Neurohackademy：オンラインとオフラインを組み合わせた神経情報学の教育 背景紹介 近年、人類神経科学はビッグデータの時代に突入しています。人類コネクトーム計画（Human Connectome Project）、青少年脳認知発達（ABCD）研究などのプロジェクトのおかげで、科学者たちは以前には想像もできなかった規模と範囲のデータセットを取得することが可能となりました。これらのデータセットは基礎および臨床研究において重要な科学的潜在力を持っています。しかし、これらのデータセットは研究者に対して新たな挑戦ももたらしています。データの生成、処理、アクセス、分析、理解などがその一例です。特に大きな課題として、「ビッグデータスキルギャップ」と呼ばれるものがあります。これらのデータセットを活...
光学自旋軌道耦合の広帯域色差空間微分イメージング 背景紹介 画像処理において、従来の空間微分は通常デジタル電子計算によって行われます。しかし、多くのビッグデータアプリケーションではリアルタイムかつ高スループットな画像処理が求められており、これはデジタル計算にとって大きな挑戦です。光学的なアナログ空間微分はこの挑戦を克服する可能性があります。なぜなら、低エネルギーで全ての画像を大規模に並行処理できるからです。さらに、光学的な空間微分は純粋な位相物体（例：透明な生物細胞）のイメージングも可能であり、これはデジタル電子計算では実現不可能です。このため、光学的な微分は最近広く注目されており、ラベルフリーセルイメージング、画像処理、コンピュータビジョンなどの分野で広範な応用があります。 論文出典 本論...
胃がんおよび胃食道接合部腺がんにおけるClaudin 18.2の研究報告 背景紹介 胃がんおよび胃食道接合部（G/GEJ）腺がんは、世界的な健康負担となっています。推定では、2020年に新たに発生した胃がんおよび食道がんの症例数は約170万件、関連する死亡者数は130万人に達しました。米国では、2023年に新たに胃がんおよび関連がんの症例が48060件、死亡者数が27250と予測されています。現在、G/GEJ腺がんの治療選択肢は限られており、遠隔転移症例の5年相対生存率は2007年以来約10%にとどまっています。そのため、病気の特性をよりよく理解し、新たな生体マーカーを発見し、診断、管理、および予後に対する臨床および腫瘍関連の影響を理解することが急務です。 Claudin（Claudin、C...
腫瘍変異負荷予測一線免疫チェックポイント阻害剤治療における転移性黒色腫の実世界結末に関する研究 転移性黒色腫の治療は近年、免疫チェックポイント阻害剤（ICIs）によって大きな影響を受けています。しかし、ICIsは黒色腫患者の生存率を著しく向上させたものの、短期間の反応や免疫関連毒性は依然として臨床上の制約因子となっています。そのため、ICIs治療効果を予測するバイオマーカーの理解と発見が重要な研究方向となっています。さまざまな予測バイオマーカーの中で、腫瘍変異負荷（Tumor Mutational Burden, TMB）はICIsによる転移性実体癌の予測分子マーカーとして検証・承認されています。TMBはミリオン塩基対当たりの体細胞変異の数として定義され、ICIチェックポイント阻害剤への患者...
RegorafenibのBRAF変異実体腫瘍患者における応用：TAPUR試験結果のまとめ 背景紹介 BRAF遺伝子は細胞質セリン-スレオニンキナーゼファミリーに属し、マイトジェン活性化タンパク質キナーゼシグナル経路（MAPK）を活性化することで細胞増殖と生存を調節します。BRAF変異はその異常活性を引き起こし、腫瘍形成を促進します。BRAF変異は三つのカテゴリーに分けられます：I類はV600位点変異で、Ras非依存性活性化モノマー；II類変異はRas非依存性活性化ダイマー；III類はキナーゼ欠失性変異で、CRAFの活性化を助長します。BRAF変異はメラノーマ（約40%）、甲状腺癌、大腸癌（CRC）、非小細胞肺癌（NSCLC）、および胆管癌に一般的です。 Regorafenibは小分子多ターゲ...
在当今の腫瘍学臨床実践および薬物開発分野において、腫瘍反応の評価方法は革新の瀬戸際に立っています。1981年に世界保健機構（WHO）が抗癌薬の効果を評価するための腫瘍反応分類基準を提案して以来、この分野は何度も改良を経験してきました。最もよく知られているのは、1995年に設立された実体腫瘍における反応評価基準（RECIST）作業部会によるものです。この作業部会は、カナダ国立がん研究所、米国国立がん研究所、および欧州がん研究治療機構と協力して多数の症例データに基づく根拠に基づいた勧告を構築し、RECIST 1.0および1.1バージョンの公開を促進しました。これらのバージョンは、客観的な反応率などの画像学的エンドポイントを確定する上で重要な役割を果たしてきました。 しかし、腫瘍生物学のより深い理...
前立腺がん患者のトランスクリプトーム解析：前立腺特異的膜抗原ポジトロン断層撮影/コンピュータ断層撮影に基づく非局所性疾患の研究 学術的背景 前立腺がんは一般的な男性の悪性腫瘍であり、その診断と治療は患者の予後にとって非常に重要です。トランスクリプトーム解析は遺伝子発現レベルを理解するための技術で、近年、がん研究で広く応用されています。Decipher遺伝子分類器は、前立腺がん患者の根治手術（RP）や放射線治療後の転移リスクを予測するための予後バイオマーカーです。現在の研究は、前立腺特異膜抗原ポジトロン断層撮影/コンピュータ断層撮影（PSMA PET/CT）の時代におけるDecipherテストの予後能力への興味から始まっています。PSMA PET/CTが非局所性疾患の検出において高い特異性と感...
ErdafitinibによるFGFR変異または融合を有する腫瘍患者における効果研究 本篇学術報告は、科学論文「Phase II Study of Erdafitinib in Patients with Tumors with Fibroblast Growth Factor Receptor Mutations or Fusions: Results from the NCI-MATCH ECOG-ACRIN Trial (EAY131) Subprotocol K2」に基づいて、この研究の学術背景、目的、方法、結果、および結論を紹介します。 学術背景 線維芽細胞成長因子受容体（FGFR）ファミリーは、4つの膜貫通受容体チロシンキナーゼ（FGFR1-4）を含み、これらの受容体は20種類以上...
研究背景 近年、ポリADP-リボースポリメラーゼ（Poly ADP-ribose Polymerase, PARP）阻害剤は、遺伝性乳癌1/2（BRCA1/2）変異癌症の治療における重要な方法として顕著な効果を示しています。しかし、ATM、CDK12、CHEK2などの他の相同組み換え欠損（Homologous Recombination Deficiency, HRD）遺伝子変異を持つ腫瘍に対しては、その効果は十分ではありません。そのため、研究者たちはPARP阻害剤を他の薬物と組み合わせて使用することで治療効果を高め、DNA損傷修復の抑制時間を延ばすことを模索し始めました。 以前のいくつかの臨床前研究では、PARP阻害剤とトポイソメラーゼI阻害剤であるイリノテカン（Irinotecan）の併...
FGFR増幅を持つ患者に対するErdafitinibの第II相研究：詳細レポート 背景紹介 線維芽細胞成長因子受容体（Fibroblast Growth Factor Receptor、FGFR）ファミリーのシグナル経路の乱れは、がんの発生、進展および治療抵抗性に関連していることが広く認識されています。本研究はFGFR1-4増幅（FGFR amplifications）の腫瘍を対象としており、特定のタイプの腫瘍に対するFGFR阻害剤が承認されていますが、FGFR遺伝子の増幅は最も一般的です。これを踏まえ、経口FGFR1-4阻害剤であるerdafitinibのFGFR1-4増幅を持つ腫瘍患者における抗腫瘍効果を評価することを目的としています。 研究の出典 この論文はJun Gong、Alain...