大腸がん免疫療法におけるSDCBPの役割

Syndecan Binding Protein (SDCBP) が大腸がんにおける腫瘍微小環境、腫瘍進展およびPD1阻害療法の効果に与える影響 背景紹介 近年、免疫療法はがん治療に革命的な進展をもたらしました。しかし、大腸がん(Colorectal Cancer, CRC)に対する抗プログラム細胞死1(Anti-Programmed Cell Death 1, APD1)療法の効果は限定的です。免疫チェックポイント阻害剤(Immune Checkpoint Inhibitors, ICIs)の治療から恩恵を受けるのは、ミクロサテライト不安定性(Microsatellite Instability, MSI)-高発現(MSI-H)の患者の特定サブグループに限られていますが、これらの患者は全体...

ロミデプシンがDDIT4-mTORC1経路を通じて食道扁平上皮癌の活性を示す

Romidepsin は DDIT4-mTORC1 経路を通じて食道扁平上皮がんに対する抗腫瘍活性を示す 食道扁平上皮がん(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)は、世界で最も一般的な悪性腫瘍の一つであり、高発症率および高死亡率を持ちます。現在の治療オプションが限られているため、新しい効果的な治療薬の開発が急務となっています。本研究では、研究者は高スループット薬物スクリーニング(high-throughput drug screening, HTS)技術を用いてESCC細胞株をスクリーニングし、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤ロミデプシン(Romidepsin)がESCC細胞の増殖抑制、アポトーシス誘導、および細胞周期の停止に顕著な効果があることを発...

乳癌細胞株のクロマチンアクセシビリティプロファイリングによる系統特異的エピジェネティック調節因子FOXA1とGRHL2の同定

乳がん細胞株のクロマチンアクセシビリティ解析による系統特異的なエピジェネティック制御因子FOXA1とGRHL2の同定 背景紹介 乳がんは非常に異質性の強い疾患であり、現在の臨床では遺伝子発現パターン、内在分子サブタイプ、ホルモン受容体/ヒト上皮成長因子受容体2 (HER2) の発現に基づいて分類されています。しかし、既存の研究は乳腺腫瘍が遺伝子発現以外にも明確な異質性を示していることを明らかにしています。例えば、エストロゲン受容体陽性(ER+)乳がんのいくつかはER応答エレメントのアクセシビリティが低下しており、予後不良を引き起こす可能性があります。これらの発見に基づいて、エピジェネティック状態の識別は乳がんの異質性をより包括的に理解するために重要です。 乳がん細胞株は乳がん研究の重要なモデ...

アデノ随伴ウイルス媒介による中枢神経系へのトラスツズマブ送達:ヒト表皮成長因子受容体2+脳転移に向けて

AAV介在のトラスツズマブ中枢神経系送達によるEGFR2陽性脳転移腫瘍治療 背景紹介 乳がん治療において、ヒト上皮成長因子受容体2(HER2)陽性の腫瘍は、より攻撃的な特徴を示し、臨床治療において顕著な課題となっています。1998年にトラスツズマブ(商品名:ハーセプチン®)が承認されて以来、この薬はHER2陽性乳がん患者の全体生存率を顕著に改善してきました。しかし、中枢神経系(CNS)に転移したHER2陽性の脳転移症例に対しては、血液脳関門や他の要因の影響により、トラスツズマブの脳脊髄液中の半減期が短い(2-4日)ため、従来の全身的な抗HER2抗体治療の効果は限られています。そのため、HER2陽性CNS疾病を標的とする新しい治療法を模索する必要があります。 研究出典 本研究は、ペンシルベニア...

複数波長の励起蛍光分光法を用いた蛍光団のロバストな推定のための明示的なベースラインモデル

研究背景 蛍光スペクトルは、蛍光物質(蛍光団)の識別と定量に広く使用される方法です。しかし、材料に他の蛍光団(基線蛍光団)が含まれている場合、対象の蛍光団を定量化することが難しくなります。特に基線の発光スペクトルが明確に定義されておらず、対象の蛍光団の発光スペクトルと重なる場合に問題となります。これらの蛍光物質を正確に区別して定量化するために、研究者たちは多波長励起蛍光スペクトルに基づく新しい方法を提案しました。この研究の主な目標は、基線蛍光干渉の問題を解決し、事前の仮定なしに堅牢な推定アルゴリズムを提供することです。 論文の出典 この論文は「An Explicit Estimated Baseline Model for Robust Estimation of Fluorophores ...

MRIからの神経膠腫におけるIDH状態予測のための多階層特徴探索と融合ネットワーク

多層特徴探索と融合ネットワークを用いたMRIにおけるIDH状態予測研究 研究背景 膠芽腫は成人における最も一般的な悪性原発性脳腫瘍です。2021年の世界保健機関(WHO)の腫瘍分類によると、腫瘍のサブタイプの区分には遺伝子型が重要な意味を持ち、とりわけイソクエン酸脱水素酵素(IDH)遺伝子型は膠芽腫の診断に極めて重要です。臨床研究は、IDH変異を持つ膠芽腫が特定の表現型遺伝子変異特性を通じて酵素活性、細胞代謝および生物特性に影響を与えることを示しています。IDH変異を持つ膠芽腫は、IDH野生型のものよりもテモゾロミドに対して感受性が高く、予後が良好です。現在、IDH状態の認定は主に侵襲的手術後に組織標本を用いた遺伝子シーケンシングまたは免疫組織化学分析に依存しています。しかし、侵襲的な操作は...

ダイナミックコントラスト増強磁気共鳴画像における薬物動態パラメータの正規化フローに基づく分布推定

在現代医療診断および臨床研究において、動的コントラスト強調磁気共鳴画像(Dynamic Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Imaging, DCE-MRI)技術は、組織病理学に関する重要な情報を提供します。トレーサーキネティック(Tracer-Kinetic, TK)モデルをフィットさせることにより、時間系列MRI信号から薬物動態学(Pharmacokinetic, PK)パラメーターを抽出できます。しかし、これらの推定されたPKパラメーターは、信号対雑音比(Signal-to-Noise Ratio, SNR)、バックグラウンドT1時間、開始時間、動脈入力機能(Arterial Input Function, AIF)、およびフィットアルゴリズムなど...

3D MRI の分類のためのシャム輸送ドメイン適応フレームワーク: グリオーマおよびアルツハイマー病

Siamese-Transport領域適応フレームワークに基づく3D MRIによる膠芽腫およびアルツハイマー病の分類 研究背景 コンピュータ支援診断において、3D磁気共鳴画像法(MRI)によるスクリーニングは早期診断に重要な役割を果たし、さまざまな脳疾患の悪化を防止するのに有効です。膠芽腫は一般的な悪性脳腫瘍で、その治療法は腫瘍のグレードによって異なります。そのため、正確で効率的な3D MRI分類は医用画像分析において極めて重要です。しかし、従来の深層学習モデルは臨床における未ラベルデータに適用された場合、異なる装置やデータ収集パラメータの違いによる領域間不一致性のため、性能が著しく低下します。既存の方法は主に領域間の差異を減少させることに焦点を当てていますが、セマンティック特徴と領域情報の...

解釈可能なAIを利用した脳腫瘍検出と分類のためのビジョントランスフォーマー、アンサンブルモデル、および転移学習

近年、脳腫瘍の高発生率と致命性のため、迅速かつ正確に脳腫瘍を検出し分類することが特に重要になってきています。脳腫瘍には悪性と非悪性の二種類があり、その異常な成長は脳に長期的な損傷を与えます。磁気共鳴画像(MRI)は一般的な脳腫瘍の検出方法です。しかし、専門家による手作業でのMRI画像分析に頼ると結果が一致しないリスクがあり、さらに単に腫瘍を識別するだけでは不十分で、迅速に腫瘍の種類を特定して早期に治療を開始することも重要です。 研究背景 腫瘍検出の速度、信頼性、公正性を向上させるために、本研究ではVGG16、InceptionV3、VGG19、ResNet50、InceptionResNetV2、Xceptionなど、さまざまな深層学習(Deep Learning, DL)アーキテクチャを探...

腫瘍切除後の低悪性度神経膠腫における神経膠腫成長モデルの予測価値の評価

低級グリオーマ手術後の成長モデル予測価値の評価研究レビュー はじめに グリオーマは、脳内で急速に拡散する侵襲性脳腫瘍である。この拡散のパターンと速度を理解し予測することで、治療計画の最適化が可能である。拡散-増殖モデルに基づくグリオーマ成長モデルは実現可能性を示しているが、実際の臨床データでの応用と評価には依然として課題がある。この問題の評価を改善するために、本研究では腫瘍成長問題をランキング問題と見なし、平均精度(Average Precision, AP)を指標として使用することを提案する。この方法は特定の体積閾値を必要とせず、空間パターンをより正確に評価できる。 研究の出典 この論文は、カリン・A・バン・ガルデレン(Karin A. van Garderen)、セバスチャン・R・バン・...