eIF4A1和eIF4A2在B细胞发育和功能中的关键和差异作用

eIF4A1 和 eIF4A2 在 B 细胞发育和功能中的关键及差异作用 学术背景 在哺乳动物细胞中,翻译起始(translation initiation)是蛋白质合成的关键步骤,而真核起始因子 4A(eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A)在这一过程中扮演着重要角色。eIF4A 是一种 ATP 依赖的 RNA 解旋酶,能够解开 mRNA 5’ 非翻译区(5’ untranslated region, 5’ UTR)的二级结构,帮助 43S 前起始复合物(preinitiation complex, PIC)扫描 5’ UTR 以找到起始密码子。eIF4A 有两个高度同源的亚型:eIF4A1 和 eIF4A2。尽管它们在体外可以自由交换并参与 eIF4...

个体间免疫细胞再生衰老差异的机制研究

随着生物体的衰老,免疫系统的功能逐渐下降,表现为先天免疫细胞(如粒细胞)的增加和适应性免疫细胞(如B细胞)的减少。这种免疫系统的失衡与多种疾病的发生密切相关,尤其是老年人中常见的骨髓性白血病和免疫缺陷。尽管所有生物体都会经历衰老,但个体之间的衰老速度存在显著差异。这种差异的机制尚不明确,尤其是与免疫细胞再生相关的干细胞(如造血干细胞,HSC)在衰老过程中的作用。理解这种个体间衰老差异的机制,有助于揭示衰老相关的生理衰退的触发因素,并为延缓衰老提供新的治疗策略。 造血干细胞(HSC)在维持组织稳态和再生受损细胞方面起着关键作用。随着年龄的增长,HSC的功能发生多种变化,包括自我更新能力的增强、髓系分化(myelopoiesis)的增加以及淋巴系分化(lymphopoiesis)的减少。这些功能...

通过计算遗传网络揭示KMT2D肿瘤抑制基因的功能关联和癌细胞脆弱性

学术背景与问题提出 肿瘤抑制基因(Tumour Suppressor Genes, TSGs)的功能丧失(Loss-of-Function, LOF)突变在癌症中非常常见,但由于这些突变导致蛋白质功能的丧失或减弱,传统的药物靶向策略难以直接针对这些突变。因此,研究人员需要开发新的方法来揭示这些突变带来的细胞脆弱性,并寻找潜在的治疗靶点。KMT2D 是一个在多种癌症中频繁发生突变的肿瘤抑制基因,其功能丧失突变与多种癌症的发生和发展密切相关。然而,KMT2D 的功能网络及其在癌症细胞中的脆弱性尚未得到全面研究。 本文的研究旨在通过计算模拟的方法,绘制 KMT2D 的遗传网络,揭示其功能关联和癌症细胞的脆弱性,特别是通过合成致死(Synthetic Lethality, SL)相互作用,寻找潜在的...

UBXN6在巨噬细胞中调控自噬诱导和炎症控制的作用

UBXN6在巨噬细胞自噬诱导和炎症控制中的关键作用 背景介绍 先天免疫系统是机体抵御病原体入侵和炎症反应的第一道防线。单核细胞和巨噬细胞作为先天免疫系统的主要细胞类型,在感染和炎症过程中发挥着关键作用。然而,当这些细胞的功能失调时,可能会引发有害的炎症反应。因此,理解单核细胞和巨噬细胞如何调控炎症和先天免疫反应的机制,对于开发新的治疗策略以应对感染和炎症性疾病(如败血症)至关重要。尽管这一领域的研究已经取得了一些进展,但炎症与先天免疫之间的平衡机制仍未完全阐明。 蛋白质稳态(proteostasis)是维持细胞内蛋白质平衡的重要生物学过程,涉及自噬(autophagy)、内质网相关蛋白降解(ERAD)和蛋白酶体降解等多种途径。自噬是一种通过溶酶体降解大分子蛋白聚集体和受损细胞器的过程,在调控...

替代mRNA多聚腺苷酸化通过自噬途径调控巨噬细胞过度激活

NUDT21通过自噬通路调控巨噬细胞过度激活 学术背景 炎症反应是机体免疫防御的重要组成部分,能够帮助清除病原体并促进组织修复。然而,炎症反应的失调可能导致慢性炎症性疾病,如炎症性肠病(IBD)、类风湿性关节炎(RA)、银屑病和系统性红斑狼疮(SLE)等。这些疾病通常伴随着免疫系统的异常激活和持续的炎症反应,严重时可能发展为危及生命的疾病,如噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(HLH)。巨噬细胞的过度激活是这些炎症性疾病的关键特征,其异常功能会导致组织损伤、持续的炎症反应以及疾病严重程度的加剧。因此,研究巨噬细胞激活的复杂调控机制对于及时调整炎症反应、防止过度炎症具有重要意义。 在分子水平上,精确的转录调控和RNA代谢的改变与巨噬细胞的激活状态和细胞因子的产生密切相关。RNA代谢包括RNA的合成、...

整合单细胞分析揭示表观遗传调控的癌细胞状态和他莫昔芬耐药乳腺癌中的异质性指导核心特征

综合单细胞分析揭示他莫昔芬耐药乳腺癌中的表观遗传调控癌细胞状态及异质性指导的核心特征 学术背景 乳腺癌是女性中最常见的癌症之一,内分泌治疗(如他莫昔芬)是雌激素受体α(ER)阳性乳腺癌患者的标准治疗方法。尽管内分泌治疗显著降低了复发风险,但约三分之一的患者最终会发展为内分泌耐药并复发。肿瘤间和肿瘤内的异质性被认为是导致内分泌耐药的重要因素。近年来,单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)技术的进步使得我们能够在单细胞分辨率下探索肿瘤异质性。然而,这种综合单细胞分析尚未被用于表征乳腺癌内分泌耐药中的转录组和染色质可及性。 论文来源 该研究由Kun Fang、Aigbe G. Ohihoin、Tianxiang Liu、Lavanya Choppavar...

百年植物标本揭示葡萄皮尔斯病的起源

百年草标本揭示葡萄藤皮尔斯病的传播历史:研究综述 葡萄藤皮尔斯病(Pierce’s Disease, PD)是一种严重威胁葡萄种植业的植物疾病,其由名为Xylella fastidiosa(木质部快速死亡细菌)中的快速死亡亚种(Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa,简称Xff)引起。然而,这一病原体的地理起源、传入美洲的时间,以及传播路径均存在诸多科学争议。为解决上述问题,由Monica A. Donegan等科学家主导,分别来自加州大学伯克利分校(University of California, Berkeley)、法国国家自然历史博物馆(Museum National d’Histoire Naturelle, CNRS, Paris)及其他研究机构...

幼年斑马鱼通过去甲肾上腺素和前脑回路快速学习识别威胁

在自然界中,动物需要快速识别并避开捕食者,这对于幼年动物尤为重要,因为它们更容易受到捕食者的威胁。然而,对于刚出生的脊椎动物是否具备这种快速学习能力,以及其背后的神经机制,科学界知之甚少。斑马鱼(zebrafish)是一种常用的模式生物,其幼鱼在受精后仅几天就开始游泳,且其大脑神经元数量仅为成年斑马鱼的1%。因此,研究斑马鱼幼鱼是否能够在如此早期阶段通过快速学习识别捕食者,具有重要的科学意义。 本研究旨在探讨斑马鱼幼鱼是否能够在极短的时间内通过神经调节系统(如去甲肾上腺素系统)和前脑回路学习识别威胁性物体,并揭示其背后的神经机制。通过这一研究,作者希望揭示幼年脊椎动物如何在极短的时间内通过神经回路实现快速学习,并为理解大脑如何应对生存威胁提供新的见解。 论文来源 该论文由Dhruv Zocc...

PITX2表达和尼安德特人基因渗入HS3ST3A1对现代人类牙齿尺寸变异的影响

牙齿形态在人类进化过程中表现出显著的多样性,然而,关于这种多样性的遗传基础知之甚少。牙齿作为进化研究中的重要特征,因其保存完好且形态多样,被广泛用于分类学和系统发育分析。现代人类群体中,牙齿形态的变异也被用于人口历史分析和个体识别。尽管动物研究已经确定了数十个与牙齿发育相关的基因,但关于普通人群中牙齿形态变异的遗传基础的研究仍然有限。全基因组关联研究(GWAS)虽然已经揭示了许多与常见表型变异相关的单核苷酸多态性(SNP),但这些关联的生物学机制大多尚未明确,尤其是非编码SNP的作用。 本研究旨在通过多组学分析,探索现代人类牙齿冠部尺寸变异的遗传基础。研究团队通过对混合大陆血统的哥伦比亚人群进行全基因组关联分析,识别出18个与牙齿冠部尺寸显著相关的基因组区域,并进一步验证了其中7个区域在独立...

视网膜神经血管单元的层特异性解剖和生理特征

关于视网膜神经血管单元层特异性解剖与生理特性的学术研究报道 研究背景与问题提出 视网膜的处理过程和其他神经计算过程一样,具有极高的代谢需求,其中涉及血流的动态调控(神经血管耦合,Neurovascular Coupling, NVC)。视网膜拥有三层血管网:浅层血管网(Superficial Vascular Plexus,SVP)、中间血管网(Intermediate Vascular Plexus,IVP)和深层血管网(Deep Vascular Plexus,DVP),这些结构为视网膜的正常功能提供支持。然而,目前的研究更多集中于SVP,其由星形胶质细胞(Astrocytes)裹覆,而对IVP和DVP的相关研究较少。 研究表明,辐射样的Müller胶质细胞是IVP和DVP的主要血管包裹...