はリガンドVISTAと結合し、腫瘍特異的なCD8+ T細胞応答を損なう

免疫チェックポイント阻害剤(ICIs、または免疫チェックポイントブロッカーとも呼ばれる)は、近年、がん免疫療法において重要な進展を遂げた薬剤のひとつです。この種の薬は主にプログラム細胞死蛋白質1(PD-1)と細胞毒性Tリンパ球関連蛋白質4(CTLA-4)のブロックにより、抗腫瘍T細胞反応を活性化します。しかし、既存のICIs療法の全体的な反応率は依然として低いため、新しい免疫チェックポイントを治療標的として探索することが緊急に求められています。最近の研究で、「幹細胞様」腫瘍特異的CD8+ T細胞がICIs療法に応答する上で重要な役割を果たしていることが確立されました。これらの細胞は休止状態から離脱し、増殖爆発を経験して機能を発揮します。しかし、これらの「幹細胞様」T細胞の休止状態を維持するメ...

さまざまな組織におけるヒトγδT細胞は、一生にわたる特定の部位の成熟ダイナミクスを示す

研究背景 γδT細胞は免疫システムで重要な役割を果たしており、特に保護性免疫、恒常性および組織修復の面で顕著です。主要組織適合性複合体(MHC)による制限を受ける従来のαβT細胞と異なり、γδT細胞は直接外周組織に播種し、MHC-ペプチド認識に依存せずに多様な微生物刺激に反応します。マウスモデルにおいて、γδT細胞の発達は「波」としての時間的なポイントで屏障サイトに位置づけられています。これらの研究から、γδT細胞が早期発達過程での重要な役割を提供するための手がかりがもたらされました。しかし、人間のγδT細胞の機能は外周組織での役割が依然として不明瞭であり、ほとんどの研究は血液および胸腺に集中しています。これらの細胞が腫瘍や特定の病原体免疫応答において果たしている役割を考慮すると、異なる年齢...

PD-1 発現細胞の標的除去は、末梢クローン削除を通じて免疫寛容を誘導する

末梢クローン削除によるPD-1発現細胞を標的とした免疫寛容の誘導 背景紹介 胸腺のネガティブセレクションを通じてT細胞受容体(TCR)ライブラリーを構築することは、自己寛容および臓器移植後の獲得性寛容を達成するための重要なプロセスです。しかし、末梢クローン削除の具体的なメカニズムが移植寛容を誘導できるかどうかはまだ明らかではありません。本研究の目的は、プログラムされた細胞死タンパク質1(PD-1)を発現する細胞を標的とすることで免疫寛容を誘導する可能性とメカニズムを探求することです。PD-1はT細胞活性化および疲弊プロセス中に顕著な表面受容体であり、慢性感染および腫瘍免疫逃避に重要な役割を果たします。 臓器移植後、PD-1は反応性T細胞の表面マーカーとして考えられ、同種抗原との遭遇後のクロー...