糖皮质激素通过调节ZBTB16表达改变人类皮质神经发生 背景介绍 在妊娠期间，糖皮质激素（glucocorticoids, GCs）是中枢神经系统（central nervous system, CNS）发育过程中至关重要的类固醇激素。GCs能调节胎儿器官的发育，尤其是肺和大脑。然而，当GCs水平超出生理范围或时间窗口，如因合成糖皮质激素(synthetic GCs, sGCs)的治疗使用或母体内分泌及压力相关疾病导致，将会对胎儿发育产生影响。此外，母体压力和抑郁症会减少胎盘对皮质醇的代谢，合成糖皮质激素如倍他米松和地塞米松亦能容易穿过胎盘，增加胎儿的暴露水平。因此，针对高风险早产的妊娠，常从怀孕第22到33周间使用sGCs来促进胎儿肺的成熟，从而提高存活率。 临床和社会对于孕期GCs使用的...

将STING功能运用到BH3模拟药物来治疗TP53突变的血液肿瘤 在最新发表在《Cancer Cell》上的文章《Putting the sting back into BH3-mimetic drugs for TP53-mutant blood cancers》中，Sarah T. Diepstraten等人进行了深入研究，探讨了如何增强BH3模仿药物在TP53突变血液癌症中的疗效。这项研究由Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research (WEHI)的团队进行，与墨尔本大学、彼得麦卡勒姆癌症中心和皇家墨尔本医院等多家机构合作，发表于2024年5月13日。 背景 TP53突变的血液癌症，如急性骨髓性白血病(AML)和非霍奇金淋巴瘤(...

ARID1A Loss与B细胞命运及淋巴瘤发生 背景介绍 本文研究了ARID1A（AT-Rich Interactive Domain 1A）在B细胞命运决定与淋巴瘤发生中的关键作用。ARID1A是血糖重建复合体（BAF, BRG1/Brahma-associated factors）中的重要亚基，其突变常见于多种人类恶性肿瘤中。以往研究表明，BAF复合体通过调节染色质可达性，影响基因表达和细胞命运。然而，ARID1A突变在功能丧失后的具体机制仍不清楚，特别是在B细胞中的表现。本研究旨在揭示ARID1A突变如何影响B细胞的发育并推动淋巴瘤的发生，以及探索ARID1A缺失是否可以作为潜在的治疗靶点。 论文来源 本文由Darko Barisic、Christopher R. Chin、Cem M...

亚细胞分辨率的空间多组学高通量原位成对测序 研究背景和目的 随着生物医学研究的不断发展，多组学技术在细胞功能和疾病机制方面的应用越来越受到关注。然而，目前，许多原位测序方法仅限于解读一种生物分子类型的空间信息，同时多种生物分子（如DNA、RNA、蛋白质和小分子）原位共检测仍然面临挑战。此外，由于4n（4代表四种荧光染料，n代表测序或杂交轮数）解码能力的限制，高通量空间组学在成本和检测效率方面仍需改进。为了解决这些问题，本文报道了一种新型的高通量靶向原位测序方法——多组学原位配对测序（MIP-Seq），该方法能够高效检测大脑组织中多种生物分子，在分子和功能图谱的多维分析上提供了新的可能性。 论文来源 该研究由来自华中农业大学的Xiaofeng Wu, Weize Xu, Lulu Deng等人...

空间富集和基因组分析揭示NOMO1与肌萎缩侧索硬化症的关联 引言 运动神经元病（ALS）是一种严重的神经退行性疾病，患者的脑部和脊髓中运动神经元逐渐丧失。尽管在绝大多数间歇性ALS患者中，其遗传易患性仍然不确定，但TDP-43蛋白病理学是多数ALS患者（> 97%）的主要特征。此外，已有超过25个基因被报道与ALS有关，但大约90%的间歇性ALS患者无法用已知突变解释。现有研究表明，脑组织结构的复杂性是细胞间相互作用、生物功能和病理学的基础，了解细胞类型和区域脆弱性对于精确医学至关重要。 研究背景与目标 本研究旨在评估ALS相关基因在脑区域的脆弱性，并揭示区域特异性基因与ALS风险之间的遗传联系。为此，研究团队开发了一种基于熵加权差异基因表达矩阵的工具Spatiale，用于识别空间转录组学（...

近年来，阿尔茨海默病（AD）已成为影响全球老年人群的重要健康问题，其相关的神经病理改变可以在临床症状出现几十年前就开始发生。为了更全面地探讨AD风险与脑结构形态之间的关系，研究团队开展了一项双向性两样本孟德尔随机化（二游Sample Mendelian Randomisation, MR）研究，旨在探究遗传易感性是否通过影响脑结构而增加AD的风险。 研究背景 AD的病理变化通常首先出现在内侧颞叶，而后扩散到额叶、顶叶和颞叶新皮质以及皮层下区域。在疾病临床诊断前的20年，脑内β淀粉样蛋白的积累可能已经显现。因此，整合疾病临床症状出现前的生物学数据对于理解AD的病因、时序及进程，并开发早期检测和筛查策略至关重要。 研究目的 本研究旨在评估遗传易感性对全脑和局部脑皮质厚度、估计的总颅内体积、皮层下...

整合分子和空间分析揭示原位和侵袭性肢端黑色素瘤的进化动力学及肿瘤-免疫相互作用 论文的学术背景 黑色素瘤是皮肤癌的一种，而肢端黑色素瘤（Acral Melanoma, AM）是一种在手掌、足底以及指甲下发生的非暴露部位黑色素瘤，尤为常见于亚洲人群。然而，这类黑色素瘤常常在晚期才被诊断，这使得其预后极差。尽早发现和预防AM可以显著提高患者的预后。尽管近年来对于晚期侵袭性肢端黑色素瘤（Invasive Acral Melanoma, IAM）的基因组特征进行了大量研究，但对于早期原位肢端黑色素瘤（Acral Melanoma In Situ, AMIS）的了解仍然非常有限。因此，探讨AM从原位阶段到侵袭性阶段的进化动力学，以及其与肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME...

背景介绍 骨髓增生异常综合征（Myelodysplastic Syndromes，简称MDS）是一组起源于骨髓造血干细胞的异质性疾病，特征是血细胞产生减少。虽然近年来在治疗方面取得了一定进展，但全相合异基因造血干细胞移植（Allogeneic Hematopoietic Stem-Cell Transplantation, HSCT）仍是唯一能潜在治愈MDS的方法。然而，由于移植操作本身常伴随非可忽视的发病率和死亡率，针对病人的准确选择显得至关重要。传统上，临床上基于修订版国际预后评分系统（Revised International Prognostic Scoring System, IPSS-R）来做决策，该系统包含临床特征和细胞遗传异常。高风险患者通常建议立即进行HSCT，而对于低风险...

新诊断的IDH野生型胶质母细胞瘤中不同分子亚型中切除程度阈值的研究 引言 胶质母细胞瘤(glioblastoma, GBM)是成人中最常见的恶性脑肿瘤。虽然手术切除、放射治疗和化疗是目前的标准治疗方案,但GBM的预后仍然很差,中位生存期仅15个月左右。越来越多的研究表明,肿瘤切除程度是影响GBM患者预后的关键因素之一。然而,以往的研究多关注IDH基因状态和MGMT甲基化状态,而忽视了其他分子生物学亚型与切除程度之间的关系。 研究设计 本研究纳入了138例新诊断的IDH-野生型GBM患者。使用半自动软件对术前和术后的影像数据进行分析,测量肿瘤体积和切除程度。同时,对肿瘤标本进行了靶向次代测序,分析了205个与肿瘤相关的基因的突变状态。 研究人员使用递归分区分析(recursive partit...

5’非翻译区(5’UTR)是信使RNA(mRNA)分子起始端的一个调控区域,在调节翻译过程及影响蛋白质表达水平方面发挥着关键作用。语言模型已展现出解码蛋白质和基因组序列功能的有效性。在这项研究中,作者们介绍了一种针对5’UTR的语言模型,简称为UTR-LM。 研究背景 事实上,5’UTR在调控mRNA的翻译过程中扮演着重要角色,可以影响mRNA的稳定性、定位和翻译效率。之前已有大量研究探索了5’UTR的生物学特征,包括它的二级结构、可能与之互作的RNA结合蛋白,以及5’UTR突变对基因表达的影响等。mRNA的复杂功能及其对人类健康的潜在影响,凸显了需要开发更具普遍适用性的计算方法。 研究来源 本研究由普林斯顿大学电子与计算机工程系的Mengdi Wang教授课题组、斯坦福大学病理系的Le C...