单细胞RNA测序揭示外周血中细胞类型特异性剪接调控与自身免疫及炎症性疾病的关系 背景介绍 近年来，基因组研究的飞速发展带来了对复杂性状遗传基础的更深入认识。然而，对于大多数与复杂疾病相关的基因组关联位点（GWAS loci），它们的功能机制仍未完全解明。这些位点大多位于非编码基因组区域，而非直接编码蛋白质的区域。因此，理解转录后事件，例如选择性剪接（alternative splicing, AS），如何影响基因表达以及复杂疾病的遗传风险，显得至关重要。选择性剪接是调控基因功能和生成基因表达多样性的关键机制，而其在特定细胞类型和遗传背景中的作用目前研究较少。 此外，大规模的单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）技术为无偏地检测单细胞层面...
利用大格式微阵列实现可扩展空间转录组学的新方法：Array-Seq技术的诞生 背景与研究起源 近年来，空间分子分析（spatiomolecular analyses）成为生物医学研究和临床病理学的重要工具，因为它能够研究组织中的细胞和分子空间位置如何影响其功能及其在健康和疾病中的异常变化。但现有的空间转录组学（spatial transcriptomics，ST）技术在多个层面面临制约：设备昂贵、操作复杂、表面积小、不支持大批量样本处理以及与常规组织学染色（如H&E染色）不兼容。这些缺点限制了技术的普及，也增大了其用于基础研究和临床分析的成本和难度。 早期的空间转录组学技术（如Visium平台）通过将空间条形码（spatial barcode）连接到捕获poly-A尾的寡聚核苷酸探针上实现了...
组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的时空印记 背景介绍 组织驻留记忆CD8 T细胞（Tissue-resident memory CD8 T cells, TRM细胞）在屏障部位（如肠道）提供长期的免疫保护。然而，TRM细胞的异质性及其形成机制尚不完全清楚。此前的研究发现，小肠中的TRM细胞至少分为两个亚群：一个具有更高的效应分子表达，另一个则具有更强的记忆潜能。这种异质性的起源尚不明确。本研究旨在探索不同组织微环境如何驱动TRM细胞的表型异质性，并揭示其在肠道中的时空分布规律。 论文来源 本论文由Miguel Reina-Campos、Alexander Monell等来自University of California, San Diego、La Jolla Institute for I...
RELMβ在食物过敏中的关键作用 学术背景 食物过敏（Food Allergy, FA）是一种常见的免疫系统疾病，尤其在儿童中发病率较高。食物过敏的发生与免疫系统对食物抗原的异常反应有关，尤其是2型免疫反应的失调。2型免疫反应通常是对寄生虫和毒素的防御机制，但其失调会导致食物过敏和过敏性休克等病理反应。尽管食物过敏的机制已有一定研究，但关于免疫耐受的维持和破坏的具体机制仍不清楚。特别是，肠道微生物群在食物过敏中的作用尚未完全阐明。 本研究旨在探讨一种由肠道杯状细胞分泌的蛋白质——抵抗素样分子β（Resistin-like molecule β, RELMβ）在食物过敏中的作用。RELMβ已被证明在肠道免疫和微生物群调控中发挥重要作用，但其在食物过敏中的具体机制尚不明确。通过研究RELMβ如何...
肿瘤微环境中的线粒体转移与免疫逃逸机制 学术背景 肿瘤细胞在肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）中通过多种机制逃避免疫系统的攻击，尤其是T细胞的攻击。尽管免疫检查点抑制剂（Immune Checkpoint Inhibitors, ICIs）在多种癌症治疗中取得了显著进展，但许多患者对治疗无反应或反应短暂。研究表明，肿瘤微环境中的代谢重编程和肿瘤浸润淋巴细胞（Tumor-Infiltrating Lymphocytes, TILs）的线粒体功能障碍会削弱抗肿瘤免疫反应。然而，这些过程的详细机制尚不清楚。本研究旨在揭示肿瘤细胞如何通过线粒体转移影响TILs的功能，进而逃避免疫系统的攻击。 论文来源 这篇论文由来自日本多家研究机构的科学家团队合作完成，包括Chib...
光热MXene嵌入单宁Eu3+颗粒用于海水浸泡感染伤口的原位细菌疫苗 学术背景 海水浸泡伤口由于其低温、高盐和富含细菌的环境，容易引发严重感染，阻碍伤口愈合。传统的抗菌策略往往无法提供长期的抗感染效果，也无法有效促进伤口愈合。为了解决这一问题，研究人员开发了一种新型的多功能伤口敷料，旨在通过杀死细菌并在原位递送细菌抗原来增强对海水浸泡伤口感染的抵抗力。这项研究提出了一种基于MXene嵌入单宁酸-铕（M@TA-Eu）颗粒的策略，通过光热效应杀死细菌并形成原位细菌疫苗，从而加速伤口愈合并提供持久的抗感染效果。 论文来源 这篇论文由Zhentao Li、Ting Song、Yanpeng Jiao、Zijing Zhu、Yang Liao和Zonghua Liu共同撰写，分别来自暨南大学材料科学与...
基于单细胞RNA测序和Bulk RNA测序的食管鳞状细胞癌预后预测模型研究 研究背景 食管鳞状细胞癌（Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC）是全球范围内常见的恶性肿瘤之一，尤其在东亚地区发病率较高。尽管现有的治疗手段包括手术、内镜切除和放化疗等，但患者的预后仍然较差，5年生存率仅为21%。免疫检查点抑制剂等新型疗法仅对20%-30%的患者有效，这表明我们对ESCC的分子机制，尤其是肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）的理解仍然不足。葡萄糖代谢异常是ESCC早期的重要特征之一，肿瘤细胞即使在氧气充足的情况下也会进行糖酵解，产生大量乳酸，影响微环境的酸性，进而促进肿瘤生长、血管生成和免疫抑制。因此，深入研究葡萄糖代谢与E...
MOG抗体相关疾病与抗NMDAR脑炎重叠综合征的临床分析 背景介绍 近年来，随着自身免疫性脑炎（Autoimmune Encephalitis, AE）和中枢神经系统（Central Nervous System, CNS）脱髓鞘疾病的深入研究，科学家们发现了一些罕见的重叠综合征病例。其中，MOG抗体相关疾病（MOG Antibody-Associated Disease, MOGAD）与抗N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDAR）脑炎的重叠现象引起了广泛关注。MOGAD是一种由抗髓鞘少突胶质细胞糖蛋白（Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein, MOG）抗体引发的CNS炎症性脱髓鞘疾病，而抗NMDAR脑炎则是由抗NMDAR抗体引发的自身免疫性脑炎。尽管这两种疾病...
TDO2抑制在肺癌免疫逃逸中的作用 背景介绍 肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一，吸烟被认为是肺癌发生的主要诱因。香烟烟雾中含有多种致癌物质，其中苯并[a]芘（Benzo[a]pyrene, BAP）是一种多环芳烃，已被证实能够通过激活芳香烃受体（Aryl Hydrocarbon Receptor, AHR）促进肺癌的发生和发展。近年来，免疫检查点分子如PD-L1（程序性死亡配体1）在肿瘤免疫逃逸中的作用备受关注。PD-L1通过与T细胞表面的PD-1结合，抑制T细胞的活性，从而帮助肿瘤细胞逃避免疫系统的攻击。尽管PD-L1/PD-1阻断疗法在肺癌治疗中显示出显著的临床效果，但环境致癌物如BAP如何通过免疫检查点分子促进免疫逃逸的机制尚不明确。 此外，色氨酸（Tryptophan, Trp）...
外泌体作为肺癌精准诊断的生物标志物 学术背景 肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一，尤其是非小细胞肺癌（NSCLC）和小细胞肺癌（SCLC）的早期诊断和精准治疗仍然面临巨大挑战。传统的组织活检虽然被认为是肺癌诊断的“金标准”，但其侵入性、耗时性和高成本限制了其在早期诊断中的应用。近年来，液体活检（liquid biopsy）作为一种非侵入性诊断方法，逐渐成为研究热点。液体活检通过分析血液等体液中的循环肿瘤细胞（CTCs）、循环肿瘤DNA（ctDNA）以及外泌体（extracellular vesicles, EVs）等生物标志物，为肺癌的早期诊断和精准治疗提供了新的可能性。 外泌体是由细胞分泌的纳米级膜包裹囊泡，携带蛋白质、脂质、DNA和RNA等多种生物活性物质，能够通过细胞间通讯调控受体细...