基于长读长测序的多重耐药微生物基因组监测

基于长读长测序的多重耐药微生物基因组监测研究 学术背景 多重耐药微生物(Multidrug-Resistant Organisms, MDROs)是全球公共卫生的重大威胁。这些微生物对多种抗生素产生耐药性,导致感染难以治疗,增加了医疗负担。为了有效监测和控制MDROs的传播,准确识别其耐药基因、分子类型变化以及传播路径至关重要。传统的分子分型方法,如脉冲场凝胶电泳(Pulsed-Field Gel Electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(Multi-Locus Sequence Typing, MLST),虽然在过去发挥了重要作用,但其分辨率较低、操作复杂且成本高昂。近年来,基于全基因组测序(Whole-Genome Sequencing, WGS)的方法逐渐成为主流,...

结核病中kynurenine-AHR通过抑制STAT1-CXCL9/CXCL10轴减少T细胞浸润并诱导延迟的T细胞免疫反应

结核病(Tuberculosis, TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, Mtb)引起的一种全球性健康问题,每年导致数百万人感染和死亡。尽管现代医学在结核病的诊断和治疗方面取得了显著进展,但Mtb的免疫逃逸机制仍然是其能够在宿主体内长期存活并引发慢性感染的关键原因之一。Mtb通过延迟宿主T细胞的免疫反应,尤其是T细胞向感染部位的招募,从而逃避宿主的免疫清除。这种延迟的T细胞反应被认为是Mtb建立其生态位并逃避免疫系统攻击的主要策略之一。 在结核感染过程中,适应性免疫反应,特别是CD4+ T细胞和CD8+ T细胞的作用至关重要。CD4+ T细胞通过分泌干扰素-γ(IFN-γ)激活巨噬细胞,增强其杀菌能力,而CD8+ T细胞则可以直接杀死被感染的细胞,减...

百年植物标本揭示葡萄皮尔斯病的起源

百年草标本揭示葡萄藤皮尔斯病的传播历史:研究综述 葡萄藤皮尔斯病(Pierce’s Disease, PD)是一种严重威胁葡萄种植业的植物疾病,其由名为Xylella fastidiosa(木质部快速死亡细菌)中的快速死亡亚种(Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa,简称Xff)引起。然而,这一病原体的地理起源、传入美洲的时间,以及传播路径均存在诸多科学争议。为解决上述问题,由Monica A. Donegan等科学家主导,分别来自加州大学伯克利分校(University of California, Berkeley)、法国国家自然历史博物馆(Museum National d’Histoire Naturelle, CNRS, Paris)及其他研究机构...

重组与基于鸡蛋的四价流感疫苗在养老院居民中的比较:一项集群随机试验

重组四价流感疫苗与标准鸡蛋基四价流感疫苗在养老院居民中的比较:一项集群随机试验 学术背景 流感是全球范围内导致老年人发病和死亡的主要呼吸道病原体之一,尤其是在养老院居民中,流感感染的风险更高。流感疫苗是预防流感相关疾病和死亡的最重要干预措施。然而,疫苗的有效性因季节和疫苗类型而异。近年来,重组流感疫苗(recombinant influenza vaccine, RIV4)因其更高的抗原剂量和更强的免疫反应而受到关注。尽管在门诊老年人群中,重组疫苗的有效性已被证明优于标准剂量的鸡蛋基流感疫苗(egg-based inactivated influenza vaccine, IIV4),但在养老院居民中的有效性尚未得到充分评估。 本研究旨在比较养老院居民接种重组四价流感疫苗与标准鸡蛋基四价流感...

在线协作眼结核研究计算器在结核性葡萄膜炎中的验证

学术背景 结核性葡萄膜炎(Tubercular Uveitis, TBU)是一种由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)引起的眼部感染或免疫介导的炎症反应。尽管结核病在全球范围内仍然是一个严重的公共卫生问题,但TBU的诊断和治疗仍然充满挑战。TBU的临床表现多样,且缺乏特异性的诊断标准,导致许多患者被误诊或延误治疗。传统的诊断方法,如结核菌素皮肤试验(TST)和干扰素γ释放试验(IGRA),仅能反映结核感染的存在,而无法确定感染是否活跃或与眼部炎症直接相关。此外,眼内液体的聚合酶链反应(PCR)检测敏感性较低,且采样过程具有侵入性,进一步增加了诊断的复杂性。 为了应对这些挑战,Collaborative Ocular Tuberculosis Study (CO...

基于EB病毒血清学筛查对鼻咽癌死亡率影响的集群随机对照试验

EBV血清学筛查对鼻咽癌死亡率的影响:一项集群随机对照试验 学术背景 鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma, NPC)是一种在亚洲地区,尤其是中国南方地区高发的恶性肿瘤。全球约85%的鼻咽癌病例发生在亚洲,其中中国南方的发病率尤为突出。鼻咽癌的早期症状通常不明显,导致大多数患者在确诊时已处于晚期,五年生存率仅为50%左右。然而,如果能在早期阶段发现并治疗,五年生存率可高达95%。因此,早期筛查对于提高鼻咽癌患者的生存率至关重要。 爱泼斯坦-巴尔病毒(Epstein-Barr Virus, EBV)是鼻咽癌的主要致病因素之一,尤其是在未分化型鼻咽癌中,EBV感染几乎存在于所有病例中。因此,基于EBV的血清学标志物筛查被认为是一种潜在的鼻咽癌早期检测手段。尽管已有研究表明,E...

基于光纤的表面增强拉曼光谱传感器用于快速多重检测生禽中的食源性病原体

基于光纤的表面增强拉曼光谱传感器用于快速多重检测生禽中的食源性病原体 学术背景 食源性疾病是全球公共卫生的重大挑战,其中沙门氏菌(Salmonella)是导致食源性疾病的主要病原体之一。仅在美国,每年就有135万例感染、26,500例住院和420例死亡病例。尽管有国家层面的改进目标,但美国的沙门氏菌感染率在过去三十年中几乎没有变化。家禽产品,尤其是鸡肉和火鸡产品,是沙门氏菌感染的主要来源,约占沙门氏菌病病例的23.4%。美国疾病控制与预防中心(CDC)估计,每25个在超市出售的鸡肉包装中就有一个被沙门氏菌污染。沙门氏菌每年给美国带来的经济损失高达41亿美元,包括医疗费用、生产力损失和死亡。 目前,沙门氏菌的检测方法主要依赖于聚合酶链式反应(PCR),该方法至少需要24小时(包括富集、样品准备...

呼吸道微生物组与RSV感染严重程度及儿童症状持续性的关联

呼吸道微生物组与儿童RSV感染严重程度及症状持续性的关联研究 学术背景 呼吸道合胞病毒(Respiratory Syncytial Virus, RSV)是导致婴幼儿呼吸道感染和住院的主要原因之一。尽管已知早产、先天性心脏病和支气管肺发育不良是严重感染的风险因素,但即使是健康的足月婴儿,RSV感染也可能导致严重疾病,甚至需要进入儿科重症监护室,并可能引发长期的健康问题,如持续性喘息。RSV感染的严重程度可以从普通感冒到严重的细支气管炎伴呼吸衰竭不等,这表明其他宿主因素或环境因素可能调节疾病的严重程度。 近年来,多项研究发现,早期呼吸道微生物群落的组成与后续呼吸道感染的风险有关。尽管机制尚未完全明确,但这些发现可能通过微生物群的免疫调节或早期微生物事件的免疫印记来解释。然而,目前尚不清楚早期微...

SARS-CoV-2的持续进化驱动其逃逸mRNA疫苗诱导的体液免疫

SARS-CoV-2的持续进化驱动其逃逸mRNA疫苗诱导的体液免疫 学术背景 自2019年底SARS-CoV-2病毒首次出现以来,该病毒经历了持续的进化,产生了多个变异株。这些变异株通过突变增强了其传播能力和免疫逃逸能力,尤其是针对疫苗诱导的体液免疫。尽管mRNA疫苗在预防COVID-19感染、住院和死亡方面表现出显著效果,但随着Omicron等变异株的出现,疫苗的有效性逐渐减弱。为了应对这一挑战,研究人员不断更新疫苗配方,但病毒的快速进化仍然对疫苗的有效性构成威胁。 本文由Alex L. Roederer、Yi Cao、Kerri St. Denis等来自Ragon Institute of MGH, MIT, and Harvard的研究团队撰写,于2024年12月17日发表在《Cell...

多模态分析揭示EBV阳性和EBV阴性移植后淋巴增殖性疾病的肿瘤和免疫特征

Epstein-Barr病毒(EBV)是一种广泛传播的γ-1型疱疹病毒,全球约90%-95%的成年人感染了该病毒。EBV感染通常无症状,病毒通过复杂的生命周期,最终在宿主的一部分B细胞中建立潜伏感染。尽管宿主免疫系统通过自然杀伤细胞和抗病毒T细胞反应来控制EBV感染,但在免疫抑制的个体中,EBV可能驱动肿瘤发生,导致包括移植后淋巴增殖性疾病(PTLD)在内的恶性肿瘤。PTLD是一种在器官或骨髓移植后由于免疫抑制导致的淋巴组织异常增殖的疾病,其中大部分B细胞PTLD与EBV相关,但也有相当一部分病例为EBV阴性。目前,EBV阳性和EBV阴性PTLD的肿瘤内在特征及其肿瘤微环境(TME)的差异尚不明确,导致现有的治疗策略对两者相似,缺乏针对性。 论文来源 这篇论文由Jiaying Toh、And...