将来の高度シーケンス診断における品質保証の適用 背景紹介 過去10年間、次世代シーケンシング（Next-Generation Sequencing、NGS）は希少神経疾患（Rare Neurological Diseases、RND）の診断分野で革命的な進歩を遂げました。しかし、技術、解釈、報告の基準が不足しているため、グローバルで一貫性のある高品質な診断を確保することが課題となっています。この問題に対処するため、欧州希少神経疾患リファレンスネットワーク（European Reference Network for Rare Neurological Diseases、ERN-RND）は欧州分子遺伝学品質ネットワーク（European Molecular Genetics Quality N...
次世代シーケンシングに基づく乳がん多遺伝子リスクスコア位置の遺伝子型決定の限界 背景紹介 遺伝性乳がん（Breast Cancer, BC）の予測において、多遺伝子リスクスコア（Polygenic Risk Scores, PRSs）が個人のリスク予測の重要なツールとして、ますます広く適用されています。PRSの計算は、変異対立遺伝子頻度（Allele Frequencies, AFs）を正確に再現し、それによってPRSSの値を正確に予測することに依存しています。しかし、現在、次世代シーケンシング技術（Next-Generation Sequencing, NGS）を使用して多遺伝子リスクスコアの遺伝子型分析を行う際、多くの技術的制限が存在します。本研究の背景は、これらの技術的課題にあり、乳が...
計算方法によるPAX6遺伝子ミスセンス変異の解釈の向上 背景紹介 PAX6遺伝子は高度に保存された転写因子で、眼の発生において重要な役割を果たしています。PAX6のヘテロ接合性機能喪失変異は、無虹彩症を含む一連の眼科疾患を引き起こす可能性があります。しかし、多くのPAX6遺伝子のミスセンス変異は現在、意義不明の変異（VUS）に分類されており、これは分子診断に大きな課題を提起しています。計算ツールを使用して遺伝子変異の影響を評価することはできますが、その予測の正確性は様々です。この研究では、著者らはPAX6ミスセンス変異に関する計算予測ツールの性能を評価し、最適化しました。 出典紹介 この論文は、Nadya S. Andhika、Susmito Biswas、Claire Hardcastle...
オランダ薬理遺伝学ワーキンググループの抗てんかん薬CYP2C9、HLA-AおよびHLA-B遺伝子-薬物相互作用ガイドライン 背景紹介 薬理遺伝学（Pharmacogenetics, PGx）は遺伝子変異が個人の薬物反応にどのように影響するかを研究し、これらの知識を利用して薬物選択と用量を指導し、薬物療法を最適化し、薬物有害反応を予防し、より安全でより費用対効果の高い薬物療法効果を達成することを目的としています。薬理遺伝学は世界中の医療分野で広く認識されていますが、日常の臨床実践での応用にはまだ課題があります。 臨床医師が薬理遺伝学を実施するのを支援するために、オランダ王立薬剤師協会（KNMP）は2005年にオランダ薬理遺伝学ワーキンググループ（DPWG）を設立しました。DPWGの目標は、系統...
POT1腫瘍感受性研究：より広範な関連悪性腫瘍スペクトルおよび追加スクリーニング計画の提案 研究背景 POT1（Protection of Telomeres Protein 1）タンパク質は、Shelterinテロメア結合複合体の重要な構成要素であり、テロメアの長さを調節する役割を担っています。POT1遺伝子の一部の病原性バリアント（PV）は、テロメアの延長、ゲノムの不安定性、およびがんリスクの増加をもたらします。POT1腫瘍感受性症候群（POT1-TPD）は常染色体優性遺伝形式を示し、浸透率は不明です。この症候群は皮膚黒色腫、慢性リンパ球性白血病、血管肉腫、およびグリオーマのリスク増加と関連しています。この研究は、POT1-TPDに関連するより広範ながん表現型を記述することを目的としてい...
ヌーナン症候群患者におけるRAF1:c.770C>T p.(Ser257Leu)変異の表現型相関性研究報告 学術的背景 ヌーナン症候群（Noonan syndrome、略称NS）は最も一般的なRASopathy疾患の一つで、これらの疾患は主にRASタンパク質とMAPK（有糸分裂原活性化プロテインキナーゼ）シグナル伝達経路の上方制御によって引き起こされます。これらの疾患の特徴には、顔面奇形、先天性心疾患（congenital heart defects、CHD）と肥大型心筋症（hypertrophic cardiomyopathy、HCM）、成長障害、骨格および外胚葉異常、リンパ系発育不全、停留精巣、および神経発達遅延/知的障害（intellectual disability、ID）が含まれま...
SLC5A6関連神経障害の診断と治療：ゲノムシーケンシングからの洞察 学術的背景 人間の疾患の研究と治療において、ゲノミクスは常に重要な位置を占めてきました。SLC5A6遺伝子によってコードされるナトリウム依存性マルチビタミン輸送体（SMVT）は、ビオチン、パントテン酸、α-リポ酸の摂取を担当し、人体の多様な代謝機能を維持する上で重要です。これまでの研究により、SLC5A6の病原性両アレル変異が、全身性代謝障害から小児期発症の末梢運動神経障害まで、一連の症状を引き起こす可能性があることが示されています。この研究は、ゲノムシーケンシング（GS）技術を用いて、SLC5A6変異に関連する障害を診断・治療し、早期診断におけるGSの経済的利益を探ることを目的としています。 研究ソース この研究はLis...
新科学研究がGABRA4遺伝子と神経系表現型の関連を明らかに 研究背景 近年、単一遺伝子変異に関連するてんかんと発達障害症候群の研究で顕著な進展がありました。GABAA受容体（γ-アミノ酪酸A受容体、gamma-aminobutyric acid sub-type A receptors、GABAARs）は、抑制性神経伝達を担う異質性のリガンド作動性陰イオンチャネルです。GABAARsは19種類の遺伝子にコードされた異なるサブユニットの組み合わせで構成され、機能的に多様な受容体サブタイプを形成します。これらの受容体のα4サブユニットは神経細胞とグリア細胞で発現し、歯状回と視床で最も豊富に発現しており、主にシナプス外に存在し、トーンに基づく抑制作用を行います。しかし、GABRA4（GABAAR...
COQ7欠損が引き起こすミトコンドリアCOQ10欠乏症の周産期発症 - 心筋症と消化管閉塞を伴う 背景紹介 コエンザイムQ10（CoQ10）は脂溶性分子で、抗酸化作用を持ち、ミトコンドリアの酸化的リン酸化過程における電子伝達の重要な部分を担っています。CoQ10欠乏症は稀なミトコンドリア代謝疾患で、通常4つの主要な臨床症状と関連しています：1) ステロイド抵抗性ネフローゼ症候群（SRNS）; 2) 脳症、肥大型または拡張型心筋症、乳酸アシドーシス、尿細管症; 3) 新生児脳症; 4) 純粋な神経系症候群。COQ遺伝子群の変異はCoQ10欠乏症の主要な原因の一つです。 臨床実践では、CoQ10欠乏症の早期発見と診断が極めて重要です。これは早期介入（CoQ10補充など）が予後を改善できるだけでな...
Erf遺伝子機能喪失変異とヌーナン症候群様表現型の関連性ー頭蓋縫合早期癒合を伴うまたは伴わない 研究背景 ETS転写因子ファミリーのメンバーは、RAS-MAPKシグナル伝達過程で重要な役割を果たし、これらのタンパク質は「初期応答」遺伝子やその他の機能関連遺伝子の発現調節を担っています。その中で、ETS2抑制因子(Erf)はRAS-MAPKシグナルを調節する転写調節因子です。Erf遺伝子の広範な切断変異は、様々な頭蓋縫合早期癒合症候群や非常に稀なChitayat症候群と関連しています。研究者らは、ヌーナン症候群(NS)様の症例を発見し、Erf遺伝子機能喪失変異がNS表現型と関連している可能性を示唆しました。本研究は、Erf遺伝子機能喪失変異とヌーナン症候群様表現型の関係をさらに探ることを目的と...