原代造血幹細胞におけるCRISPR依存性スクリーニングがIDH2およびTET2変異細胞の遺伝子型特異的脆弱性としてKDM3Bを特定

CRISPR依存スクリーニングによって原代造血幹細胞でIDH2およびTET2変異型の特異的感受性としてKDM3Bが同定された 背景と研究意義 クローン性造血(Clonal Hematopoiesis, CH)は、特定の変異を持つ造血幹細胞(Hematopoietic Stem Cell, HSC)によって引き起こされる遺伝子的に異なるサブ群細胞の異常な増殖を指す。この現象は60歳以上の人々の間で非常に一般的であり、20%以上の人口に影響を与える。CHは急性骨髄性白血病(AML)への悪性転化リスクの増加に関連し、さらに全原因の死亡率や心血管疾患などの年齢関連疾患とも関連している。以前の遺伝学研究はCHに関連する遺伝子変異を同定したが、CHにおける治療ターゲットを特定することは依然として困難であ...

ミトコンドリアカルシウムの撹乱を通じた急性骨髄性白血病幹細胞の標的化

ミトコンドリアカルシウムの撹乱を通じた急性骨髄性白血病幹細胞の標的化

これは急性骨髄性白血病(AML)幹細胞研究に関する学術論文報告です。本研究は、BCL-2タンパク質に対するベネトクラクス治療が薬剤感受性および耐性のAML幹細胞において異なるミトコンドリアカルシウムシグナル変化を引き起こし、それによって酸化的リン酸化代謝と生存に影響を与えることを発見しました。 本研究の目的は、AML幹細胞に対するベネトクラクス治療の作用メカニズムを探ることです。以前の研究で、ベネトクラクスが酸化的リン酸化代謝に感受性のあるAML幹細胞を標的にできることが示されましたが、耐性細胞の代謝には影響を与えませんでした。BCL-2タンパク質は細胞内カルシウムイオン動態を制御することが知られているため、著者らはカルシウムシグナルがベネトクラクス治療の反応性に関与している可能性があると推...

KRAS変異非小細胞肺がんにおけるアクティブRAS阻害に対する応答と耐性のメカニズム

KRAS変異NSCLCにおけるRAS阻害剤の応答および耐性機構 研究背景 RAS阻害剤の臨床開発が進むとともに、KRAS変異型肺がん(非小細胞肺がん、NSCLC)の治療に新たな希望が見えてきます。しかし、臨床実践において、患者はRAS阻害剤に対する長期的な反応が乏しく、薬物の耐性と獲得性耐性の出現が臨床効果に影響を与えています。RASタンパク質の活性状態を標的とする薬物はより大きな可能性を有していますが、その耐性機構は依然として不明です。本研究の目的は、KRAS変異型NSCLCにおけるRAS活性状態の抑制によって引き起こされる腫瘍反応機構を解明し、薬物耐性の可能な経路を探求することです。 論文情報 研究チームメンバー: Haniel A. Araujo, Ximo Pechuan-Jorge...

合成細胞回路を使用したMHCクラスIおよびクラスII制限T細胞エピトープのハイスループット発見

高スループットでMHC I類およびII類制限T細胞エピトープを発見する新しい合成細胞回路 研究背景及び問題 近年、抗原発見技術は顕著な進展を遂げ、とりわけヒトT細胞受容体(TCRs)が主要組織適合性複合体(Major Histocompatibility Complex, MHC)I類制限性認識において応用されています。しかし、MHC II類制限とマウスTCR活性に関する研究や技術は相対的に遅れています。この限界により、癌、感染症、自己免疫疾患などの多様な免疫関連疾患の治療と研究が妨げられています。本記事では、この研究の空白を埋めるために新しいTCR抗原発見手法、すなわち抗原ペプチドのTCRマッピング(TCR mapping of Antigenic Peptides, TCR-MAP)を報...

英国バイオバンクの表現型データの原理的蒸留は、人間の変異の基礎構造を明らかにする

この報告では、Nature Human Behaviour誌に掲載された科学論文「英国のバイオバンク表型データからの原則的抽出が人間の変異の潜在的な構造を明らかにする」というタイトルの研究を詳細に評価しました。この研究はCaitlin E. Carey、Rebecca Shafee、Robbee Wedowらによって担当され、オンライン投稿日はXX年XX月XX日で、出所はhttps://doi.org/10.1038/s41562-024-01909-5です。 研究背景と意義 公共部門と民間部門が大規模なデータ収集と統合への投資を行っている中、バイオバンクと呼ばれるデータレポジトリが登場し、健康成果と数千人の個人サンプルを関連付けています。バイオバンクは、EHR(電子健康記録)、自己申告調査...

ディープロングリードRNA-Seqを用いた高齢者前頭葉皮質における医学的に関連するRNAアイソフォームの多様性のマッピング

学術的背景 RNA選択的スプライシング(RNAアイソフォーム)は、遺伝子発現の調節において重要な役割を果たしています。ヒトのタンパク質コーディング遺伝子は平均して8つ以上のRNA選択的スプライシングを含み、これにより約4つのユニークなタンパク質コーディング配列が生じます。従来の短読長シーケンシング技術は読取り長の制限により、RNA選択的スプライシングを正確に組み立てて定量することができず、基礎生物学の理解が大幅に簡略化されていました。ますます多くの研究が、同じ遺伝体の異なる選択的スプライシングがタンパク質レベルでユニークな相互作用ネットワークを持っていることを示しています。特に、同じ遺伝体の一部の選択的スプライシングが細胞内で全く異なる、あるいは逆の機能を果たすことが示されています。例えばb...

トラッキングシークは、CRISPR-Cas9介在型ゲノム編集におけるオフターゲット効果の不均一性を明らかにする

トランスクリプトーム技術によるシーケンス追跡(Tracking-Seq)によるCRISPR-Cas9媒介遺伝子編集のオフターゲット効果の多様性の解明 研究背景 遺伝子編集技術の急速な発展に伴い、CRISPR-Cas9システムはその高効率と操作の簡便さから生物医学研究分野で広く利用されています。しかし、CRISPR-Cas9システムがDNAを編集する際には、想定外の遺伝子座を切断するオフターゲット効果が発生する可能性があり、これを全面的に識別し評価することが重要な課題となっています。これまでの研究では、細胞遊離法などを用いてオフターゲット効果を検出してきましたが、これらの方法には特定の編集ツールや細胞タイプへの依存性、多量の細胞が必要、偽陽性率が高い、および体外での遺伝子編集に限られるなどの制...

IL-1β-Stat5軸の自己免疫性神経炎症における役割と潜在的な治療戦略

研究助力免疫神経炎症治療の重大突破 背景紹介 ステロイド抵抗性は多くの炎症性疾患の治療における重大な課題であり、特に自己免疫神経炎症(autoimmune neuroinflammation)において大きな問題となっています。これらの疾患において、TH17 細胞(T helper 17 cells)がステロイド抵抗性を引き起こす主要因と広く認識されていますが、その背後にあるメカニズムは完全には理解されていません。現在の研究は実験的自己免疫性脳脊髄炎(Experimental Autoimmune Encephalomyelitis, EAE)動物モデルに焦点を当てており、このモデルは中枢神経系(CNS)炎症の免疫病理メカニズムの研究に広く用いられています。本論文の核心的問題は、IL-1βおよ...

PD-1 発現細胞の標的除去は、末梢クローン削除を通じて免疫寛容を誘導する

末梢クローン削除によるPD-1発現細胞を標的とした免疫寛容の誘導 背景紹介 胸腺のネガティブセレクションを通じてT細胞受容体(TCR)ライブラリーを構築することは、自己寛容および臓器移植後の獲得性寛容を達成するための重要なプロセスです。しかし、末梢クローン削除の具体的なメカニズムが移植寛容を誘導できるかどうかはまだ明らかではありません。本研究の目的は、プログラムされた細胞死タンパク質1(PD-1)を発現する細胞を標的とすることで免疫寛容を誘導する可能性とメカニズムを探求することです。PD-1はT細胞活性化および疲弊プロセス中に顕著な表面受容体であり、慢性感染および腫瘍免疫逃避に重要な役割を果たします。 臓器移植後、PD-1は反応性T細胞の表面マーカーとして考えられ、同種抗原との遭遇後のクロー...

Gタンパク質共役受容体のエンドサイトーシスは、β-arrestin信号伝達における時空間的バイアスを生成します

学術ニュース報道: Gタンパク質共役受容体のエンドサイトーシス作用がβ-アレスチンシグナル伝達における時空間バイアス性 研究背景 細胞表面受容体ファミリーの中で、Gタンパク質共役受容体(GPCRs)は最大のファミリーの一つです。これらはリガンドの活性化を受けると、様々なシグナルタンパク質と相互作用し、細胞内シグナル伝達を引き起こします。この活性化は平衡的であるだけでなく、選択的である場合もあり、これをバイアスシグナル伝達(biased signaling)または機能選択性(functional selectivity)と呼びます。この現象は、副作用を回避しながら治療効果を達成できるバイアス薬の開発が可能になるため、注目されています。例えば、アンジオテンシンII受容体1型(AT1R)は最も研究...