全基因组杂合性缺失预测垂体神经内分泌肿瘤的侵袭性、难治性行为

基因组范围内杂合性缺失预测垂体神经内分泌肿瘤的侵袭性和治疗抵抗性行为 背景: 垂体神经内分泌肿瘤 (PitNETs) 大多为良性,但其中一小部分肿瘤表现出侵袭性、治疗抵抗性行为,通常在手术、常规药物治疗以及初步放射治疗后仍持续生长或出现转移。依据2022年欧洲内分泌学会(European Society of Endocrinology,ESE)的临床实践指南,侵袭性PitNETs被定义为即使在标准治疗(手术、常规药物治疗和放射治疗)后仍不断发展的肿瘤。根据WHO于2017年取消了基于TP53免疫组化(IHC)过表达等指标来评估肿瘤侵袭性的分类标准,本次研究的目标是寻找能够更准确预测垂体神经内分泌肿瘤未来治疗抵抗性的生物标志物。 研究团队与发表信息: 本项研究由Andrew L. Lin、V...

基因表达和蛋白质溶解性的变化与阿尔茨海默病病理进展的相关性

阿尔茨海默症进展中的基因表达与蛋白质不溶性的变化 背景介绍 阿尔茨海默症(Alzheimer’s Disease,AD)作为最常见的痴呆类型,以其主要的两大神经病理性特征——淀粉样斑块和神经纤维缠结(NFTs)而闻名。淀粉样斑块由β-淀粉样蛋白(Aβ)肽段组成,这些肽段由淀粉样前体蛋白(APP)的连续切割产生;而神经纤维缠结主要由过磷酸化的配对螺旋丝(PHF)- tau蛋白形成。不仅在阿尔茨海默症中,在其他如额颞叶痴呆(FTD-tau)、皮质变性肌萎缩(CBD)、渐进性核上麻痹(PSP)等“tau病变”中也可见到NFTs。 近来的网络化研究发现,一种叫做SHIP2(含SH2结构域的肌醇5-磷酸酶2,编码基因为INPPL1)转录水平的上调与认知衰退及人类AD和老年大脑中的病理变化显著相关。SH...

携带C9orf72重复扩展突变患者小脑中丰富的转录组变化

研究背景 在神经科学领域,amyotrophic lateral sclerosis (ALS) 和 frontotemporal lobar degeneration (FTLD) 是两种具有高度异质性的神经退行性疾病。研究表明,在这些疾病中,c9orf72基因中的非编码六核苷酸重复扩展是最常见的遗传原因。然而,这种重复扩展在转录组层面的具体后果仍不完全清楚。尽管已有研究揭示c9orf72重复扩展可能通过减少基因表达、形成RNA焦点和聚合二肽重复蛋白(DPR)等机制引发疾病,但这些机制何以导致广泛的临床和病理学变异,目前尚无定论。 近来,研究人员逐渐注意到小脑在ALS和FTLD研究中的重要性。尽管小脑传统上被认为在这些疾病中较为不受影响,最新的研究表明,TDP-43蛋白在这一脑区的水平有所...

NEB致病变异对患者的影响揭示了新型蠕虫肌病疾病机制

科研报道:解析NEB致病变异揭示新型线状肌病机制及Omecamtiv Mecarbil对受力影响 背景与研究动机 线状肌病(Nemaline Myopathy, NEM)是一种罕见的异质性遗传病,主要表现为肌张力减退和肌肉无力。病理上,该病由肌小节Z盘的失序和线状小体的积聚所致,线状小体是Z盘和细丝蛋白的聚集物。据估计,该病的发病率为每10万活产婴儿中约有两例,占先天性肌病的17%。目前,尚无针对该病的有效治疗方法。 线状肌病涉及至少13种基因的致病变异,其中NEB基因的变异是引发该病的一个主要原因,占病理变异的35%。NEB基因编码一种叫做nebulin的巨型细丝蛋白,它在骨骼肌的各种重要生理过程中发挥关键作用,如调节细丝长度(tthin filament length, TFL)、肌节对...

PTEN状态对转移性去势抵抗性前列腺癌患者的整体存活和治疗模式的影响

基于PTEN状态的转移性去势抵抗性前列腺癌患者的总生存期和治疗模式 学术背景 前列腺癌是全球男性中最常见的恶性肿瘤之一,也是癌症相关死亡的主要原因。大约10%-20%的前列腺癌患者会发展成去势抵抗性前列腺癌(CRPC),大多数CRPC患者会进一步发展成转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC),这通常是致命的。尽管当前的治疗方法可以改善生存期,但由于疾病生物学和负担的不同,mCRPC患者的治疗结果存在显著差异。研究表明,通过全基因组测序(WES)可以更清晰地了解mCRPC,包括检测到雄激素受体突变、基因融合和PTEN基因丢失等异常。 PTEN是一个脂质磷酸酶,通过调节PI3K/AKT/mTOR信号通路来控制细胞生存、增殖和代谢等过程。PTEN丢失会导致PI3K通路异常激活,引发多种癌症,包括前列...

结合基因组分析和聚(ADP-核糖)聚合酶-1表达的肺高恶性神经内分泌癌预后模型

结合基因组分析和聚(ADP-核糖)聚合酶-1表达的肺高恶性神经内分泌癌预后模型

肺高分化神经内分泌癌的预后模型:结合基因组分析和多聚(ADP-核糖)聚合酶-1的表达 研究背景 肺高等级神经内分泌癌(High-grade neuroendocrine carcinoma, HGNEC)是一种侵略性很强的癌症,其生物复杂性显著。尽管与Notch途径激活和TP53、RB1基因的失活相关,现有缺乏明确的分子靶标和合适的预后模型,这成为治疗该致命肿瘤的主要障碍。目前小细胞肺癌(SCLC)的治疗因分期而异,但即便同一期别的病人其治疗效果也有所不同,而对于大细胞神经内分泌癌(LCNEC)的预后模型依然稀缺,这主要因为该类型癌症的罕见和异质性。 研究动机 本研究旨在探索HGNEC中基因突变和多聚(ADP-核糖)聚合酶-1(PARP1)表达的预后价值,建立一个新型的预后模型,进一步揭示可...

卵巢癌中同源重组缺陷相关基因组不稳定性的不同检测方法具有高度一致性

卵巢癌中同源重组缺陷相关基因组不稳定性的不同检测方法具有高度一致性

卵巢癌是女性常见且致命的肿瘤类型之一。近年来,多聚(ADP-核糖)聚合酶抑制剂(PARPi)在卵巢癌治疗中显示了令人鼓舞的临床结果。许多研究发现,同源重组缺陷(HRD)患者从PARPi治疗中受益更大。因此,识别HRD状态的生物标志物检测策略变得至关重要。目前,在临床研究中最常用的HRD检测方法是Myriad myChoice,但还有其他检测方法可以评估HRD、基因组不稳定性(GI)和BRCA1/2突变状态。本研究旨在评估多种替代检测方法在高分级浆液性卵巢癌(HGSC)中的表现,并与Myriad myChoice进行比较。 研究背景 如上所述,PARPi的成功使得HRD检测变得尤为重要。然而,Myriad myChoice作为唯一获得FDA认证的HRD检测方法,其应用受到限制,尤其是在欧洲。因...

拉丁美洲晚期前列腺癌患者同源重组修复基因突变率的前瞻性研究

题为 “Prospective Study of Homologous Recombination Repair Gene Mutation Prevalence in Patients with Advanced Prostate Cancer from Latin America: Challenges and Future Approaches” 的学术报告 背景介绍 前列腺癌是拉丁美洲和加勒比地区(Latin America and Caribbean,LAC)男性中最常见的癌症之一。根据2020年全球癌症观察(Globocan 2020)报告,该地区共报告了214,522例前列腺癌新病例,占所有癌症的15.2%,并在男性癌症病例中占比高达29.8%。尽管LAC地区的前列腺癌发病率略...

台湾单中心 BFAST 数据库的非小细胞肺癌患者血液循环肿瘤 DNA 检测综合基因组分析

肺癌基因组学的最新研究:非小细胞肺癌的血液循环肿瘤DNA检测分析 背景和研究动机 近年来,非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗因靶向治疗的成功而发生了显著变化。国家综合癌症网络指南建议对肺癌进行广泛的分子检测,以识别可能从靶向治疗中受益的患者。然而,NSCLC患者获取足够的组织活检样本变得越来越困难。由于生物标志物数量的增加,导致样本不足以进行全面的分子分析。此外,肿瘤位置和患者临床状况也使得组织收集非常具有挑战性。因此,通过血液中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行的下一代测序(NGS)有望克服这些组织检测的局限性。 研究来源 这项研究由Hsin-Yi Wang、Chao-Chi Ho、Yen-Ting Lin等多位医学博士和博士后研究员联合进行。他们分别来自National Taiwan Un...

全癌种调研揭示MYH变异的双等位基因失活和缺陷的碱基切除修复

跨癌种研究揭示 MUTYH 基因双等位基因失活及不同类型实体瘤的碱基切除修复缺陷 研究背景 在日常生活中,细胞常常暴露于内源性和外源性的氧化应激,这些应激来自于细胞呼吸的副产物以及接触各种外源性化合物。MUTYH 是碱基切除修复(Base Excision Repair, BER)通路中的关键组成部分,负责修复内源性和外源性来源的氧化DNA损伤。氧化损伤最常见的产物之一是8-氧-7,8-羟基鸟嘌呤(8-oxoG)。MUTYH 通过切除错误配对的腺嘌呤,防止这些氧化损伤引起的G:C到T:A转变突变,从而在多种高暴露于氧化损伤和频繁细胞分裂的组织中发挥重要作用。 BER 通路的缺陷与突变负担增加和致癌性相关联。MUTYH 基因的双等位基因致病变异(biallelic germline patho...