快速检测临床样本中微生物的统一宏基因组学方法

快速检测临床样本中微生物的统一宏基因组学方法

一种快速检测临床样本中微生物的统一宏基因组方法的研究 背景介绍 此次研究的背景是基于当前临床宏基因组学(clinical metagenomics)的局限性。临床宏基因组学是对临床样本中的所有微生物进行基因组测序的方法,理想情况下在耗尽人类DNA之后进行,以提高灵敏度并减少周转时间。然而,当前的人类DNA耗尽方法往往只能优先保留含有DNA或RNA的微生物,但不能同时保留两者。这一研究旨在描述和展示一种实用的、快速的机械宿主-耗尽方法,使得能通过纳米孔测序(nanopore sequencing)对RNA和DNA微生物进行同时检测。 源自 这篇论文由Adela Alcolea-Medina、Christopher Alder、Luke B. Snell、Themoula Charalampou...

靶向Sertolic细胞中的失调吞噬/自噬溶酶体以改善迟发性性腺功能减退

研究背景 本研究围绕晚发性低睾酮血症(LOH)展开,致力于揭示与年龄相关的睾丸功能偏差,例如LOH的机制尚未完全理解。研究采用单细胞RNA测序技术,对患有LOH的人类睾丸进行分析,确定了支持细胞(SCs)作为睾丸微环境中的关键代谢协调员。研究发现老年SCs中的溶酶体酸度降低,导致自噬和吞噬通路受损,SCs积累了代谢物,包括胆固醇,并且炎症基因表达上升,因此将这些细胞称为发生病理转变的SCs。通过饮食诱导的高脂肪压力能够在小鼠中重现LOH特征。显著的是,研究通过药物干预涉及SCs的efferent ductular注射和系统性TRPML1激动剂管理,恢复了溶酶体功能,从而在高脂饮食诱导的LOH小鼠中纠正了睾酮缺陷和相关异常。这一发现强调了SCs在睾丸衰老中的中心作用,并提出了LOH的有希望的治...

雌激素通过NAMPT调控的ER应激反应对抗与年龄相关的米色脂肪生成衰退

雌激素逆转米色脂肪生成的衰退 通过NAMPT调控的内质网应激反应 摘要: 褐色脂肪细胞因其对抗代谢疾病的潜在治疗作用而受到重视。然而,随着年龄的增长,这些细胞提供的代谢优势受到损害。我们的研究表明,使用随年龄减少的激素雌激素(E2)治疗小鼠可以逆转年龄相关的米色脂肪生成(米色脂肪细胞的形成)的衰退,并在冷环境下增强能量消耗和改善小鼠的葡萄糖耐受性。我们发现,烟酰胺磷酸核苷转移酶(NAMPT)在E2诱导的米色脂肪细胞形成中起着关键作用,并随后抑制了与年龄相关的内质网(ER)应激的发作。此外,我们的发现揭示了调节年龄相关的米色脂肪细胞形成受损机制,并强调了E2-NAMPT控制的ER应激途径作为此过程的关键调节器。 研究背景: 在老年人群中,肥胖和糖尿病成为主要的健康问题。因此,缓解肥胖及其并发症...

人类中脑的单核配对多组学分析揭示了与年龄和帕金森病相关的胶质细胞变化

人类中脑的单核配对多组学分析揭示了与年龄和帕金森病相关的胶质细胞变化

单核多组学分析揭示人类中脑的年龄相关和帕金森病相关的神经胶质细胞变化 研究背景 年龄是帕金森病(Parkinson’s Disease, PD)的主要风险因素之一。虽然已知年龄在PD发病中的重要作用,但有关年龄如何改变大脑的基因表达和调控景观的细节仍不清楚。现有的大部分研究集中在转录组学的分析或遗传因素的探索上,但缺少关于人类中脑不同细胞类型在老化和PD病程中基因表达和染色质可及性变化的详细数据。因此,本研究通过多组学手段,采用单核分析技术,揭示了年轻、年老及PD患者中脑的基因表达和染色质可及性变化,以理解老化在PD发病中的作用。 论文来源 本篇研究论文发表于《Nature Aging》期刊,题为“一种对人类中脑的单核配对多组学分析揭示了与年龄和帕金森病相关的神经胶质细胞变化”。论文的作者包...

单核测序揭示对ALS敏感的神经元中存在遗传风险因子的丰富表达

《Nature Aging》发表ALS神经变性新研究 人类历史长河中,诸多神秘的疾病一直是科学研究的难题,其中,肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS)作为一种进行性神经退行性疾病,以肌肉功能的逐渐丧失及失能而著称。不幸的是,这场争夺生命线的斗争,病患常在症状发现的2至5年内败下阵来。关于ALS病因的探索,早已成为现代神经科学研究的重要领域。 如今,在这场抗击神经退行性疾病的征途上,一项新的研究成果展现在了世人面前。2024年7月,《Nature Aging》杂志发表了一篇由凯文·伊根(Kevin Eggan)和团队撰写的研究文章,此次研究的核心在于单核测序技术,该技术揭示了在ALS病患中,特定的外大脑神经元在退行性病变中显得异常敏感,并富集了遗传风险因子的表达。 研究背景与意义 ALS,俗称渐冻人...

年轻血浆中的小型细胞外囊泡通过改善线粒体能量代谢逆转与年龄相关的功能衰退

年轻血浆中的小型细胞外囊泡通过改善线粒体能量代谢逆转与年龄相关的功能衰退 背景介绍 近年来,异种共生(heterochronic parabiosis)的研究揭示了年轻血液对老年组织的显著再生效果。然而,具体的再生机制仍未完全阐明。本文展示了来自年轻小鼠血浆的小型细胞外囊泡(small extracellular vesicles, sEVs)能够在分子、线粒体、细胞及生理水平上对抗已有的衰老。年轻sEVs通过静脉注射到老年小鼠体内,延长其寿命,减轻衰老表型,并改善多种组织中的年龄相关功能衰退。定量蛋白质组学分析显示,年轻sEVs处理后,老年组织的蛋白质组发生了显著变化,这些变化与代谢过程密切相关。机制研究表明,年轻sEVs主要通过其miRNA货物在体内和体外刺激PGC-1α的表达,从而改善...

使用脑脊液生物标志物模型对阿尔茨海默病进行病程阶段划分

研究背景与目的 随着全球超过5000万人受认知障碍病症影响,预计这一数字到2050年将翻倍。阿尔茨海默病(AD)是最常见的痴呆形式,其特征是脑部形成淀粉样β(Aβ)胞外斑块和tau蛋白内部聚集。过去二十年间,AD领域聚焦于使用生物标志物来支持诊断和预断,而不单靠临床症状。本研究旨在利用脑脊液(CSF)生物标志物构建一个对AD进行分期的稳健生物学模型。 研究来源 本研究由Gemma Salvadó等多位学者完成,他们来自于多个国家和地区的多个研究机构,例如瑞典隆德大学、华盛顿大学医学院和荷兰阿姆斯特丹VU大学医学中心等。该研究成果发表于2024年5月的《Nature Aging》杂志上。 研究设计与方法 本研究包括426名来自Biofinder-2项目和222名来自Knight阿尔茨海默病研究...

DDX5通过可变剪接和G四联体展开抑制骨关节炎中的透明软骨纤维化和降解

DDX5抑制骨关节炎中透明软骨纤维化和降解的新机制 研究背景 骨关节炎(Osteoarthritis,OA)是一种以关节软骨退化、变性及骨质增生为主要特征的慢性退行性疾病。透明软骨纤维化常被认为是OA的终末病变阶段,导致细胞外基质(Extracellular Matrix,ECM)的变化。然而,透明软骨纤维化的机制目前尚不完全清楚。近期的单细胞测序研究显示,纤维软骨样软骨细胞在OA的病程中起到重要作用。已有研究表明,RNA解旋酶DEAD-box RNA helicase 5(DDX5)的缺失会导致软骨退化并加剧纤维样表型。然而,具体的调控机制仍需要进一步研究。 研究来源及发表信息 本文题为《Ddx5 inhibits hyaline cartilage fibrosis and degrad...

BRAF突变型转移性结直肠癌患者接受Encorafenib-Cetuximab治疗的生存分析

对癌基因突变性转移性结直肠癌患者采用恩可拉费尼-西妥昔单抗治疗的实效性-有效性分析的世代研究 研究背景 随着个体化医疗的发展,靶向治疗成为多种癌症治疗的重要手段。在转移性结直肠癌(mCRC)中,恩可拉费尼-西妥昔单抗的组合治疗被认为对预处理BRAF^V600E^突变患者有效。然而,即使是在随机控制的临床试验(如BEACON试验)中证明有效的治疗,也可能因实际应用条件的差异而导致有效性-实效性(efficacy-effectiveness)差距。由于回顾性世代研究可提供对总体患者的更全面认识,此项研究旨在评估临床实践中该药物组合治疗的真实世界有效性。 研究来源 作者: Koen Zwart, Sietske C. M. W. van Nassau, Frederieke H. Van der ...

利用透明机器学习与解释性AI提升胶质瘤预后

胶质瘤预后的透明化机器学习和解释性洞察力应用于解释性人工智能的赋能 学术背景 本研究致力于开发一种可靠的技术,来通过多种机器学习方法及深度学习方法,结合解释性人工智能(XAI,Explainable Artificial Intelligence)技术检测患者是否患有特定类型的脑肿瘤——胶质瘤。胶质瘤(glioma)是起源于胶质细胞的中枢神经系统癌症的一种,具有快速生长和侵袭健康脑组织的特性,常见的治疗方法包括手术、放射治疗、化疗等。通过整合患者数据,包括医疗记录、遗传档案等,机器学习算法能够预测每个个体对不同医疗干预的反应。 论文来源 该论文由Anisha Palkar、Cifha Crecil Dias(IEEE高级会员)、Krishnaraj Chadaga和Niranjana Sam...