欧洲心血管代谢多基因评分在多祖先群体中的有效性验证研究

欧洲裔心脏代谢多基因评分在多祖先群体中的有效性 近年来,多基因评分(Polygenic Scores,简称PGS)作为个体遗传风险评估工具受到了广泛关注。然而,大多数现有的PGS是基于对白人欧洲裔人群的基因组全关联研究(Genome-Wide Association Studies,简称GWAS)数据进行的。这导致这些PGS在非欧洲裔人群中的有效性受到质疑。本文旨在评估PGS在不同种族群体中的表现,尤其是南亚裔和非洲加勒比裔人群,以期探讨健康不平等问题。 背景介绍 多基因评分(Polygenic Scores,简称PGS)提供了个体对于某一特定疾病的遗传风险评估。然而,目前绝大多数的PGS是基于从欧洲裔人群的基因组全关联研究(GWAS)中得出的数据。这些特征使得PGS在其他种族群体中的有效性...

亨廷顿疾病中的体细胞CAG重复不稳定性及其与临床表型的潜在关联

HTT基因中间等位基因的体细胞CAG重复不稳定性和临床表型的潜在关联 研究背景 Huntington病(HD)是一种神经退行性疾病,由HTT基因中CAG三核苷酸重复扩展(≥36 CAG重复)引起。中间等位基因(IAs)具有27-35个CAG重复,一般不被认为是导致HD的直接原因,但其潜在的神经认知症状关联性仍有争议。已有研究表明,HTT体细胞CAG扩展可影响HD的发病时间,因此作者推测中间等位基因是否存在体细胞不稳定性,并且体细胞CAG扩展可能在某些IA携带者表现出HD样表型中起到作用。 论文来源 这篇文章由Ainara Ruiz de Sabando、Marc Ciosi、Arkaitz Galbete、Sarah A. Cumming、Spanish HD Collaborative G...

预防性药物基因组学检测对现实环境中抗血小板治疗的临床影响

药物基因组学检测对抗血小板治疗的临床影响 背景介绍 药物基因组学(PGx)正在改变P2Y12抑制剂(抗血小板药物)的使用,这类药物广泛应用于急性冠状动脉综合征(ACS)、神经血管问题及血管疾病的治疗。其中,氯吡格雷(clopidogrel)是一种常用的P2Y12抑制剂,这种前体药物依赖多种途径转化为活性代谢物,主要通过细胞色素P450 2C19(CYP2C19)酶来完成。然而,携带CYP2C19基因中功能缺失等位基因(LOF)的人群,其氯吡格雷药效较低,这使得某些患者面临更高的主要不良心血管事件(MACE)风险。 CYP2C19基因分型可以识别LOF等位基因的患者,并建议他们从氯吡格雷转到不依赖CYP2C19途径的替卡格雷(ticagrelor)或普拉格雷(prasugrel)。现有研究多集...

布莱恩特-李-博赫综合征的表型谱扩展

众多科学家发现布莱恩特-李-博杰综合征的表型谱系扩展 研究背景 布莱恩特-李-博杰综合征(Bryant-Li-Bhoj Syndrome,BLBS)自2022年被OMIM分类(OMIM: 619720, 619721),由H3.3(H3F3A 和 H3F3B)基因的生殖系变异所导致。该综合征以发育迟缓/智力残疾、颅面畸形、肌张力异常和神经影像学异常表现为特点。而本研究的导向是基于此疾病的临床特点并不完全被之前的分类囊括,尤其是在神经发育方面的表型特征。 研究来源 该研究由Dana E. Layo-Carris, Emily E. Lubin, Annabel K. Sangree等众多科学家共同完成,隶属于多个研究机构。该研究论文发表于《European Journal of Human G...

原发性家族性脑钙化症患者中引入上游开放阅读框的变异

研究背景及问题陈述 原发性家族性脑钙化症(Primary Familial Brain Calcification, PFBC)是一种罕见的神经系统疾病,表现为基底神经节和其他脑区的微血管钙化。尽管目前已经确定了至少六个与PFBC相关的基因(包括SLC20A2、XPR1、PDGFB、PDGFRB、MYORG和JAM2),但仍有超过50%的患者的致病原因尚不明确。这些未解释的病例可能包含在已知基因的非编码区中的隐匿变异。 研究人员假设,5’非翻译区(untranslated region, UTR)中的变异可能会引入AUG密码子,从而启动mRNA的翻译,导致某些PFBC基因的功能丧失。为验证这一假设,研究团队对113名与PFBC相关的探针的外显子测序数据进行了重新注释,并发现了PDGFB基因5...

利用酵母基因模型验证主动脉瘤相关的ACTA2变体的致病性

新型ACTA2突变导致主动脉瘤的病理性研究:利用酵母模型的验证 研究背景 主动脉瘤/夹层(TAAD)是一种潜在致命的血管病,其发病机制至今仍不完全清楚。ACTA2基因编码的α-平滑肌肌动蛋白是血管平滑肌收缩装置的关键成分。已知ACTA2基因的常染色体显性变异与家族性非综合征性TAAD有关,并且这些变异具有不完全渗透性和可变表型,使得验证ACTA2变异的病理性通过家族分离研究变得复杂。为了解决这一问题,研究者开发了一种基于酵母的评估系统用以测试潜在TAAD相关的ACTA2变异。 研究作者与来源 本项研究由Cristina Calderan、Ugo Sorrentino、Luca Persano、Eva Trevisson、Geppo Sartori、Leonardo Salviati以及Mar...

宫颈人乳头瘤病毒(HPV)感染的基因组、HLA及多基因风险评分分析

关于宫颈高风险人乳头状瘤病毒(hrHPV)感染的全基因组和多基因风险评分分析 背景介绍 宫颈高风险人乳头状瘤病毒(hrHPV)感染是全球第二大致癌性感染,约占所有感染相关癌症的31.4%(全球220万例癌症中约69万例)。大多数的HPV感染在初次性接触后不久发生,并且超过90%的感染在两年内自行清除。然而,持续存在的HPV感染是引发肛门生殖器和口咽癌的必要但非充分条件。 尽管环境因素(如吸烟、长期使用激素避孕药、HIV共感染等)对HPV感染的持续性和清除有显著影响,但有多项观察表明遗传因素也可能在HPV感染的盛行和持续性中发挥重要作用。然而,目前关于宫颈HPV感染相关的基因变异研究仍较少。 研究来源 该论文署名为:Sally N. Adebamowo, Adebowale Adeyemo, ...

GTDc1在甘氨酸代谢和神经发育障碍中的作用的进一步证据

在近年来关于神经发育障碍(Neurodevelopmental Disorders, 简称NDDs)的研究中,科研团队发现了大量与NDDs相关的遗传变异,这些变异从单一核苷酸变异(Single Nucleotide Variants, SNVs)到结构大变化(例如染色体重排)不等。在这样的研究背景下,Edoardo Errichiello、Mauro Lecca、Chiara Vantaggiato等来自意大利帕维亚大学、因苏布里亚大学和其他机构的研究人员对一个特定的遗传因素——Glycosyltransferase-Like Domain Containing 1(GTDc1)基因与特定神经发育障碍之间的关联进行了深入探究。这项研究成果于2024年在《European Journal of...

Kabuki综合征中DNA甲基化谱分析: KMT2D VUS的重新分类

Kabuki 综合征DNA甲基化分析:谱系KMT2D变异的重分类 背景介绍 Kabuki 综合征 (KS),是一种因KMT2D基因的杂合不活化变异或结构性重排所致的罕见多先天畸形/神经发育紊乱疾病。尽管KS由于其独特的外表特征而可识别,但由于其临床变异性,诊断仍然具有挑战性。此外,体细胞嵌合体变异在KS中也有所发现,但这些变异的完整谱系特征尚未完全确定。 DNA甲基化(DNAm)分析作为一种工具,已成功用于分类与多种神经发育紊乱疾病相关的基因的变异,包括KS。在本研究中,我们应用了KS特异的DNAm标志对携带KMT2D变异的13位个体进行了分类,并测试了DNAm分析在不同程度的嵌合体中识别致病变异的能力。 文章信息 本研究由Marcello Niceta、Andrea Ciolfi和其他专家...

机会性基因组筛查在儿童癌症队列中的可行性与家庭接受情况

儿科癌症患者机会性基因组筛查的可行性及其家族接受度研究 研究背景 随着基因组医学的发展与应用,对严重疾病患者的护理正在逐步得到优化。特别是在儿童癌症领域,全基因组系列DNA测试成为了患者管理的重要手段。一项集中于砌石研究的后续工作,考察了机会性基因组筛查(OGS)在此患者群体及其亲属中的医学影响。该研究量化了OGS结果披露后,在一段时间内的行动性及级联测试的接受度。研究指出,在19/595(3.2%)的患者中报告了次要发现,主要与心血管和血脂疾病相关的基因。 研究来源 本研究团队由Sophia Hammer-Hansen 1, Ulrik Stoltze 1,2, Emil Bartels 3,4 等多位专家组成,他们分别代表了丹麦哥本哈根大学医院里希斯比塔莱特的多个部门。该研究于2024年...