高スループットな原位対逐次シーケンスによる細胞内解像度での空間マルチオミクス

高スループットな原位対逐次シーケンスによる細胞内解像度での空間マルチオミクス

サブセル解像度の空間多オミクスハイスループットインシチュペアシーケンシング 研究背景と目的 生物医学研究の進展に伴い、多オミクス技術は細胞機能や疾患メカニズムの理解においてますます注目されています。しかし、現在の多くのインシチュシーケンシング法は一種類の生体分子の空間情報の解読に限られ、多種の生体分子(例えば、DNA、RNA、タンパク質、小分子)の同時検出には課題が残っています。さらに、4n(4は4種類の蛍光染料、nはシーケンシングまたはハイブリダイゼーションの回数)デコード能力の制約により、ハイスループット空間オミクスはコストと検出効率の面でまだ改良の余地があります。この問題を解決するために、本論文では新しいハイスループットターゲットインシチュシーケンシング法である多オミクスインシチュペア...

ストローククラシファイア:電子健康記録を使用したアンサンブルコンセンサスモデリングによる虚血性脳卒中病因の分類

StrokeClassifier:人工知能ツールは電子健康記録に基づいて虚血性脳卒中を病因別に分類 プロジェクト背景および研究動機 脳卒中(特に急性虚血性脳卒中、AIS)の病因識別は二次予防において極めて重要ですが、その診断は非常に困難です。アメリカでは毎年約67.6万件の新たな虚血性脳卒中のケースが報告され、そのうち4分の1の患者は過去に脳卒中の経験があります。この病状は再発率が高く、時には死亡やさらなる障害を引き起こすこともあります。虚血性脳卒中の病因は、大動脈粥状硬化、心源性塞栓症、小血管病、その他の稀な原因など多岐にわたります。しかし、アメリカでは約20-30%の虚血性脳卒中患者が評価を受けてもなお病因が確定せず、隠源性脳卒中として分類されます。この部分の患者は再発脳卒中のリスクが特...

加速度計データの自己監督学習が睡眠と死亡率の関係に新しい洞察を与える

加速度計データの自己監督学習が睡眠と死亡率の関係に新しい洞察を与える

自己監督学習による手首加速度計データが明かす睡眠と死亡率の新たな関連性 現代社会において、睡眠は生命活動に欠かせない基本的な行為であり、その重要性は言うまでもありません。睡眠/覚醒状態や異なる睡眠段階を正確に測定および分類することは、睡眠障害の診断や消費者向けデバイスが提供する運動および心理的健康データの解釈において非常に重要です。しかし、現在のポリソムノグラフィー(Polysomnography, PSG)以外の睡眠分類技術は主にヒューリスティックな方法に依存しており、これらの方法は比較的小規模なサンプル集団で開発されるため、ある程度の限界があります。従って、本研究の目標は手首に装着する加速度計を用いて睡眠段階分類の正確性を確認し、睡眠時間と効率が死亡率とどのように関連しているかを調査する...

人口レベルでの心血管診断のための心電図に基づく機械学習アルゴリズムの開発と検証

心電図に基づく大規模な心血管診断機械学習アルゴリズムの開発と検証 序論 心血管疾患(Cardiovascular diseases, CV)は、世界中で病気の負担の主な原因であり、早期診断と介入が病気の合併症、医療利用率、および費用の削減において重要です。伝統的な心電図(Electrocardiogram, ECG)は、低コストで便利な診断ツールとして、心血管疾患の検出に広く使用されています。しかし、現在のECG解釈技術(人工およびコンピュータアルゴリズムを含む)は、高次の信号相互作用および「隠れた」臨床関連パターンの識別に制限があります。人工知能(Artificial Intelligence, AI)、特に深層学習(Deep Learning, DL)の出現は、ECG信号における「隠れた...

深層学習敗血症予測モデルがケアの質と生存率に与える影響

深層学習敗血症予測モデルが看護の質と患者の生存状況に与える影響 研究背景 敗血症は感染によって引き起こされる全身性炎症反応で、毎年約4800万人が影響を受け、そのうち約1100万人が死亡しています。敗血症の多様性により、早期の識別は非常に困難です。早期介入には液体復旧、抗生物質管理、感染源の制御などの治療が含まれ、疾患初期段階での効果は顕著です。したがって、予測分析を通じて敗血症の早期検出を向上させることは重要です。 研究の出典 この研究は、Aaron Boussina、Supreeth P. Shashikumar、Atul Malhotra、Robert L. Owens、Robert El-Kareh、Christopher A. Longhurst、Kimberly Quintero...

電子健康記録における健康の社会的決定要因を識別するための大規模言語モデル

大規模言語モデルによる電子健康記録中の健康の社会的決定要因の識別 背景と研究の動機 健康の社会的決定要因(Social Determinants of Health, SDOH)は患者の健康結果に重要な影響を与えます。しかし、電子健康記録(EHR)の構造化データにおいて、これらの要因の記録はしばしば不完全または欠落しています。大規模言語モデル(Large Language Models, LLMs)はEHRの叙述的なテキストからSDOHを高通量で抽出し、研究や臨床ケアを支援することが期待されています。しかし、カテゴリの不均衡やデータの制約が、このまばらな記録の重要な情報に挑戦をもたらします。本稿では、LLMsを用いてEHRの叙述的テキストから6種類のSDOHカテゴリ(雇用、住居、交通、親の身...

アルツハイマー病における臨床病理学的多様性とグリア活性化パターン

アルツハイマー病の臨床病理異質性とグリア細胞活性化パターン 学術背景 アルツハイマー病(Alzheimer Disease, AD)は高齢者の認知症の主な原因として、その病理的異質性が研究のホットスポットとされています。既存の研究では、アルツハイマー病の臨床症状が多様であり、健忘型と非健忘型の臨床症状が含まれ、これらは神経線維巻き付けの分布とグリア細胞の活性化に密接に関連していることが示されています。しかし、これらの異質性および病理メカニズムはまだ完全に解明されておらず、アルツハイマー病の分子および細胞生物学的メカニズムをさらに解析することは、臨床診断および治療の推進にとって極めて重要です。 研究背景と目的 今回の研究はMayo Clinic FloridaのNeuroscience Dep...

パーキンソン病に対する段階的な両側MRIガイド下集束超音波視床下核切除術

MRI による段階的焦点超音波両側視床下核切除術でパーキンソン病を治療 背景紹介 パーキンソン病(Parkinson’s Disease, PD)は一般的な神経変性疾患で、震え、硬直、運動緩慢などの運動症状が主に現れる。伝統的な治療法として、薬物療法および外科手術があり、後者には深部脳刺激術(Deep Brain Stimulation, DBS)や放射周波外科手術も含まれ、これらも進化を続けている。しかし、片側のMRIガイド下での焦点超音波視床下核切開術(FUS-STN)は、非対称性のパーキンソン病患者の対側における運動特性を改善することが証明されているが、両側FUS-STNの実現可能性はまだ検討されていない。片側治療では全体的な症状の制御ができず、特に進行途中の未治療の側の身体に運動の悪...

便血ヘモグロビン濃度に基づく精密大腸癌スクリーニング

糞便中ヘモグロビン濃度に基づくスクリーニング間隔の調整による大腸癌の精密検査 研究者:Amy Ming-Fang Yen、陳揚卿、丁玉林、邱文柱、邱翰摩、Tony Hsiu-Hsi Chen、Sam Li-Sheng Chen 学術背景 大腸癌(CRC)は世界中で第三位の発生率を持つ悪性疾患です。近年、大腸癌のスクリーニングは予防と早期検出で著しい進展を遂げており、これは主に人口に基づくスクリーニングプログラムの実施と治療手段の進展によるものです。その中で、糞便免疫化学検査(FIT)は重要な糞便診断ツールとして、CRCの死亡率を低減する上で鍵を握っています。大腸癌のスクリーニングは有効性が証明されており、結腸鏡による前癌性腺腫の切除を通じた一次予防や、早期検出を通じたCRCに関連する死亡率の...

キメラ抗原受容体を使用した免疫抑制間葉系ストローマ細胞

キメラ抗原受容体搭載間葉系間質細胞による免疫抑制の強化 背景紹介 間葉系間質細胞(Mesenchymal Stromal Cells, MSCs)は、多能性細胞であり、ほぼ全ての組織に存在し、著しい免疫抑制・再生特性を有する。これらの特性は、免疫疾患および組織再生の治療において、MSCsが広く研究されてきた理由となっている。異種のMSCsの臨床試験はその安全性を示しているが、免疫抑制の効果と治療結果はいまだ満足いくものでない。MSCsの免疫抑制効果を向上させるために、本研究では細胞工学技術を用い、健康な提供者から得た脂肪由来の初期MSCsを改造し、新たな治療戦略を開発した。 論文の出典 本研究はOlivia Sirpilla、R. Leo SakemuraおよびMehrdad Hefaziら...